街から悪を一掃するため、バーンズ警部とともに懸命な捜査を続けているゴードン。そして彼は、ついに、ゴッサム・シティの最も危険な殺し屋、エドアルド・フラミンゴと顔を突き合わせる。そんな中、久しぶりにばったり再会したニグマとペンギンは、悪だくみを巡らし、ブルース・ウェインは、両親を殺した犯人の名前を引き渡すようギャラバンに詰め寄っていた。