Los alumnos de la clase 3-E del instituto Kunugigaoka intentan por todos los medios matar a su profesor, pero es un objetivo complicado.

Sugino intenta sacar partido de su pasado como jugador de béisbol para deshacerse de Koro-sensei, pero no es fácil de engañar.

Un nuevo estudiante llega a la clase 3-E tras su expulsión. Odia a todos los profesores e inmediatamente decide matar a Koro-sensei.

La nueva profesora de idiomas Irina Jelavic llega al instituto. Los alumnos descubren que ha venido a matar al profesor Koro-sensei.

La inocente Manami Okuda intenta envenenar a Koro-sensei. Fracasa en el intento, pero Koro-sensei se ofrece para ayudarla a buscar un veneno y trabajar en equipo.

Las diferencias del director y Koro-sensei sobre la gestión hacen que los alumnos de la clase 3-E se apliquen más con los exámenes trimestrales a la vuelta de la esquina.

El viaje de la clase a Kioto es otra oportunidad para asesinar a Koro-sensei con la ayuda de un francotirador del gobierno y no de algunos delincuentes.

Durante el viaje a Kioto, un francotirador recibe la misión de eliminar a Koro-sensei apostándose en determinados sitios, pero la tarea no es fácil.

Llega una nueva alumna procedente de Noruega, que no dejará de disparar sus armas en clase.

Irina intenta demostrar a su antiguo mentor que tiene lo que hace falta para matar a Koro-sensei. Karma y Nagisa viajan a Hawái con su profesor.

Llega un segundo alumno que dice ser el hermano de Koro-sensei. Ambos se enfrentan en un violento duelo.

La clase 3-E juega un partido de béisbol amistoso contra el equipo del instituto. Sugino está decidido a derrotar a sus excompañeros y Koro-sensei quiere ayudar.

Un soldado que parece simpático se hace cargo de la clase de educación física de Karasuma, pero los alumnos descubren poco a poco su verdadera naturaleza.

Con la ayuda de Shiro e Itona, el matón Terasaka trama un plan para matar a Koro-sensei en la nueva piscina del instituto.

Koro-sensei anuncia que los alumnos que saquen la mejor nota en los próximos exámenes podrán disparar a uno de sus tentáculos.

Koro-sensei intenta motivar a los alumnos de 3-E para que se esfuercen en los exámenes finales, pero algunos alumnos de 3-A deciden sabotear los esfuerzos de 3-E.

Lovro enseña técnicas de asesinato a los alumnos y después se van a veranear a la isla.

El intento de asesinato empieza a tramarse cuando los alumnos de 3-E difunden un vídeo para avergonzar a Koro-sensei. Sin embargo, otro plan empieza a tomar forma.

Un equipo de alumnos se infiltra en el hotel, donde compiten contra asesinos profesionales al intentar ayudar a sus compañeros de clase infectados.

Las chicas y Nagisa intentan pasar al siguiente piso mientras Karma emplea una táctica más inteligente para deshacerse de un secuaz.

Con la ayuda de Koro-sensei, los alumnos continúan abriéndose paso hacia la parte superior del edificio, donde conocen la identidad del cerebro de todo el asunto.