הצוות חוקר רצח של קצין צי בעל סיווג בטחוני גבוה ביותר ששימש לפני מותו כנספח טכני לחברת פיתוח פרטית.

בפרק סיום העונה, חברי הצוות משתפים פעולה עם ההתחזות של פרייד כמת. הם מגייסים לעזרה את סוונסון ואת אייזלר, למרות החשש שפרייד השתגע, כאשר נמצאת גופתו של סטון, יד ימינו של ראש העיר.

חברי הצוות חוקרים תקרית של רצח בין כלי רכב, שמעורב בו שוד של פסולת גרעינית. הם מגלים שהשודדים הרוצחים מנסים להכין "פצצה מלוכלכת".

הצוות חוקר מקרה בו נמצא שוטר צבאי של חיל הים באגם ובכיסו כמות גדולה של אם.די.אם.איי ובמהלך החקירה נתקל בחבר ותיק של פרייד.

אחרי שחבר מושבעים גדול מחליט להעמיד לדין את פרייד, התובע הכללי השותף אריק בארלו מתייצב ומציע לפרייד עסקה - פרישה מאן-סי-איי-אס ומחיקת כל האישומים.

פרייד נלחם על חייו בטיפול נמרץ והצוות מחפש את הרוצחת השכירה שניסתה לחסל אותו.

לאחר ניסיון כושל ללכידת מנהיג אפוליון פרייד ולסל נאלצים להיכנס לשטח עוין לחילוץ סוכן אף-בי-איי שנלקח כבן ערובה.

עונה שישית לדרמת האקשן המצליחה. בפרק הראשון לעונה, פרייד נאלץ לקצר את חופשתו כשהאנה מושעית עקב אי ציות לנהלים במהלך חקירה משותפת עם האף-בי-איי.

פרייד מבשר לצוות שייעדר מהעבודה כדי לעבור טיפולים שיעזרו לו לברר מה פשר הסיוטים שהוא רואה. בינתיים הצוות מתמודד עם חקירה חדשה ועם חבר צוות חדש ויהיר שבא לתפוס את מקומו של לסל.