Nach der Niederlage des unsterblichen Schurken Vandal Savage und der Enthüllung eines Korruptionsfalls kommt bereits eine neue Bedrohung auf Dr. Nate Heywood, den unkonventionellen und charmanten Historiker, zu und zwingt ihn aktiv zu werden. Nachdem er eine schockierende Entdeckung gemacht hat, will er Oliver Queen ausfindig machen, um mit seiner Hilfe die verstreuten Legenden zu finden. Wieder vereint gehen die Legenden ihre neue Mission an

Nate und Ray landen zufällig im feudalen Japan, nachdem Nate die Ausmaße seiner Kräfte entdeckt hat. Derweil überzeugt Sara Vixen davon, dass Rory kein Mörder ist, sodass sie alle gemeinsam Nate dabei helfen, seine Kräfte unter Kontrolle zu bekommen und die japanische Stadt vor der Armee der Samurai-Kämpfer zu schützen. Währenddessen finden Jax und Stein eine geheime Kammer und verschanzen sich vorerst darin

Die Legenden finden eine Veränderung der Zeit im Jahr 1863. Sie finden sich exakt in dieser Zeit wieder und kämpfen dort während des Bürgerkriegs gegen Soldaten, die sich in Zombies verwandelt haben, um ihr Leben. Der Ausgang des Krieges steht auf der Kippe. Jax und Amaya befinden sich währenddessen für eine mutige Mission auf einer Sklaven-Plantage. Derweil spürt Sara die Lasten, die ihre Entscheidungen als Anführerin mit sich bringen

Ein weiteres Problem taucht auf: Es steht in Verbindung mit Präsident Reagan und dem Weißen Haus. Die Legenden sind schockiert als sie erkennen, dass ihr alter Erzfeind Damien Darhk nun als Seniorberater von und für Reagan arbeitet. Während das Team versucht, Darhks Pläne zu durchschauen, hadert Sara zwischen Rachegedanken auf der einen und der Unterstützung des Teams auf der anderen Seite. Derweil brechen Amaya und Nate bei der JSA ein und werden überrascht

Während das Team über die Artefakte und deren Herkunft diskutiert, wird eine neue Zeitveränderung freigegeben. Diese läuft auf beunruhigende Konsequenzen hinaus und spaltet ganz Amerika. Bei ihrer Ankunft treffen sie auf ihren alten Freund Jonah Hey, der gelyncht werden soll. Nachdem sie ihn retten können, wartet jedoch eine weitaus größere Aufgabe auf das Team

Nachdem die Legenden Dominators Plan für die Welt zusammenpuzzeln konnten, müssen sie mit The Flash, Supergirl und Green Arrow zusammenarbeiten, um ihn ein für alle Mal außer Gefecht zu setzen. Derweil findet Stein mit fremder Hilfe heraus, wie das Team Dominator endgültig besiegen kann. Ihre Pläne werden allerdings mit einer Veränderung des Jahres 1987 durchkreuzt, für die Stein selbst verantwortlich ist.

Die nächste Mission führt die Legenden in die Stadt Chicago des Jahres 1927. Es wird aber schnell klar, dass sie von ihren Feinden Eobard Thawne, Damien Darhk und dem neusten Mitglied der Legion, Malcolm Merlyn, hereingelegt wurden. Während jeder versucht, die Probleme der angeblichen Mission zu lösen, motiviert Jax Stein, sein Geheimnis mit den anderen Legenden zu teilen. Währenddessen bekommt Rory einen unerwarteten Gast und weiß nicht, mit der Situation umzugehen

Während Damien Darhk und Malcolm Merlyn im Jahr 1967 versuchen, Rip Hunter zu fassen, kreieren sie eine Zeitveränderung, die wegen ihrer Größe die Aufmerksamkeit der Legenden auf sich zieht. Rip allerdings hat keinerlei Erinnerungen an seine Zeitreise. Er ist aber im Besitz eines unglaublich mächtigen Artefaktes, des „Speer des Schicksals“, und so wird er zum Ziel der Legion von Doom. Ray und Nate erkennen derweil, dass diese Veränderung sie auch persönlich stark betrifft

Die Legenden fokussieren sich auf die Aufgabe, Rip zu finden und ihn zu retten. Aber bevor sie diese zielstrebig verfolgen können, müssen sie herausfinden, wo sich der „Speer des Schicksals“ befindet. Stein glaubt, genau die richtige Person zu kennen, die dabei helfen kann. Derweil realisieren Malcolm Merlyn und Damien Darhk, dass Thawne sie gegeneinander auszuspielen versucht.

Mit der nächsten Mission werden die Legenden in den Winter des Jahres 1776 geschickt. Hier müssen sie sich für George Washington und den Amerikanischen Revolutionskrieg einsetzen. Allerdings verläuft nicht alles wie geplant. So bleibt Sara nichts anderes übrig, als Nate und Amaya als Unterstützung zu schicken. Derweil sind Jax und Stein mit einer eigenen ziemlich aufwendigen Mission beschäftigt

Die Jagd nach dem „Speer des Schicksals“ geht weiter. Die Legenden finden heraus, dass es viele Teile des Speeres gibt, die sich in unterschiedlichen Zeitperioden befinden. Mitglieder der JSA sind jeweils für einzelne Stücke verantwortlich. Das erste Ziel befindet sich in der Zukunft bei Dr. Mid-Nite. Das bringt sie weiter – dieses Mal jedoch in die Vergangenheit – zu King Arthurs Camelot. Hier müssen sich die Legenden mit den Rittern der Tafelrunde verbünden

Nachdem Rip gefangen werden konnte, sitzen die Legenden – wegen einer List von Rip – in der Vergangenheit fest. Ray führt derweil Amaya und Nate an, um das Schiff wieder in Ordnung zu bringen. Um den „guten“ Rip zurückzubekommen, schlägt Rory vor, in Rips Kopf einzudrängen. Dort machen Sara und Jax allerdings keine sonderlich erfreulichen Entdeckungen. Nate und Amaya kommen sich währenddessen immer näher, was aber Konsequenzen mit sich bringen könnte

Die Spuren zum letzten Fragment des „Speers des Schicksals“ führen das Team zu Kommandant Steel ins NASA Hauptquartier im Jahr 1970. Das Team wird auf die Mission der Apollo 13 aufmerksam und glaubt, dass die Legion von Doom möglicherweise darin involviert sein könnte. Die Reise verläuft anders als geplant und vor allem Ray leidet darunter. Die Spannungen zwischen Rip und Sara um die Teamführung werden unterdessen unerträglich

Die Legenden landen während des Ersten Weltkriegs in Frankreich und nehmen die Hilfe von J.R.R. Tolkien in Anspruch, um die letzten Teile des Speers des Schicksals von der Legion des Schicksals zurückzuholen.

Die Legion von Doom verändert die Geschichte, nachdem sie den „Speer des Schicksals“ für sich beschaffen konnten. Das verändert die Legenden und deren Leben möglicherweise für die Ewigkeit …

Als die Legenden sich auf den Weg zu ihrem neuen Ziel machen, gibt es ein massives Zeitbeben; das Schiff wird ins Schwanken gebracht. Um das Geschehene zu verstehen und alles wieder in Ordnung zu bringen, sind sie alle dazu gezwungen, die bahnbrechenden Regeln der Zeitreisen zu brechen. Wenn sie es allerdings schaffen, den Speer zu zerstören, müssen sie mit der ultimativen Konsequenz rechnen