天之御船学園の入学式当日、1年7組の教室で花小泉杏（はなこ）、雲雀丘瑠璃（ヒバリ）、久米川牡丹（ぼたん）の3人は、担任の小平先生から自分たちが“負の業”すなわち不幸を背負った生徒であることを告げられる。様々な不幸タイプを背負った1年7組の目標は「幸せ」になること。事態が飲み込めない3人だったが、早速予想外の宿題が出されてしまい…!?

入学式から1週間。1年7組の教室では、面談や身体測定でもそれぞれの負の業が早速発揮され、大騒ぎ。放課後、はなこ・ヒバリ・ぼたんの3人は、自分たちに合った部活を探すため学園の案内ロボット・チモシーと共に部活見学ツアーを行うことに…。

天之御船学園1年7組、今日の特別授業は「すごろく」!? はなこ・ヒバリ・ぼたんの3人はチームを組んでゴールを目指すが、このままでは最下位まっしぐら。一方、同じクラスの萩生響（ヒビキ）は幼馴染の江古田蓮（レン）を連れ、すごろくの勝負に闘志を燃やしていた――。

幸福実技のすごろくの結果を受け、宿題としてそれぞれの「ラッキーアイテム」の写真を撮ることに。はなこ・ヒバリ・ぼたんは休日に集まり宿題を片付けようとするが、待ち合わせから不運の連続。なぜか妙に闘志を燃やすヒビキ、眠たげなレンもついてきて…。果たして無事に宿題を提出できるのか!?

萩生響の不幸…それは極度の方向オンチである事。誰の手も借りずに登校するため、3時間の余裕を持って家を出たヒビキ。「方向オンチ」の不運に見舞われながらも一人懸命に登校する中、思い返すのは今も眩しい幼なじみの姿だった。

今日の幸福実技は「開運オリエンテーリング」！ 引率の助っ人チモシーに連れられて、近くの小山にやってきたはなこたち5人。相変わらずの不幸体質に振り回されながらピクニックを敢行する中で、ヒバリは幸福実技の本当の意味に気づく。

熱を出して早退してしまったはなこ。ヒバリとぼたんは手土産を持ってはなこの家にお見舞いに行く。翌日も欠席のはなこを思い、ヒバリたち4人は「願いを叶える」ある物を作りはじめて…。

期末試験の基本科目を終え、ほっとしたのもつかの間、言い渡された「特別幸福テスト」！ いつか見た体育館地下の施設の更に地下で、バーチャルな試験をする事に!?

7組初めての他クラスとの合同授業。そこで調理実習を見ていた他クラスの担任、鷺宮先生に「意識が低い」と一蹴されてしまうヒバリたち。評価にめげず、授業に参加するが…。

ついに始まった夏休み。ぼたんは7組の皆との楽しい日々を日記に記していた。学校帰りのカラオケ、久米川邸での海水浴…「幸せ」の詰まった夏休みを書き記し、彼女は微笑む。

夏休みの大イベント「林間学校」！ 一見、普通の合宿かと思いきや、今回も立ちはだかる「幸福実技」。突如スタートした「箱庭鬼ごっこ」で、鬼役の巨大チモシーがはなこたちに襲いかかる！

林間学校で突如始まった「箱庭鬼ごっこ」。はなこ・ヒバリ・ぼたん・ヒビキ・レンの『四つ葉チーム』は、自分たちで作った木彫りを探し出し、無事にゴールする事ができるのか!?