Vera a obtenu un entretien pour intégrer la préstigieuse université de Kingston, l'école la plus sélective du pays. Le problème ? Le doyen exige d'elle et de la bande à Scooby-Doo de découvrir pourquoi le fondateur, Elias Kingston, hante les studieux couloirs de l'école !

Fred reçoit une appel de son casse-cou d'ami, Chuck, qui va entraîner l'équipe dans une périlleuse mission de sauvetage dans les cavernes d'une ancienne civilisation.

Le groupe embarque sur le bâteau de croisière d'un ami de Fred en dépit de la profonde inimitié de Vera pour l'eau.

Le groupe visite le site de tournage de la série TV préférée de Scooby afin de lui permettre de rencontrer la chienne-actrice qui joue une détective à l'écran.

Alors que Samy emmène l'équipe dans le stade de ligue mineur de baseball où il a joué enfant, il apprend que ce dernier va être fermé à cause un joueur fantôme qui effraie les fans.

Fred modifie le parcours de la visite au musée d'histoire afin de lui permettre d'amener l'équipe à résoudre un nouveau mystère.

Afin de résoudre le mystère d'un effrayant gardien de cristaux, l'équipe doit pénétrer dans la Caverne aux Cristaux.

La bande d'amis participe à un jeu de rôle annuel chez Lady de Hurlevent intitulé «Monstres et Mystères». Il s'agit cette fois de la reconstitution d'un incident de 1899 avec un Comte-sans-tête qui erre dans le manoir à la recherche d'une nouvelle tête. Chacun endosse son personnage et l'enquête commence. Qui sera le coupable ?

L'équipe se fait passer pour un groupe de musique afin d'enquêter sur une chanteuse spectrale.

Lors d'une visite au restaurateur qui a tout enseigné à Samy et Scooby, l'équipe doit mettre la main à la pâte pour élucider le mystère des attaques du Yéti.

Alors que le groupe visite une usine de robotique, un robot-majordome prends vie et tente de s'attaquer aux humains.

Scooby et ses amis sont arrêtés par l'armée, accusés d'être les extraterrestres qui venaient de s'écraser dans le désert.

Scooby-Doo hérite d'un riche vieil homme qu'il a jadis sauvé. Mais pour obtenir sa part, l'équipe doit passer la nuit dans un terrifiant manoir en compagnie de l'étrange famille du défunt et d'un effrayant fantôme.

Un ptérodactyle terrorise la ville à Noël alors que Daphné tente de fêter son anniversaire et que Fred tente de transformer le mystère en un Noël.

Alors que Fred visite une prison de haute sécurité, il finit par enquêter sur le fantôme d'un détenu évadé qui a fait des ravages dans ses murs.

Le gang va effectuer le premier vol d'essai sur le plus gros avion du monde, l'Air Gigantica. Ils apprennent qu'un gremlin tente de détruire cet avion et le recherchent pendant le vol.

Un sorcier s'empare d'une fabrique de snacks que Scooby et Sammy aiment, donc le gang intervient pour le capturer.

Alors que le gang visite la Nouvelle-Orléans (et que Daphné prétend être un vampire), ils rencontrent une créature du Bayou noir qui empêche tout le monde d'entrer dans les terres marécageuses.

La bande s'attaque aux pistes de ski, bien que Daphné soit plus concentrée sur la vengeance de Fred. Leur plaisir est bientôt interrompu par l'apparition d'un monstre bonhomme de neige maléfique, désireux de faire fuir tous les intrus de sa montagne.

La bande visite une ferme hantée par un épouvantail fantôme. Fred veut impressionner la fille du fermier avec ses compétences en matière de résolution de mystère, mais pour une raison quelconque, une partie du mystère est manquante.

Participant au mariage de deux amis proches, le témoin Sammy et la demoiselle d'honneur Daphné tentent de sauver le jour parfait de la ruine d'une mariée fantôme.

Lorsque le gang assiste à un festival du Day of the Dead au Mexique, Fred pense qu'il peut devenir une légende s'il capture le fantôme du criminel El Bandito pour les habitants de la ville.

Scooby et ses amis débarquent dans un parc d'attraction désert. Le propriétaire est victime d'une légende qui effraie les clients : celle du clown Maboul, jadis clown du parc, qui perdit la boule et se transforma en clown diabolique. Fred entraîne le reste de la bande à percer ce mystère. Mais personne n'est intéressé. Il commence son enquête...

Le gang aide les campeurs qui sont terrorisés par les fantômes vikings, mais Daphné a son propre plan pour gagner plus d'écussons Ranger.

Fred est jugé pour s'être fait passer pour un mutant déchaîné et Daphné lui sert d'avocat.