Lors d’un combat contre un Phantom, Koito attrape un mal à la gorge et perd ses pouvoirs. Haruhiko va alors se rapprocher d’elle et en apprendre plus sur son passé.

Lulu souhaiterait être plus grande et, grâce à une rencontre fortuite, elle va y parvenir. Contrairement à ce qu’elle s’imaginait, cela n’aura pas que des avantages.

Un Phantom voleur de pouvoirs sème la terreur là où il passe. La mère de Haruhiko, qui l’avait abandonné, refait surface au même moment.

L’équipe E va tout tenter pour arrêter Enigma, bien décidée à asservir tous les Phantoms et tous les êtres humains.