La squadra di Don è alla ricerca della figlia di un genetista che sembra essere stata sequestrata dalla madre mentalmente instabile. Il caso prende uno sviluppo inaspettato quando emergono prove che indicano la probabilità che la bambina sia un clone. Intanto Charlie ed Amita discutono sulla possibilità di avere dei figli e Liz rivela un oscuro segreto.

L'FBI sta indagando su una serie di omicidi e scoprono che tutte le vittime avevano richiesto i servizi di una squillo prima di morire. Il caso però, è più complicato di quanto sembri.