神崎抱着还是幼儿的阿人从实验室逃了出来，以爷爷的身份带大了阿人，并教他学习，阿人慢慢体会到了人类的感情。出去干活的阿人从一群流氓手中救下了明美，并取得了一万元的报酬。回家后发现爷爷浑身是血的躺在地上，惊慌失措的他带着爷爷去找医生，求救无门后去找了明美，一起处理完爷爷的后事，明美收留了无家可归的阿人……

小叶前去阻止因小事而动手的阿武与阿德俩人，却不小心摔倒，这时阿人出现了，解决了这件事。时隔多年不见的小叶，通过阿人手上的天使之环认出了阿人。为了找出纵火犯，高雅重新开始了巡逻任务，在途中发现了火灾现场，高雅义无反顾的冲了进去，遇见了阿人。俩人在房间里找到了生还者，阿人疯狂的举动遭到高雅的反对，然而事实证明阿人是对的……

时光荏苒，阿人接受天城光铠的条件已过了两年。小叶与母亲也还在在做义工，在下城免费发放饭菜时，又遇见了阿人，见到小叶的阿人其实很高兴，但是突然想起天城光铠的话，黑着脸说了句以后不要在来这里了，便头也不回的离去。回到家的阿人发现有人躲在衣帽间，原来她不小心看到了PLAYER杀人的情景，被追杀至此……

清理人的剑刺中了阿人的背，既不是PLAYER也不是人类触感，让清理人很疑惑，随后前来灰谷政次解答了他的疑惑，也替阿人解了围。高雅来到了早见瞒着父亲进行的超机密计划基地，在这里看见了大家制造好的“阿尔法斯”，这让高雅可以再一次的面对正义。高雅被一位陌生老头拦住了去路，给他看了一段录像后，告诉他如果选择妹妹，将会有三人会失去生命……

从昏迷中醒来的小叶发现自己跟朋美被困在了一处不知名的地方，绑架她俩的人用朋美威胁小叶睁开眼看着自己变身，看到这一幕的小叶感到恐怖不已，而且那人告诉她，这都是他们天城家的杰作。就在阿人处于危难之中时，高雅的“阿尔法斯”从天而降，解决了危机。灰谷把混有暴走之轮碎片的陶瓷嵌入了阿人身体中，ZET的力量发生了惊人的变化……

在暴走之轮的影响下，人形的艾波尔被强制“里返”，就在阿人与“里返”的矶野缠斗时，灰谷以一副看热闹的态度出现了，并且说矶野违反了艾波尔的规定，让阿人杀了他，矶野感觉被利用了愤怒不已，阿人不忍看他这样，于是出手解决了他。打倒矶野后，阿人赶到了与龙虾人决斗的高雅身边，两人联手作战，最终战胜了龙虾人。

面对上级的盘问，灰谷否认自己看见了红色身体Zet的能力。苏醒后的小叶叫来了高野和阿人，询问有关PLAYER的事，高雅认为这是他们家内部的事，所以想要告诉小叶实情，却被阿人阻拦，阿人认为，有的事还是不知道为好。突然听到爷爷声音的阿人无法安静下来，天城光铠决定带他去见神崎，然而当阿人看到后，伤心的无法自持……

熟睡中的小叶被“阿人”摇醒，说是前来取爷爷的遗物，这时载着众人的直升机回来了，冲进房间的众人看见面前有两个仿冒的“阿人”，大为震惊，为了保护天城光铠，杉田博士牺牲了，连带着天城家也被炸毁。原来这都是灰谷所指示的。灰谷的上司MASTER半路拦截了阿人，说灰谷无论对于人类或是艾波尔都是棘手的存在，于是想让阿人协助艾波尔消除灰谷。

高雅又接到了陌生老头的来电，说他知道小叶的踪迹，为了妹妹，高雅义无反顾的去了约定的地点，上车后无防备的他被老头迷晕了，而后面协助他的人员也搜索不到他的信号了，控制室的早见，看到这个情况后阴暗的笑了。高雅醒来后发现自己躺在一个陌生的地方，又被迫接受了老头的测试。另一方面，灰谷也开始了猛烈的报复行动……

为了救助被困的一群人，高雅奋力战斗，虽然最终打败了PLAYER，却被大家认为是罪魁祸首，这时前往出口的电梯出现在大家眼前，看见了希望众人向电梯奔去，高雅阻拦不及，眼睁睁的看着大家死在了他的面前。在人偶的带领下，高雅来到了老头中田次郎面前，让他没想到的是早见也出现在了这里，原来为了得到天城，早见协助了次郎的计划……

灰谷闯入了天城的记者会现场，引起了一片混乱，前来阻止他的阿人却被他取出了身体里的红桩，倒地不起。这时高雅乘坐着“阿尔法斯”赶来，蒙蔽心智的他把枪口对准了父亲。花子被绑架带至现场，为了保护自己心爱的人，阿人最终决定将红桩插入体内，变成了完成体，但在阿人“暴走之轮”的影响下，周围的PLAYER被强制“里返”，而这里面也包括了花子……

花子竟然就是撒沙婆婆，只要被她碰到的人瞬间就会化为沙子。阿人回想起以前与花子度过的日子，虽然花子被强制“里返”，但他却下不了手。在他与灰谷缠斗期间，花子被高雅袭击身亡，看见这一幕的阿人痛不欲生。高雅也受到灰谷高强度的袭击，处境危险，灰谷挑拨阿人杀了高雅为花子报仇，面无表情的阿人捡起了高雅掉落的剑，冲了上去……