In Quantico führt eine dringende disziplinarische Anhörung dazu, dass tiefe Geheimnisse verschüttet werden, während Alex in Zukunft heimlich mit ihrem Team zusammenarbeitet, um den echten Bomber zu finden, bevor ihre Zeit abgelaufen ist.

Die Terroristen, die für den Bombenanschlag auf die Grand Central Station verantwortlich sind, offenbaren sich schließlich, aber statt Antworten bleiben mehr Fragen. Zurück in Quantico erhalten die Rekruten ein paar wohlverdiente freie Tage für die Feiertage, aber nicht jeder ist oh so fröhlich, wenn Geheimnisse enthüllt werden und Linien und Unschärfen.

Alex befindet sich mitten in einer Anhörung im Kongress, um über die terroristischen Bombenanschläge auszusagen. Die überzeugte Elias handelte nicht allein, sie ist entschlossen, Antworten und die Wahrheit zu finden. Zurück in Quantico schließt sich eine neue Gruppe von NATS Alex und ihren Klassenkameraden an, was zu Spannungen und Konkurrenz zwischen den Gruppen von Auszubildenden führt.

Diese Woche lernen die NATS, wie man Informationen von vertraulichen Informanten bezieht, aber wenn sie ihre Fähigkeiten in der realen Welt testen, erkennen sie bald, dass es nicht so einfach ist, ein Agent zu sein, wie es scheint. In der Zwischenzeit befinden sich Alex und ein anderer Agent in einer Lebens- oder Todeslage, wenn sie gezwungen sind, geheime Informationen zu liefern, die zu tödlichen Folgen führen könnten.

Eine Terrorzelle versucht, Quantico zu infiltrieren und zwingt Miranda und Liam, einen tödlichen Preis zu zahlen. Während Alex in Zukunft weiterhin Anweisungen vom Terroristen erhält - nur diesmal steht das Leben von Claire Haas auf dem Spiel.

In Quantico erhalten die NATS eine Trainingsübung, die für Shelby zu nah an der Heimat liegt. In der Zukunft findet Alex in Hannah einen unwahrscheinlichen Verbündeten, während sie weiterhin versucht, den Terroristen daran zu hindern, wieder zuzuschlagen.

In Quantico ist es die aktuelle Aufgabe des NATS, etwas über Menschenhandel zu erfahren, wenn Liam und Miranda sie herausfordern, die US-amerikanisch-kanadische Grenze ohne Reisepass zu überqueren. In der Zwischenzeit hilft Simon Alex weiterhin, den Terroristen zu finden, aber das setzt sein eigenes Leben in große Gefahr.

Bei Quantico untersuchen die NATs den Hintergrund des anderen, um festzustellen, wer eine hochrangige Sicherheitsüberprüfung erhält, und dabei lernen Alex, Shelby und Iris einige überraschende Wahrheiten über Drew, Will und Caleb. In der Zwischenzeit kontaktiert Alex Claire Haas, um ihre vermissten Freunde zu finden, und ist schockiert, als sie herausfindet, was mit Cale passiert ist.

Mit nur wenigen Wochen bis zum Abschluss werden die NATS in verschiedene Außenstellen geschickt, wo Alex und Ryan gemeinsam an einem Fall arbeiten. In der Zwischenzeit, in der Zukunft, nimmt Shelby und Caleb's Beziehung eine Wendung, und Alex weiß nicht, wem sie vertrauen kann, wenn sie neue Informationen über den Mann entdeckt, den sie liebt.

Die NATS sind begeistert, dass der Abschluss nahe ist, da sie sich darauf vorbereiten, Quantico zu verlassen und sich auf den Weg in die reale Welt für ihre neuen Aufgaben zu machen. In Zukunft erfährt Alex, dass jemand, der ihr in Quantico wichtig war, nicht der ist, der sie zu sein schien, da sie sich im Herzen eines weiteren möglichen Angriffs befindet.

Es ist Abschlusstag für die NATS von Quantico, während Alex und ihr Team in Zukunft gegen den Terroristen antreten werden.