警視庁捜査一課SIT第3係の主任で、優れた交渉術を誇る有希子（天海祐希）は、バスジャック立てこもり事件で犯人の説得を試みるが、不測の事態が発生して失敗。有希子は全責任を負わされる形で、異動を命じられる。その異動先とは…反りの合わない管理官・梶山（田中哲司）が統括する緊急事案対応取調班、通称「キントリ」。優秀な取調官を集めた専門チームだった！

河原でモデル・霞智子（佐藤寛子）の死体が見つかり、さっそく被疑者が逮捕された。被疑者は遺体発見現場近くのコンビニエンスストアのトイレで、凶器と思われるスパナを洗っていた杉田英治（林家正蔵）。妻と中学生の娘を持つ電器店の店主だった。ところがこの杉田、捕まってから12時間が経過しても、捜査一課での取り調べに対して一言もしゃべらない。

経済産業省のエリート官僚・俊夫（神尾佑）が自宅の階段から転落死。倒れている俊夫を母・和子（田島令子）が発見した時、階段の上には若く美しい妻・利香（安達祐実）が呆然と座っていた…。俊夫は転落直前、6歳の息子・大地（田中奏生）が使っていた玩具の電車で頭部を殴られていたが、その玩具には利香の指紋が多数付着。利香も自分が夫を殺したと自供する。

衆議院議員の三木本史郎（神保悟志）が贈収賄疑惑で、警視庁に任意同行された。本来は捜査二課が扱うべき事件だが、刑事部長・郷原（草刈正雄）直々の要望で「緊急事案対応取調班（＝キントリ）」が取り調べを担当することに。さっそく中田（大杉漣）、かつて捜査二課にいた小石川（小日向文世）は三木本の取り調べを開始する。ところが…。

公園の池に捨てられたスーツケースの中から、男の絞殺体が見つかった。被害者は詐欺グループの幹部・真木祐介（竹財輝之助）。監物（鈴木浩介）が8年前に取り逃がした指名手配犯だった！それからまもなく、事件当夜にスーツケースを池まで運ぶ男を目撃したという人物が名乗りを上げてくる。目撃者は3人。いずれも主婦で、有希子（天海祐希）が事情聴取をすると…。

ゲーム会社社長・山本（佐戸井けん太）が誘拐され、被疑者としてゲームデザイナー・北原（満島真之介）が逮捕された。北原は一部に熱狂的なファンを持つゲーム『ペガサスアドベンチャー』の開発者。苦労して作り上げた最新作『ペガサスアドベンチャーIV』がお蔵入りになるのを阻止するため、犯行に及んだと思われる。だが、北原は山本の居場所を明かそうとしない…。

3人を殺した罪で元ジャーナリスト・真田（浅野和之）に死刑判決が下った。かつて現職議員の覚せい剤使用疑惑および、暴力団のフロント企業とのつながりを掴んだ真田は、それをネタに議員を恐喝。逆に、命を狙ってきた暴力団の条件を飲むことになった。その条件が元構成員2人とパチンコ店店員・向井を殺すことだったのだ！ところが…。

亡くなった夫・匡（眞島秀和）に関する“人生を変えるような事実”が書いてある…殺人の罪で拘留中の元ジャーナリスト・真田（浅野和之）から、取材手帳の存在を聞かされた有希子（天海祐希）。彼女は真田から聞いた番号に電話をかけ、取材手帳を持っている人物とコンタクトを取る。その人物とは…小さなラーメン店を営む嘉納肇（堀部圭亮）。