高中入学为契机，为了从腻烦了的排球部生活中改变，千夏开始以和可爱的女孩相配的长笛为目标。在音乐讲师的草壁老师相识的同时，也与自己的青梅竹马春太重逢了。和已经加入吹奏乐部的春太一起，千夏去了音乐室，在那里等候的，是一封给草壁老师的神秘的信，黑板上还用血红色的颜料写下了音符，这是一个令人毛骨悚然的谜。

吹奏乐部在校门口支起了摊子，千夏在发传单时被一位冰山少女推搡，这位名叫成岛美代子的少女是吹双簧管的天才，吹奏乐部一直想招揽她。千夏和春太全力说服美代子加入吹奏乐部，然而美代子坚决的拒绝态度让他们吃了闭门羹。春太发现了美代子的异常，美代子抵触演奏的原因究竟是？

在美代子入部的影响下，很多有相关经验的人也加入吹奏乐部。为了不拖大家的后腿，千夏展开长笛特训。某天训练结束后，千夏遇到了帮话剧部打杂的春太和美代子，而擅长萨克斯的马伦也出现在话剧部。春太想把马伦挖到吹奏乐部，为此吹奏乐部与话剧部展开演技对决，名为“退出游戏”的话剧上演。

合奏练习中的春太突然大惊失色，他的姐姐突然出现了，之前居住的公寓要被拆掉，无家可归的春太又不愿意回家。姐姐命令春太尽快找到公寓，而不想让春太住进草壁老师家的千夏也很殷勤的来帮忙。价位合适的公寓只有一所，但这所公寓却有闹鬼的传闻，春太和千夏能够找到这所公寓闹鬼的原因吗？

名侦探春太被长号美少女后藤朱里拜托，去解开“大象的鼻息”之谜。朱里的爷爷为了学习绘画，抛下怀孕的奶奶去了美国，音讯全无。如今爷爷回到日本养病，而以前在美国的事情他全都记不起来了，只告诉朱里他曾经看到过大象的鼻息。朱里一心想让爷爷对奶奶赎罪，但真相却和她想的完全不同。

新学期开始了，吹奏部再次面临招新危机，此时摆在千夏面前的，是音乐室神秘入侵事件。而在吹奏部的即兴合奏中，出现了未知的单簧管乐声，而其演奏者是芹泽直子。芹泽是有名的官富二代，尽管她跟吹奏部势不两立，但千夏还是决定拉拢她入部。春太猜测芹泽把重要的东西落在了音乐室，那究竟是什么东西呢？

新学期，后藤同学等新生的加入让吹奏乐部更加热闹。草壁老师提出新规定，二年级的成员要是成绩达不到平均分，就必须缩短练习时间，于是学渣千夏开始用功读书。千夏一边学习一边听波段数为77.4MHz的广播，无意间发现了春太的“阴谋”。而此时学生会长找到吹奏乐部，以提高社团预算为报酬拜托吹奏乐部解决有关地学研究会的难题。

离预选赛还有两个月，就在千夏一个人研究长笛时，芹泽破天荒说要帮千夏练习，原来她是有事要拜托千夏。芹泽的伯母在寻找初恋情人的过程中，收到了署名为“初恋侍酒师”的朝雾亨发来的挑战书，目的是为了验证初恋的真伪。芹泽等人和伯母来到朝雾所在的初恋研究所，这是一个有关饭团的初恋故事。

草壁老师在练习中突然昏倒，原来他一直在监督藤之咲高中吹奏部的练习，因此劳累过度。藤之咲高中吹奏部的部长和副部长前来道歉，并说出了他们的苦处。堺老师因故自省，因此草壁老师暂时帮堺老师管理藤之咲吹奏部，而他自省的原因竟然没有人知道。教室里的偷拍狂，自称阿斯摩太的学生究竟是谁？

千夏的手基本不会影响演奏，大家也都松了一口气。然而比赛马上就要开始了，却不见春太的踪影。千夏去找春太，却发现和他在一起的还有一只走失的大型藏獒犬，两人决定找到它的主人，但前来认领的却不止一人，一位小女孩和青年男子都自称是狗的主人，面对两人的证言，春太会如何判断？

大家正在练习的时候，突然出现了一位神秘女性，她还和芹泽因为一架钢琴的音准问题打起赌来。没想到这位女性是草壁恩师的孙女山边真琴，而她曾是轰动一时的天才钢琴手，如今却成了口风琴手。恩师留下了价值两千万的贝森朵夫尊贵版钢琴，但钢琴钥匙的下落只有真琴一个人知道……