O núcleo que dá energia para a máquina do tempo está enfraquecendo. Para trazer Cole de volta do passado, Jones deve convencer os antigos amigos da operação militar "Spearhead" que esta é uma missão que vale a pena ser salva.

Cole se vê no ano de 2017, no auge da praga. Sem opções, Jones enfrenta uma impossível escolha para substituir o Núcleo.

Jones comes to the disheartening realization that time travel is humanity's true enemy and that as its architect she needs to be stopped, and so she sends Railly back to the year 2020 with orders to undo all of it.