Araki Gota intègre le lycée Kaku, où il devient le professeur principal de la fameuse 2-C, réputée pour ses élèves violents, dont le M4, le groupe qui dirige l'école. Dès le premier jour, il essaie de se familiariser avec eux mais il se fait tabasser. Peu de temps après, il assiste aux manoeuvres sournoises de Money Man, Bon, et tente de le raisonner...

Depuis qu'il a vaincu Money Man et ses sbires, le Kamen Teacher, alias Araki Gota, est désormais la cible de Kotaro, alias Mad Max, un des membres du M4. Toutefois, la tâche s'annonce ardue puisqu'il ne sait ni sa véritable identité ni où il est. De plus, son groupe commence à douter de lui, et notamment de ses méthodes tyranniques...

Calmé par le Kamen Teacher, Kotaro est désormais harcelé par ses hommes de main mais à la surprise générale, il ne se défend pas. Pendant ce temps, la professeur Ichimura Miki assiste à un méfait de Ryota, alias Ice Man. Elle s'empresse alors d'en parler à son collègue Gota. Ils apprennent alors que leur élève à un grand besoin d'argent...

Après avoir frappé le Kamen Teacher, qui s'est laissé faire, Ryota s'est fait corriger par le Kamen Teacher Black et finit alors à l'hôpital. Étonné par la présence d'un autre Kamen Teacher, Gota fait part de son désaccord avec le directeur de Kaku. Une fois sorti de l'hôpital, Ryota doit faire face à deux de ses anciennes victimes qu'il a détroussées...

Énervé par les agissements du Kamen Teacher et pour son meilleur ami Takehara Kinzo, Shishimaru, alias Shadow Man, le dernier membre des M4, s'est juré de le vaincre. Pour le trouver, il s'en prend aux professeurs du lycée. Il attire alors l'attention du Kamen Teacher Black... Pendant ce temps, Gota en apprend plus sur Kinzo et Shishimaru.

Afin de venger Shishimaru, Kinzo attaque le Kamen Teacher Black mais Gota, vêtu de son costume de Kamen Teacher, intervient et stoppe leur combat, mécontent des méthodes utilisées par son compère. Peu de temps après, Gota tente de raisonner son élève, en vain, Kinzo étant davantage occupé à trouver de l'argent pour son ami...

Harcelée par un certain nombre de ses camarades, menés par Noma Asami, Kondo Kanako est sauvée par un autre camarade de classe, Kusanagi Keigo. Mais il devient alors la cible des harceleurs. Pendant ce temps, Miki explique à Gota la raison pour laquelle est devenue professeure : c'est grâce à son ancienne prof, une certaine Kusanagi...

Malgré la leçon du Kamen Teacher, Noma et ses amis n'en ont pas fini avec Keigo. Ils prennent alors son petit frère en otage. Les élèves de la 2-4 le forcent alors à commettre de nombreux délits. Mais le Kamen Teacher l'arrête à temps puis retrouve leurs traces. Il n'est pas le seul puisque le Kamen Teacher Black fait aussi son apparition...

Les ennuis se succèdent pour Gota. Depuis qu'il a découvert la véritable identité du Kamen Teacher Black, il a perdu sa licence de Kamen Teacher. De plus, la fille du gérant du bar, Kobayashi Jubee, lui en veut pour la mort de son grand-frère. Pendant ce temps, la bande de Noma n'a toujours pas retenu la leçon et en paie alors le prix...

Un ancien M4, Misaki Tomoya, est de retour de suspension après avoir tué un élève. Kinzo pense qu'il en a après lui. Alors que des Kamen Teacher s'en prendraient aux élèves du lycée, en les éduquant de nouveau par la violence, Tomoya réunit peu à peu les personnes battues autour de lui. C'est alors que le Kamen Teacher Black trouve les imposteurs...

Le Kamen Teacher Black a été vaincu par les deux imposteurs ! Hospitalisé, il reçoit la visite du professeure Ichimura, l'ancienne élève de sa mère. Pendant ce temps, Tomoya est sur le point de d'assouvir sa vengeance : avec l'aide des élèves, il veut s'en prendre à Kinzo et aux membres du M4. Gota intervient alors mais Kinzo l'en empêche...

Mal menés par les frères Jinrou, Gota, le Kamen Teacher, et Keigo, le Kamen Teacher Black, n'ont guère le choix de s'allier afin de les vaincre. Après leur affrontement, Tomoya est contraint de retourner au centre de détention. Mais contrairement à la dernière fois, il semble avoir prêt à prendre un nouveau départ, comme les élèves de la 2-4...