人稱非洲之風的塞爾瓦王子來到了日本，而他此行的目的絕不單純，讓他感到煩躁的是自己重要的棋子魯瓦依擅自跑了出去。崇拜著武士的魯瓦依看到了真淵京馬，被捲入糾紛的京馬只能暫時帶著魯瓦依四處閒逛，接觸後京馬發現魯瓦依並不是普通的孩子，到底塞爾瓦打算利用魯瓦依來實現什麼陰謀？

真淵京馬和心愛的妻子四阿屋雅的相識非常戲劇化，在兩人沉入愛河後意外發生了，四阿屋雅患上了全身肌肉逐漸萎縮的絕症，醫生判斷她只有五年的壽命。為了救助自己的戀人真淵京馬打算求助百合崎博士的幫助，為此他加入了特殊部隊。戰爭結束後真淵京馬在病床上醒來，但他的戀人卻因為線圈的暴走而離世。

塞爾瓦被謎之球體奪去意識昏迷不醒，魯瓦伊繼承了塞爾瓦的意志，誓要將他拯救過來。墜入虛無的島嶼蘇醒，魯瓦伊等人陷入危機。情況緊急，京馬和蜜拉火速趕往戰地，途中要經過一段“虛無”，期間蜜拉的線圈機能將全部終止。就在京馬陷入苦痛回憶之時，蜜拉做出了真情的告白……

擋在京馬面前的是Loser，京馬深信Loser是對自己很瞭解的人，在對峙過程中Loser展開了強大的能源盾，他的雙手雙腳都裝備了NUMBERS。京馬向Loser詢問有關這裡的一切，而他並沒有想到自己才是知曉一切的人，神秘的球體突然出現，它將京馬帶入了另一個世界，那裡有京馬熟知的記憶。

蜜拉保護著沉睡中的京馬，當她遭遇危險時京馬醒了過來，京馬剛剛經歷的與其說是惡夢，不如說是真實的記憶。落入陷阱的京馬一行看到的是kk，尤裡已經被kk改造成任人擺佈的傀儡，而京馬也看到了自己曾經的隊友，看過京馬治療記錄的kk認為京馬的記憶被消除了，而京馬丟失的記憶到底是什麼？

在蜜拉的幫助下塞爾瓦等人醒了過來，他們準備朝著光源的所在地阿德拉斯蒂爾進發，那裡存在著神秘線圈“GENESIS”。百合崎博士曾近展示過其可能性，並立即封存的神秘線圈“GENESIS”是塞爾瓦王子此行的目的，在他們歷盡艱辛到達阿德拉斯蒂爾後看到的竟是得到了五塊NUMBERS的Loser。