În anul 2552, oamenii de pe planeta Madrigal au luptat pentru independența față de Pământ, dar o întâlnire fatală cu Alien Covenant complică lucrurile. Master Chief John 117 și super-soldatul său „Spartans” se alătură luptei. După bătălie, Master Chief se îndreaptă spre planeta sa natală, Reach, cu un supraviețuitor Madrigal și un obiect misterios pe care l-a descoperit pe planetă. Dar un ordin controversat îl face pe John să-și pună la îndoială misiunea și pe el însuși.

John îl duce pe Kwan la un vechi prieten și află mai multe despre obiectul misterios, pe care Covenant și Makee sunt hotărâți să-l fure. Odată cu creșterea amenințării extraterestre, Dr. Halsey are un plan pentru a face față comportamentului imprevizibil al lui John.

John își întâlnește noul partener și descoperă secrete în propria memorie. Kwan vrea să se întoarcă la Madrigal pentru a continua lupta poporului ei pentru independență, dar Soren are alte planuri pentru ea. Makee își inițiază planul de a recupera obiectul Madrigal, cu consecințe mortale.

Ghidat de viziunile sale, John îi duce pe Halsey și Cortana înapoi acolo unde a început totul, căutând răspunsuri din trecutul său. Cu Soren pentru protecție, Kwan pleacă în căutarea unei armate. Între timp, comportamentul lui John îl inspiră pe un alt spartan să înceapă o călătorie de auto-descoperire. Și Miranda descoperă o posibilă legătură între artefact și ceva mult mai mare.

Pe fugă și fără opțiuni, Kwan și Soren au o diferență de opinii. Cu posibilitatea de a găsi misteriosul Halo în mintea tuturor, John face o descoperire oribilă.

Supraviețuitorii din luptă se întorc la Reach. John se confruntă cu Dr. Halsey și minciunile trecutului său. Noul prizonier pare să-l cunoască pe John mai bine decât se cunoaște el însuși. Hotărât să înțeleagă mai multe, John se întoarce la artefactul misterios, care îi arată ceva cu adevărat surprinzător.

Călătoria lui Kwan pentru a descoperi „adevăratul scop” al familiei ei o duce adânc în deșerturile Madrigal. Soren este obsedat de treburile neterminate.

John și Makee se împacă cu viziunea lor comună. Halsey are o ultimă șansă să-și salveze misiunea și pe ea însăși. Pe măsură ce lucrurile ajung la un capăt, fiecare trebuie să aleagă o parte.

Bătut și trădat, John 117 îi conduce pe spartani într-o misiune sinucigașă pentru a găsi Halo și a salva omenirea. Dar cu ce preț?