夜斗是个为了5元的香火钱，连跑腿送货的委托都能接受的无家可归的流浪神。身为他的“神器”的同伴伴音对他“生理上就排斥”，而伴音随后也向夜斗提出辞职，不再担当他的神器。

于是某一天，没了神器的夜斗接了个寻找走失的小猫的委托。在寻找走失的小猫的途中，差点被卡车撞到的夜斗，被一位名叫壹岐日和的少女所救。

因为车祸的关系，日和成了时不时就会灵魂出窍的“半妖”。为了治好这种不方便而危险的体质，日和向夜斗寻求帮助，但夜斗以“没有神器没办法”而拒绝行动。

没办法，日和只好亲自帮忙去找适合成为神器的死灵，但却误打误撞引来了妖怪。夜斗没有神器无法战斗，只好带着日和的魂魄一起逃走。在逃到住宅区的时候，一个如雪般的死灵的身影映入了夜斗的眼睛……

雪音成了夜斗的新神器，但由于待遇很差，雪音对夜斗很是不满。“那就让你见识一下我的力量吧！”说着，夜斗叫来了日和，但结果却只是让她请客。

好不容易来了委托的电话，结果前往的地方居然学问之神“天神大人”——菅原道真的神社。由于天神气场强大，神器众多而美丽，很有神明的风范，让雪音和日和都不禁顶礼膜拜。而反观夜斗那副不正经的轻浮姿态，让人不得不怀疑他到底是不是真正的神。

夜斗和天神一番贫嘴后说起了正事，而这次的委托是因为应考季节很忙，所以天神想让夜斗帮个忙……

即使雪音成为了夜斗的新神器，但夜斗的“经营状况”依旧惨淡。面对没多少长进的夜斗，日和没少数落他，多次提醒他别忘了自己的委托，也别让雪音受苦，“请更振作一点，即使是为了雪音也好。”随即，夜斗突然一本正经地对她说“有几个人想介绍给你认识”。说着，夜斗把他们带到一位名为“小福”的女子家中。这位小福其实是名为“惠比寿小福”的神祇，有一位名为大黑的面相可怕的神器。而夜斗带他们过来，也有着自己的打算。

“其实……夜斗是一个很可怕的神哦”众人闲聊间，夜斗接到了久违的委托，于是夜斗拉上雪音和日和，瞬间移动到委托人所在的地方——某栋高楼的屋顶。但夜斗的出现，好像刚好把坐在屋檐的委托人给撞了下去！

刚刚成为神器的雪音渐渐掌握起神器所特有的能力。然而夜斗的种种表现，让日和坚信夜斗无法成为合格的监护人。因此日和决定把雪音接到自己家里，由自己照顾。

日和让雪音再度像普通人般生活，但这也让雪音感觉到自己已不再是人类了。一次，雪音在陪日和出门买东西的时候，突然顺手取下货架上的滑板“就当借用一下”，“那不就和小偷一样了吗！”被日和严厉地阻止下来。可当日和放回滑板后，雪音却不见了踪影。这时，察觉到雪音异状的夜斗出现在了日和面前，想向她了解雪音的情况。神器如果动了邪念，作为主人的神祇就会被刺伤，代神器受罚。而神器的邪念积累到了一定程度，就会招来“魔”的侵蚀，渐渐堕落为与妖怪无异的恶灵。日和、夜斗都意识到了雪音的情绪波动正在愈演愈烈。

另一方面，一直留意夜斗的动向的毘沙门，也得知夜斗获得了新的神器。

雪音正在被“魔”不断侵蚀，终于，在他经过上次的体育用品店时没抵抗住邪念，仗着自己已是不容易被别人认知到的死灵，把滑板偷了出来。逢魔时刻，夜斗找到了雪音，面对夜斗的诘问，雪音撒谎说滑板是日和给他买的，而这时日和也恰巧赶到，夜斗便让雪音与日和对质。一番犹豫之后，日和还是心软袒护了雪音，说这滑板确是自己买给雪音的。

正当不和的气氛在三人之间蔓延的时候，“最强武神”毘沙门突然地出现在他们面前。她驱使着数把神器，不由分说地向夜斗发起猛攻。

在夜斗仓促应战匆匆逃离之后，被留下来的日和想起了之前夜斗的告诫——“如果我出了什么事的话，就去找他们”。于是日和急忙前往小福和大黑的住处求援。

夜斗与毘沙门一役，以突然赶到的小福用大黑打开了通往黄泉的“风穴”，“时化”骤起妖怪大量涌出而暂靠一段落。

雪音在之后离开日和的家，来到天神的神社，想离开夜斗，让天神把自己收为神器，但被拒绝。雪音依然在邪念的驱使下继续做出刺伤夜斗的举动，夜斗也因身上的“安无”（ヤスミ，也称“恙”，神明因神器的堕落而被不洁的异质感染）而越来越虚弱。

正当雪音一个人跑到公园里时，被夜斗叫做“野良”的少女再次出现在了他的面前。

夜斗与雪音新接到委托，来自于日和同校的学生——荻原学，一个面对同级生的欺凌，只会懦弱地独自流泪而不去行动起来勇敢反抗的孩子。

然而，面对这样的场所——只要是活着的学生每天都能来的的学校，已是死灵的雪音的心中又会生出怎样的感触、掀起怎样的波澜呢？

由于雪音所犯的种种错误，夜斗被“恙”折磨得越来越严重，陷入了极度危险的状态。为了拯救夜斗，必须对让他陷于此境的神器——雪音进行“禊”，让他对自己的种种罪行做出真正的忏悔。然而，要进行“禊”，则需要有三名其他神器……

日和神奇地失去了对夜斗的所有记忆。当夜斗努力帮助她记起时，野良和蠃蚌继续着他们的计划。

夜斗和雪音在最终决战中面对蠃蚌和野良。