Il team lavora con la CIA per fermare un attacco terroristico dopo che un accordo con il leader terrorista Anton Stepulov è saltato. Una psichiatra, dopo averlo valuto, sostiene che Roman manca di empatia.

Un tatuaggio di Jane si riferisce a Roman e coinvolge una banda di motociclisti con una cattiva reputazione, ma la squadra deve decidere se si fida di Roman al punto tale da mandarlo in missione sul campo.

Jane e Oliver si trovano in una situazione pericolosa che finisce per far venire alla luce i rispettivi segreti, per cui i due non sanno se possono fidarsi l’uno dell’altro. Nel frattempo, Weller e il resto della squadra fanno tutto il possibile per salvarsi.

Patterson riesce a congelare i conti di Sandstorm prima che Shepherd possa acquistare i materiali nucleari. Nel frattempo, la squadra di Weller segue un altro tatuaggio e si imbatte in due hacker che hanno messo all’asta dei dati sensibili per la sicurezza nazionale.

Zapata va sotto copertura in carcere per avvicinare Devon, una ragazza che ha forti legami con Sandstorm. Quando le due riescono a evadere e il piano va male, Weller e la squadra devono affrettarsi per aiutare Zapata la cui copertura potrebbe essere saltata.

La sede della squadra è attaccata da Shepherd e i suoi uomini, Roman si riunisce a Sandstorm, Weller apprende qualcosa in più sul suo ruolo e sulla Fase Due del gruppo terroristico.