总算安全度过了废校危机的音乃木坂学院，谬斯的成员们过着一如往常的校园生活。此时，她们却接获了“LoveLive!”即将再度举行的消息，只是本次的比赛规则有所修改，必须先通过地区预选赛，才能进入正式比赛。尽管μ’s在地区预选赛时就会和上一届冠军的“A-RISE”硬碰硬，成员们一时之间感到气馁，却也很快地振作起来，但穗乃果却说“就算不参赛也没关系”……

为了参加“LoveLive!”，谬斯再度开始活动。就在这时候，主办单位发表了新规定，地区预赛必须演唱从未发表过的歌曲。于是，必须在短短不到一个月时间内完成新歌的9人，决定到山上集训！住的当然是真姬家的别墅。一行人照惯例分配工作，由琴梨设计服装、海未作词、真姬作曲，但是三人都因为地区预赛非胜不可的压力而陷入低潮……

终于“LoveLive！”的地区预赛即将要开始了。因为这次的表演场地可以自由选择、因此穗乃果提议以学校作为表演舞台、但是妮可与花阳却认为要在令人印象深刻的场地才能够战胜其他团队。 可是在学校周围却觅寻不到适合的场地。就在这时、她们看见了UTX高中巨大的荧幕上、播放着A-RISE光鲜亮丽的样子。此时眼前就出现了真正的A-RISE……

功通过地区预赛的谬斯，在知道敌手A-RISE也同样地区通过预赛后，更加的卖力。但在这时妮可却不知为何没有参加练习就直接回家。感到奇怪的穗乃果等人因此跟踪了妮可，结果却看到她在超市买东西。虽然努力的继续跟踪但却被妮可给跑掉了。就在这时有个与妮可长得很相似的少女刚好经过，那个少女自称是妮可的妹妹……

在2年级去校外教学旅行的期间，凛被团员们选为代理领队。但是她却不太有意愿，显得很困惑。大家在练习时为了小事而意见分歧，被逼着要做出裁决的凛，却无法顺利的领导队员。花阳和真姬努力的要鼓励凛，但凛坚称自己不适合当领队，还直说自己一点也不可爱。原因似乎是出在小学时发生的事情……

校内身体检查的结果显示，穗乃果体重增加了。她因此遭到海未指责太过松懈，还被要求穿上久没穿的第一次LIVE的服装，结果……。看到事实的穗乃果只好开始减肥，本以为事不关己的花阳也陷入同样的困境，两个人于是手牵手互相勉励加油。但是，学生会的社团活动预算会议也迫在眉睫，必须边执行学生会的工作边减肥的穗乃果却……

要决定最终预赛时唱的歌曲时，谬斯团员们个个意见分歧。就在这时，希提议说要做一首情歌。团员们对于不熟悉的歌曲类型感到有点动摇，不过绘里却意外的支持。虽然试着去模拟适合情歌情境的场景，却总觉得差那么一点。面对决定不要勉强唱情歌的成员，绘里提议希望大家再多考虑看看，但最后还是不了了之。这样的绘里，让真姬感到有疑问……

最终预赛当天，穗乃果等二年级生学生会成员，打算在学校说明会上打完招呼后再前往现场，但是外面下了大雪导致交通运输停摆，也因此让她们无法前往会场。决定还是要试着前往会场的三个人，开始走在积满了雪的路上。这时先抵达会场的成员们，正为舞台的高规格吃惊。加上A-RISE的胜利宣言，让六个人感到非常不安……

迎接新年、出外新年参拜的穗乃果等人，偶然遇到了A-RISE，A-RISE也对她们说了一些鼓励的话。谬斯在东京地区的最终预赛顺利过关了。能参加大会的团队，必须在团队介绍网页中刊登宣传口号。穗乃果她们努力思考能完整形容谬斯的一句话，但却没有好点子。之后A-RISE的领队小翼突然出现在穗乃果面前……

雪穗和亚里沙平安的考上了音乃木坂学院，九个人开始讨论谬斯今后的事。妮可认为就算换了团员也应该要继续下去，但花阳却觉得有这九个人才算是谬斯。结果还是讨论不出结论来，绘里认为这应该是留下来的团员要决定的事。因此剩下的六个人决定要讨论出结果。各自想着关于谬斯的未来而彻夜难眠……

LoveLive！结束后谬斯将要解散。这是大家一起决定的事，在本大会前日团员们跟平常一样的集合在顶楼，在气氛很好的状况下结束了练习，就这样一想到这是九个人最后一次一起练习，在回家的路上每个人脚步都变得很沉重。结果穗乃果提出最后一夜要大家在学校里共渡一晚。虽然像集训时一样拥有愉快的气氛，但九人都在这新决意进入梦乡。隔天早上，大会当天终于来临了。

今天是学校的毕业典礼。终于将送别词完成的穗乃果很得意的前往了学校。与在校门前遇到的小凛们一同来到了社办，那里有着奖杯与旗子。谬斯获得了冠军。毕业典礼也准备好了，终于要正式开始了。穗乃果不太能适应这种场合，因此请真姬伴奏开始唱歌。之后全校学生也一起大合唱。然后毕业典礼也结束了，最后九个人一同绕了校园内……