La vita della studentessa d'arte Clary Fray cambia radicalmente quando scopre di essere una Shadowhunter, in un mondo nascosto sull'orlo di una guerra.

Determinati a recuperare i ricordi persi, Clary e i nuovi alleati Shadowhunters arruolano i Fratelli Silenti.

Clary chiede aiuto al misterioso mago Magnus Bane per evocare il demone che l'ha privata dei ricordi, mentre un segreto relativo ad Alec viene a galla.

La vita di Luke è appesa a un filo e rivela a Clary la storia segreta che lo lega a Jocelyn e Valentine.

Clary s'interroga sul riportare in vita Simon come vampiro. Intanto all'Istituto, l'arrivo di Lydia Branwell, inviata del Clave, spinge Alec a sacrificarsi.

Clary attraversa un portale per raggiungere Valentine e si ritrova in una tranquilla realtà alternativa in cui i cacciatori di demoni non hanno più ragione di esistere.

Per salvare Jocelyn da Valentine, Clary e Jace si alleano con il padre di quest'ultimo, a lungo presunto morto. La ragazza, però, nutre dei sospetti sull'uomo.

Alec è alle prese con i suoi veri sentimenti per Magnus. Clary e Jace affrontano una sorprendente rivelazione, mentre cercano di rompere l'incantesimo di Jocelyn.

Nel tentativo di risvegliare la madre, Clary chiede aiuto a un vecchio nemico. Intanto Jace deve vedersela con il tradimento di Hodge, dando inizio a una lotta intestina.

Jocelyn si ricongiunge alla famiglia, mentre Clary e il nuovo leader dell'Istituto non sono d'accordo se salvare Jace da Valentine, che rivela un oscuro segreto.

Valentine escogita un nuovo modo per conquistare Jace, mentre Simon chiede aiuto a Magnus. Clary fatica a destreggiarsi tra la vita attuale e quelle passate.

Alec è in pericolo di vita. Jace corre a salvare il suo parabatai. Le forze del Mondo Invisibile e di quello dei Mondani insorgono contro i guerrieri.

Jace rimane prigioniero nella Città di ossa e Clary si lancia alla caccia di un demone entrato nell'Istituto. Il Clave ordina un cambiamento radicale per Jocelyn.

Mentre il devastante attacco all’Istituto lascia gli Shadowhunters scossi e feriti, Clary ricorre a misure estreme per capovolgere una situazione tragica.