Blanche 以催眠術篡改紗耶香以前的記憶，藉以利用紗耶香。達也為了驅除日常生活的威脅，決定摧毀 Blanche，對於紗耶香被利用感到怒火中燒的桐原也加入陣容。在達也的指揮之下，眾人攻進 Blanche 的根據地，武裝的恐怖分子以及 Blanche 的領袖司一嚴陣以待。

獨立魔裝大隊組織的飛行部隊接連殲滅恐怖分子。達也使用「分解」與「重組」的英姿也令敵人膽戰心驚。同一時刻，深雪等人順利搭乘直升機要離開橫濱，卻在得知魔法協會分部的危機之後改變路線。在分部所在的港灣高塔，呂剛虎正嚴陣以待。

「灼熱萬聖節」的兩個月後，達也等人為即將前往美國交換留學的雫舉辦歡送會。進入新學期，和雫交換留學的美國學生來到魔法科高中。她的名字是安潔莉娜．庫都．希爾茲。魔法力強到匹敵深雪的她，真正的身分是……？

達也在例行的晨間習武，向師父八雲請教精靈相關的知識，十師族的七草真由美也邀請他加入追捕寄生物的行列。另一方面，想為雷歐報仇的艾莉卡與幹比古，終於遇見美軍天狼星追殺逃兵的現場……

吸血鬼事件落幕，第一高中迎來第29屆的畢業典禮，莉娜也留下美好的回憶返回美國。升上二年級之後，達也進入新成立的魔工科，另一方面，四葉家培育的魔法師櫻井水波接下某項任務。

恐怖份子即將炸毀東京離岸高塔，參加竣工宴會的賓客們匆忙搭乘電梯逃生,卻再度遭遇意外狀況，達也不得已只好找恐怖份子交涉，也因而重新想起自己堅持至今的信念……