Shirayuki est une pharmacienne disposant d’une particularité physique singulière : ses cheveux sont rouge pomme. Cette singularité va lui attirer les faveurs du prince Raji, qui souhaite faire d’elle sa concubine. Mais la jeune fille ne l’entend pas de cette oreille et s’enfuit du royaume…

Désormais habitante de Wistar, la capitale du royaume de Clariness, Shirayuki se met en quête d’un travail. Lors de cette recherche, elle apprend qu’il existe un examen permettant d’entrer au palais de Wistar en tant qu’apprenti pharmacien. Pour le besoin de ses études, elle décide de se rendre à la montagne de Koto, mais sa chevelure rouge va lui attirer des ennuis…

Appelée par Kiki et Mitsuhide, Shirayuki se rend au palais pour passer un peu de temps avec un Zen accaparé par ses obligations. La jeune fille à la chevelure rouge va bientôt découvrir que sa présence au palais ne fait pas que des heureux…

Pour Shirayuki, c’est le grand jour : elle va passer un examen qui, en cas de succès, lui ouvrira les portes du palais en tant qu’apprentie pharmacienne de la cour. La présence malencontreuse de Zen durant l’épreuve pourrait cependant la conduire à l’échec…

Shirayuki est envoyée à Laxd pour acheter des remèdes. Elle est en partie accompagnée par Zen et ses fidèles compagnons, qui eux font route vers un fort pour une inspection. Arrivés sur les lieux, le jeune Shuka leur apprend que tous les soldats du fort sont atteints de troubles physiques d’origine inconnue…

De retour de Laxd, Shirayuki se voit accorder un jour de repos, tandis que Zen vaque à ses occupations princières. Ce dernier est plus tard convoqué par Izana, son frère aîné. Le premier prince de Clariness ne tarde pas à critiquer son manque de fermeté vis-à-vis des soldats du fort…

Shirayuki ressort troublée de son entretien avec Izana. Elle retrouve Zen, qui va lui en apprendre un peu plus sur son frère. Le prince lui parle également d’une phrase malencontreusement prononcée risquant de quelque peu bouleverser sa vie…

En raison de la convoitise suscitée par la rumeur de leurs fiançailles, Zen décide d’envoyer Obi auprès de Shirayuki pour quelque temps. Un peu plus tard, un vieux souvenir sera ravivé…

Obi est chargé par Garaku de veiller sur une Shirayuki encore sous l’emprise de l’alcool. Entre la jeune fille bien décidée à entreprendre un voyage et l'intérêt qu’elle suscite, il aura fort à faire…

Shirayuki fait la connaissance de Kiharu, une jeune fille capable de contrôler un oiseau à l’aide de son sifflet. Originaire de l’île de Yuris, elle est venue à Clariness pour résoudre un conflit l’opposant au vicomte Brekka. Zen aura la tâche de trouver une issue à leur différend.

Shirayuki ignore comment gérer la situation engendrée par le baiser de Zen. Tandis que Mitsuhide et les autres se doutent de quelque chose, le second prince de Clariness se rend à Yuris avec Kiharu pour faire part de son intention d’utiliser les oiseaux de l'île comme mode de communication.

Shirayuki découvre « la journée d’accès au palais », une occasion pour les citoyens de visiter certaines zones de l’édifice royal. Pour la jeune fille, ce jour sera marqué par de doux moments et une expérience atypique…

Zen et Shirayuki, qui entretiennent désormais une relation amoureuse, ont leur premier rendez-vous officiel dans l'une des villes de Clarines. Au cours de leur rendez-vous, des détails concernant l'histoire de la relation entre Mitsuhide et Kiki sont révélés, tandis que certains faits concernant l'enfance du Prince Raji sont également explorés.

Shirayuki est occupée à nettoyer l'aile médicale lorsque Mihaya rend visite au château, et elle reçoit une invitation inattendue de Tanbarun.

Tandis que Shirayuki apprend l’étiquette pour faire bonne figure lors de la réception à Tanbarun, Obi cherche des informations sur Kazuki. De son côté, Zen ne semble pas ravi de voir la jeune fille aux cheveux rouges partir...

De retour à Tanbarun, Shirayuki passe du temps en compagnie du prince Raji. Ce dernier veut conduire la jeune fille jusqu’à une serre, mais l’itinéraire emprunté ne sera pas de tout repos.

Mihaya informe Zen que Kazuki est au courant de la présence de Shirayuki à Tanbarun. De son côté, la jeune fille continue de passer du temps auprès d'un Raji de moins en moins insensible à son égard.

Zen débarque à Tanbarun et apprend que Shirayuki a été kidnappée. Il obtient l’accord du roi de Tanbarun pour participer aux recherches. De son côté, Obi est déjà sur la trace des ravisseurs.

Prisonniers sur le navire des Griffes de la Mer, Shirayuki et Kazuki tentent de s’échapper. De son côté, Zen et les autres partent rendre visite aux Lions des montagnes, dans l’espoir de retrouver la jeune fille.

Tandis que Zen et les autres se rendent dans le repaire des Griffes de la mer, Raji poursuit les pirates en compagnie des navires marchands. Cette aventure marine s'annonce loin d’être de tout repos...

Aidés par les Lions des montagnes, Zen et ses compagnons sont parvenus à secourir Shirayuki et Kazuki. De retour au village, Mukaze, le père de Shirayuki, va raconter au prince une partie de sa vie.

Surpris par la pluie, Shirayuki et ses amis sont contraints de descendre dans une auberge. Ce sera pour eux l’occasion de se détendre, et pour Obi de retrouver une vieille connaissance.

De retour à Clariness, Zen se voit imposer des entrevues avec un mariage en ligne de mire. Il choisit de voir une seule des prétendantes dont le nom figure sur une liste, un choix qui a de quoi étonner…

Zen souffre de torticolis suite à un accident. Mitsuhide part voir Garaku pour lui expliquer la situation. Sur place, il inhale malencontreusement les effluves d'une essence aux propriétés hypnotiques…

Deux messagers de Tanbarun arrivent au palais de Clariness. Le premier est Mihaya, récompensé pour avoir grandement contribué à la capture des Griffes de la mer. Le second n’est autre que Sakaki. Il est là pour offrir un cadeau inattendu à Shirayuki…