在圆桌会议讨论关于频繁出现的吸血鬼事件不寻常的时候，“最后的大队”中的瓦伦丁兄弟路克·瓦伦丁和杨·瓦伦丁率领武装食尸鬼部队进攻Hellsing本部，将Hellsing除了圆桌会议和沃尔特·C·得尼斯、塞拉斯和阿卡多之外的人全部杀死，杨·瓦伦丁留下的千禧年到底是要迎接下一轮敌人。

在法王厅的帮助下因特古拉得知千禧年“最后的大队”的本部隐藏在南美，为了歼灭敌人因特古拉派遣阿卡多、塞拉斯和贝尔纳德队长前往南美，见敌必杀。为了打破僵局，少校命令土八该隐·阿罕布拉中尉出击迎击阿卡多。

为了将阿卡多从伦敦引开从而进攻伦敦，“最后的大队”的李伯·凡·温克中尉夺取一艘英国在大西洋上面的航空母舰，打算将阿卡多引到海面上，面对猎人的魔弹任何导弹和飞机都无法接近船。因此阿卡多驾驶大轮船前来改变战局。

“最后的大队”趁阿卡多离开伦敦的时候，率领一千名狼人部队成员进攻伦敦，少校令索林·布里兹中尉进攻Hellsing本部将伦敦化为地狱，一千名狼人部队成员肆虐伦敦，伦敦变成一片燃烧的死都。

索林·布里兹中尉乘坐巨型汽艇进攻Hellsing本部，而塞拉斯·维多利亚负责防守，塞拉斯用大炮攻击敌人飞艇歼灭了上半的敌人，可尽管如此剩下的敌人都是身经百战的军人，而且还被改装成了吸血鬼。

面对狼人部队的进攻，佣兵部队损失惨重，塞拉斯将进攻Hellsing的部队歼灭以后和索林·布里兹中尉对决，索林·布里兹用能力唤醒了塞拉斯内心深处的记忆，将塞拉斯·维多利亚的左手砍下，贝尔纳德队长为了救塞拉斯被砍成重伤，濒死状态让吻了塞拉斯让塞拉斯吸了他的血。

塞拉斯全歼敌人之后飞到被背叛者十三科抓住因特古拉的身边与之对峙，此时阿卡多用自己的能力缓慢划船终于回到了英国，阿卡多在接到因特古拉的命令之后释放死河将敌人部队屠杀殆尽，为了抓住唯一能杀死阿卡多的机会亚历山大·安德森挺身讨伐阿卡多。

阿卡多击败亚历山大·安德森之后，叛变的沃尔特·C·得尼斯以年轻的姿态出现在众人面前，将因为沃尔特侮辱安德森而出手的高木由美江瞬杀，因特古拉迫不得下达了见敌必杀的命令，没有死河的阿卡多因此和沃尔特决斗，而塞拉斯则随同因特古拉进攻敌人飞艇。

阿卡多凭借路克·瓦伦丁的一条生命复活，而沃尔特强行变年轻的身体却到达了极限，为了不给沃尔特机会阿卡多吸收伦敦死去的生命，塞拉斯则对付狼人上尉，因特古拉则前往少校所在的指挥地，迎来最终决战。