스필반과 다이아나는 지구로 오면서 그란나스카의 냉동 수면 시스템으로 성인이 되어 인간을 초월한 존재로 변신해 지구를 지키게 된다.

어린 스필반과 다이아나가 겨우 둘이서만 지구를 와야 하는 이유는 무엇일까? 스필반과 다이아나의 지난 과거와 두 사람의 목표가 밝혀진다.

탈주에 실패한 헬렌은 와라 기성으로 끌려와 닥터바이오의 손에 헬바이라로 개조 당한다.

스필반을 추격하는 헬바이라지만 그녀에겐 일정량의 에너지를 쓰게되면 헬렌으로 돌아온다는 약점이 있었다. 정체를 모른채 헬바이라와 싸우는 스필반의 안타까운 이야기.

전투기계인 메가퓨터가 실행한 제로원 작전은 전 세계의 컴퓨터를 지배하는 것이었다. 마음만 먹으면 세계정복은 쉽게 가능한 와라의 실력을 보여준다.

닥터바이오가 만들어낸 전투생물이 첫 등장. 지금까지의 기계인과는 전혀 다른 방법으로 스필반을 난전으로 몰아넣는다.

수호신 와라에게 물을 바치는 전략이 시작되며 지구의 바다나 물고기가 점멸해버릴 위기에 봉착한다.

스필반과 다이아나의 연계공격에 꿈쩍도 못하던 와라는 두 사람을 나눌 작전을 내놓는다. 상처입은 다이아나를 구해준 건 헬렌이지만 그녀는 동생과의 재회를 거절한다.

다이아나를 구해준 헬렌은 여왕 판도라의 분노를 사게되어 또다시 헬바이라로 변신당하게 된다. 어렴풋이 스필반과 다이아나는 헬바이라의 정체가 헬렌이 아닐까라고 생각하기 시작한다.

헬렌이 헬바이라라고 한들 그건 어디까지나 와라에게 이용당하고 있는것일거라 추측하는 다이아나와 그런 그녀에게 위로받는 스필반.

스필반의 전투데이터를 분석의 분석을 거듭해 만들어낸 강적 메카 건맨이 등장. 지금까지의 전투기계인과는 달리 말도 유창하게 구사하는 밝은 성격의 유례없던 적이었다.

다이고로가 경영하는 발명샵의 단골 사카자키 마사루의 가족을 덮치는 와라 제국의 달콤한 함정. 마사루의 부모님, 형, 누나가 어떤 욕심이던 이루어주는 미래하우스의 포로가 되어버린다.

무라타가 만들어낸 해파리와 문어를 합성한 전투생물은 스필반의 상대는 안되지만 전투생물 와타쟈의 파워를 올리는 존재가 된다.

요코선생님과 유치원생들을 인질로 잡은 와라는 호버리안을 강탈해서 크린스타 에너지를 손에 넣으려 계획한다.

다이아나는 히죽거리는 킹크론들을 박력넘치는 엉덩방아 공격으로 무찌르는 대활약을 보인다.

수호신 와라는 후지미마을 동굴에 있는 지저호수의 물이 마음에 들어 여기를 기거할 계획을 세운다.

게임 존이라고 불리는 버추얼공간으로 꾀어내어진 죠 요스케는 결정을 하지도 못하고 공간을 넘나드는 어지러울 정도의 공격을 당한다.

요스케에게 감사인사를 한 뒤 무념의 마음을 안고 호수에 잠겨가는 카린. 그쓸쓸한 표정에 가슴이 아프다.

전투기계인 덴쟈라가 격투전은 못하는 만큼 괴력 휴머노이드인 삼손이 강적으로써의 면모를 발휘한다.

로봇공학의 권위 사카타박사가 개발한 인조인간은 인간이랑 구분이 안될 정도의 인공피부로 되어있다. 이것을 노리는 와라는 부인 나츠코를 잡아 사카타에게 인조인간 제작을 강요한다.

아버지라는 사실을 도저히 믿을 수 없는 스필반은 악마의 과학자에게 분노를 퍼붓고 어떻게든 딸을 지켜야 한다는 사명뿐인 바이오. 두 사람의 싸움을 필사적으로 막으려 절규하는 헬렌까지 헬바이라가 되어버린다.

락그룹 악마당의 멤버를 시작으로 아주 평범한 젊은이들이 와라에게 조종당해 죠 요스케의 목숨을 노린다.

운석은 이상기후로 전세계의 맑은 물을 모으는 능력이 있다. 와라는 박사를 이용하여 운석을 전부 끌어모으려한다.

서력 2201년의 미래사회. 과거 스필반의 활약으로 이미 망해버린 와라의 자손 길로틴황제는 기묘한 생쥐 포스의 인도에 따라 1986년의 도쿄로 오게 된다.

아크임펄스를 발동한 직후는 겨우 서있을 정도의 체력밖엔 남지않을 스필반을 말살하려는 작전이다. 스필반은 최대의 위기를 아슬아슬하게 피하지만 목적을 위해 수단을 가리지 않는 길로틴의 무시무시함을 통감한다.

누나를 베어버렸다는 죄책감에 절망하는 스필반의 앞에 다시 모습을 나타내는 헬렌, 하지만, 그 헬렌까지도 가짜였다.

영원의 젊음을 누리는 포코스성인의 파란 혈액을 노리는 와라제국. 포코스성 극소수의 생존자인 에길 과 로미는 지구로 도망치나, 에길은 와라에게 잡혀버린다.

판도라여왕은 임신 태교용이라며 CD와 CD플레이어를 주고 최면 상태를 만들어 버린다. 이는 어머니로 부터 자식에게까지 전 인류를 대대손손 게으름뱅이로 만들려는 23세기까지 바라본 와라의 장대한 계획이었다.

길로틴은 스필반과 다이아나의 콤비네이션을 끊어내기 위한 계획을 실행에 옮겨 타겟을 다이아나 한명으로 정한다. 인질 작전으로 죠 요스케를 꾀어내고 그 틈에 헬렌이 다이아나에게 접근하도록 한다.

다이아나를 붙잡은 길로틴은 또 다시 헬렌을 사용하여 스필반 말살계획을 세운다. 하지만 헬렌을 최면 상태로 만들어 조종하려던 작전은 닥터바이오의 헬렌을 지키고자 하는 마음에 저지되어 버린다.

도쿄 땅 깊숙이 태양계 메가로폴리스의 지령센터를 짓기 위해 고급 주택가의 점거를 꾀하는 와라. 뉴 전투기계인 앤톰이 콘크리트를 파먹고 뒤로는 부동산 업자 쿠로가네 가 차례대로 주민들로부터 집, 토지를 사들인다.

길로틴 황제가 합성한 바이오식물은 인간을 식물로 바꿔버리는 무시무시한 것이었다. 뉴 전투기계인 츠타라가 만들어낸 아름다운 꽃에 손을 댄 사람들은 차례대로 식물이 되어버리지만 그걸 스필반이 용서할 리가 없었다.

바이크부대를 찾으러 라이더슈트 차림으로 활약하는 헬렌 과 다이아나. 와라 책임이래 처음으로 길로틴이 전선에 나와 작전지휘를 선두한다.

와라가 만든 신전력 요우키가 출현하여 스필반과의 싸움이 점점 가혹하게 될 것이라는 예견을 한다. 신년을 맞아 첫 참배를 드리러 가는 요스케들은 와라와 싸움의 결의를 다시끔 마음에 새긴다.

요우키는 인간계에 나타나 사람들을 수상한 냄새로 조종해 악마로 변하게 한다. 이렇게 비밀결사 무무무가 결성되었다.

국회의원 쿠니마츠가 마을사람들을 선동하나 선량한 하치스케 할아버지의 활약에 의해 스필반의 활약으로 계획을 저지당한다.

유전자 공학의 권위인 호츠키 부부는 와라에게 붙잡혀 뉴 전투기계인 브렌다의 체내에 그 두뇌가 심어지고 만다. 남은 딸 유우코는 부모님을 살리고 싶다는 일념으로 브렌다의 방패가 되어 스필반을 막는다.

요우키는 와라성 접수계획을 실행으로 옮겨 쓰레기더미 속에서 요우키 전투기계인을 만들어내어 와라에게 반란을 일으키나 여왕 판도라는 이미 다 꿰뚫어 보고 있었다.

여왕 판도라는 지구 침략은 뒤로 미루고 일단 스필반 말살을 최우선으로 할 것으로 정해 뉴 전투기계인 쿠마손을 보낸다.

실패의 연속인 탓에 여왕의 눈밖에 나버린 데스제로 장군은 결혼을 하여 가정이 생기면 자신도 강해질것이라 생각해 뉴 전투기계인 무브맨을 써서 어째서인지 다이아나를 신부로 정했다.

폭포수를 맞고 반성을 하고 온 데스제로 장군은 여왕 판도라에게서 도쿄 대화염작전의 지휘를 명 받는다. 뉴전투기계인 브리자가 도쿄의 지하 하수도관을 동결시키러 간다. 여왕은 포상으로 궁극회로를 데스제로에게 하사한다.

클린에너지 전력 방출로 위기는 피한 스필반이나, 그 대가로 클린성으로 돌아갈 에너지를 잃고 만다. 드디어 와라성으로 돌입하여 최후의 결전을 벌이는 스필반, 다이아나, 헬렌. 그곳엔 벤의 모습으로 돌아온 닥터 바이오가 기다리고 있었다.

와라성에서의 스필반, 다이아나, 헬렌과 여왕 판도라의 최종결전이 이어진다. 그 와중에, 벤박사는 닥터 바이오로 개조되고 난 뒤 끝없이 저질러온 악행, 스스로의 죄를 모두 떠올리고 만다.