為了與犯罪組織古萊姆（クライム）對抗,國際科學特搜隊的鯨井大助決定組織一隊改造人部隊，最後他找到接受手術的四人，分別是：櫻井五郎、東竜、嘉琳·水木（カレン水木）及大地文太。四人背負著改造人失去肉體的痛苦，與古萊姆周旋。

後來因古萊姆引入了侵略機械人，把目標由犯罪轉變成征服地球。因此皇牌突擊隊亦加入了行動隊長Big 1（ビッグワン），令戰況更加白熱化。

L'organisation Crime, dirigée par le malfaisant Iron Claw, entend dominer le monde. Mais le Commander Daisuke Kujirai décide de former une équipe chargée de faire obstacle à la concrétisation de ce projet.

Cyborg warriors were created by the Special Science Investigation Squad to bear nuclear, gravitational, magnetic, and electrical forces. They fight the crime empire known as "Crime".

Uma organização mundial chamada ISSIS, que possui filiais pelo mundo todo com sede em Tóquio é responsável pela captura de terroristas e criminosos, e é criadora da Tropa de Choque JAKQ. Essa criação se deve ao fato da terra ter sido invadida por uma organização criminosa. ISSIS significa Esquadrão Científico Especial Internacional de Investigação, que reuniu quatro jovens para formarem um grupo de combate juntamente com a ajuda de ciborgues. Foram então escolhidos quatro jovens para ser o os JAKQ, mas para isso, eles precisavam de poderes especiais, o que os levou a entrar em cápsulas que lhes conferiam super poderes para lutar. Apesar de cilíndricas, essas cápsulas eram chamadas de caixas. No comando estava o Comandante Kujirai Daisuke (Joker), que logo foi sustituído por Banba Sohkichi, sendo ele o quinto e ultimo JAKQ a entrar no grupo.