在未来世界，躲避神秘敌人的特兰克斯来到了布尔玛的研究所，此时布尔玛花了一年的时间制造了时光机单程一次的能源，在目睹了布尔玛被神秘敌人杀死的之后特兰克斯带着珍贵的能源去往胶囊公司旧址准备利用时空机回到现代，不料神秘敌人一路追来，危急中为了掩护特兰克斯小舞牺牲了自己，而神秘敌人在火光下露出的脸居然是...

目睹小舞的牺牲，愤怒的特兰克斯以超级赛亚人的形态与长相酷似悟空的敌人拼命，不敌后利用空档坐上时空机回到过去，在现代，未来特兰克斯在醒来后看到悟空的第一眼居然是要攻击悟空！

当大特兰克斯情绪稳定后向众人解释的时候，维斯警告布尔玛人类使用操控时间的手段改变历史是宇宙重罪，大特兰克斯向众人说希望悟空和贝吉塔能一起去未来把黑悟空消除，于是悟空和大特兰克斯交手想要了解一下黑悟空的实力，没想到未来的黑悟空使用手上的时空戒指打通了两个时空后居然追到了这个时空里。

认出这个时空的黑悟空意识到自己穿越回到了过去，于是和悟空开始较量，结果是和变成超级赛亚人2的悟空不相上下，接下来黑悟空由于时空洞口不稳定的原因被拉回原有时空，离开前得知了时空机的的存在并毁掉了特兰克斯坐来的时空机。与此同时维斯发现了黑悟空手上带有只有界王神才有的时光戒指。

为了准备回到未来解决黑悟空，悟空和贝吉塔分别去做个人修炼，布尔玛则准备修复多年前沙鲁坐来的时空机，大特兰克斯向还是儿童状态的小舞解释在未来她是如何领导反抗军抵抗黑悟空的，没想到小特兰克斯看到小舞听的入神反而醋意大生.同时，比鲁斯想到黑悟空的气很像他认识的一个人。

被噩梦惊醒的大特兰克斯被布尔玛告知一天后就能出发回到未来，前去探访悟饭的大特兰克斯意识到悟饭已经毫无打败沙鲁时的战斗欲望，看到悟饭一家人和平幸福的生活更意识到自己和黑悟空战斗的意思，在和悟饭一家吃完晚饭后大特兰克斯没有告诉悟饭黑悟空的事情就回去了。与此同时悟空跟着比鲁斯来到第10宇宙寻找那个气息和黑悟空一样的人。

原来他们要找的人就是此时在第10宇宙担任实习界王神的界王扎马斯，以淳朴之心为界王神格瓦斯泡茶的扎马斯质疑身为界王神要守望不断重复丑陋错误的种族这种使命。在不情愿的和悟空切磋之后，扎马斯更加视悟空等人类为危害。

悟空回来后告知众人扎马斯的情况，贝吉塔则带大特兰克斯去修炼，不满大特兰克斯消极的只想将战斗假手与悟空和自己。界王神格瓦斯向扎马斯展示千年变化的巴巴利星。同时，全王要召见悟空。

在看到千年之后的巴巴利人依然暴劣成性后，扎马斯气愤之下出手杀了一个巴巴利人，结果被界王神格瓦斯教训一顿。不满的扎马斯总结出人类皆恶的结果。得知全王要召见悟空，比鲁斯紧张的再三告诫悟空一定不要惹怒全王，同样担心悟空会失礼的还有全王宫殿的大神官，悟空见到全王后觉得全王这里太冷清了便随口答应等手头急事办完了给全王找个更合适的朋友来，顺便收下了能够随时召唤全王的按钮。

大特兰克斯带着悟空与贝吉塔回到未来，却被误会悟空的小舞攻击，原来小舞当时并没有死，在抵抗军据点，悟空还见到了一直大难不死的弥次郎兵卫。在黑悟空出现后贝吉塔变成超级赛亚人蓝与黑悟空激斗，被打的不能还手的黑悟空在融汇了悟空的力量后变成了超级赛亚人玫瑰，将局势逆转，瞬间刺穿贝吉塔后对战同样是超级赛亚人蓝的悟空。

突然出现的扎马斯令战局更加困难，悟空被黑悟空缠住的同时特兰克斯艰难的对付有着不死之身的扎马斯，特兰克斯想尽方法依然不能让这个神的身体受伤。危险之时弥次郎兵卫和小舞救走了三人并送回了过去。同时，过去的扎马斯看到了希特和悟空对战的影像并知道了超级龙珠的事，便动身去找祖诺询问详情。

扎马斯用武力强迫祖诺说出超级龙珠的讯息，同时知道了悟空的来龙去脉。比鲁斯得知此事后推测扎马斯用超级龙珠制造了黑悟空作为自己的助手，同时让神龙给了自己不死之身，并怀疑扎马斯为了抢时光戒指杀了自己的师傅界王神格瓦斯。为了提醒格瓦斯，悟空和比鲁斯出发去第10宇宙前往界王神格瓦斯处。

看到格瓦斯和扎马斯这里一切正常，比鲁斯告辞离去在别处观察格瓦斯处，结果扎马斯果然对格瓦斯下手了，维斯发动时间倒转回到了扎马斯动手前，众人现身揭穿了扎马斯的企图，承认自己心思的扎马斯被比鲁斯破坏的飞灰湮灭，这个时空的扎马斯已经消失。而未来的黑悟空正在和扎马斯商量0人类计划。

质疑未来是否会改变的大特兰克斯一直无精打采，众人回到未来后悟空指出扎马斯是用了超级龙珠求来的不死之身和悟空的复制人，结果黑悟空却说自己就是扎马斯，是用超级龙珠跟悟空交换了身体的扎马斯。

曾在过去被悟空打败过并杀害格瓦斯抢夺时光戒指并通过超级龙珠和悟空互换身体的扎马斯黑悟空和本来就存在于未来世界的扎马斯联手起来要实行消灭一切人类的0人类计划，同时也指责特兰克斯操作时间改变过去从而制造了更多的平行时空。

被黑悟空和扎马斯的理论气炸的特兰克斯突破极限，决心牺牲自己也要守护未来世界，他一边尽力拼命缠住扎马斯和黑悟空，一边让布尔玛带悟空和贝吉塔回到过去。在过去，知情后短笛提出可以用魔封波对付扎马斯，悟空出发去找龟仙人学习魔封波，同时第10宇宙的界王神格瓦斯在知道这件事后也希望能做点什么。

再次修炼完毕的贝吉塔和学会了魔封波的悟空回到未来挑战黑悟空和扎马斯，此时界王神格瓦斯使用时光戒指也来到了战场，修炼过后的贝吉塔把黑悟空打得节节败退，更直言黑悟空只是玷污了赛亚人细胞的冒牌货。

通过被暴打而领会到贝吉塔是靠愤怒来提升实力的黑悟空也激发自己对人类和其他神的愤怒，悟空好不容易使出魔封波却发现咒符拿错了而功亏一篑，黑悟空和扎马斯使用波特拉耳环合体。

合体扎马斯使用制裁之刃对众人进行无差别攻击，更造成地下崩塌导致残余抵抗军们四散逃命。特兰克斯和贝吉塔父子二人同时使用加利克炮对抗合体扎马斯的神圣之逆鳞，但不死之身的扎马斯瞬间恢复后将掩护特兰克斯的贝吉塔重伤，剩下悟空拼全力使用龟派气功抵抗神圣之逆鳞。

在气功比拼中落败的合体扎马斯被拼命使用界王拳的悟空打的半边身体开始崩溃，界王神格瓦斯说原因是黑悟空并不是不死之身，疯狂爆发全力的合体扎马斯强行止住分裂，悟空和贝吉塔只好用耳环合体成贝吉特，变成超级赛亚人蓝的贝吉特轻易打的合体扎马斯不能招架，不料关键时刻合体时间结束，幸好特兰克斯使用之前断掉的剑集中了人类的元气行成了元气剑将合体扎马斯一剑两断。

扎马斯身体粉碎后众人以为结束了，不料扎马斯反而化作精神状态企图和宇宙合为一体，正在大家绝望的时候，悟空想到全王赠送的召唤按钮，召唤出来未来的全王，请求未来全王消灭扎马斯，结果这个未来的时空宇宙被全王整个消灭掉了，悟空把召唤出来的未来全王带给现在全王做朋友，此举让大神官很满意。当晚维斯带大特兰克斯去到另一个未来时空去收拾未发动的扎马斯。

布尔玛想偷偷修复大特兰克斯乘坐的时光机，结果发现缺少零件，就像通过神龙许愿走捷径，神龙只能实现2个愿望，结果18号、龟仙人、乌龙、皮拉夫一伙、悟天和小特兰克斯也在打神龙愿望的主意。

博士把阿拉蕾留在家里，自己去西部城市参加布尔玛家出席的世界发明展。没想到老对手马列斯博士的鬼魂现身捣乱，撒旦请求贝吉塔控制场面结果贝吉塔被阿拉蕾打的无处撒气。

借机来到第7宇宙大吃大喝的象帕提出和比鲁斯的棒球比赛，结果乐平带领第7宇宙对战第6宇宙。

悟空最近经常过于关心自己周围的动静，琪琪不禁担心他，跟维斯一起修炼的贝吉塔也感受到悟空正在作某种特训，结果悟空对儿子说有杀手要来杀他。第6宇宙的希特凭借闪时神不知鬼不觉的闯入某黑帮本部，在将首领困在时间潮流中接到了暗杀悟空的委托，悟空察觉希特动手后朝天空发了一枚气功弹，而希特终于对悟空动手用闪时配合隔空杀拳将悟空杀死。

短笛面对没气的悟空束手无策，结果悟空被自己提前打出的气功弹反弹到身上后唤醒了自己，于是相约希特再战一场，破解了希特无形无声杀拳的悟空仍然无法达到希特，原来希特的闪时可以储存时间来制造出一个只有他能移动而外界无法碰触的平行时空，察觉到这一点的悟空全力运气将希特制造的时间潮流空间震破。

撒旦代理悟饭一家参观自己参演电影的拍摄，题材居然是赛亚超人，悟饭临时充当替身演员结果获得一致好评，这令主演很嫉妒。

制止了危险的悟饭听吉克说了追捕棉花虫的事情，结果主演恰好被棉花虫上身，捉走了小潘，悟饭身穿赛亚超人的戏服将棉花虫从主演身上打出来后电影也拍摄完成。

被琪琪同意可以在耕田的时候顺便修炼，悟空和悟饭用超级赛亚人形态对打将田地搞得一塌糊涂。悟空想到可以找克林作为对手，两人不约而同前往龟仙人处，龟仙人安排两人去远方的小岛上寻找极乐草。

克林面对曾经杀死过他的敌人吓得抱头鼠窜，深感到与悟空的差距让克林不仅想放弃修炼。之后被巨型幻影包围的克林意识到它们是自己对过去恐惧的投影，领悟到无我之心后将幻影打破，重拾回当武道家的斗志。