Une violente dispute éclate entre Frank et Charlie. Les autorités lancent alors une enquête sur Babbit.

Charlie et Frank font équipe pour sauver leur projet. Frank fait appel à un interlocuteur inhabituel.

Frank Winter, qui a été longtemps détenu en prison à cause de son double jeu mené sur le site secret, a enfin été libéré, notamment grâce à Liza. Il est maintenant revenu sur le site de recherche et tente de regagner l'influence qu'il avait perdue. Le projet Manhattan progresse néanmoins.

Tandis que le projet vascille et semble de plus en plus menacé, Charlie se tourne vers un partenaire improbable pour lui demander de l'aide...