Po návratu na velení flotily se John vrací k Dr. Halseyové a objevuje tajemství ve své vlastní paměti. Dr. Halseyová mu implantuje klon své umělé inteligence - Cortanu, aby lépe mohla řídit jeho počínání. Makee se vydává na cestu za získáním artefaktu. Kwan se chce vrátit na Madrigal. John s Cortanou vyjme tlumící peletu a náhle objevuje nové pocity, které mu přináší i staré vzpomínky na dětství. Přesvědčí Dr. Halseyovou o existenci druhého artefaktu a k cestě na planetu, kde prožil své dětství, kde chce zjistit o těchto artefaktech více informací.

Tým Dr. Halseyové se vydává na planetu Eridanus II, kde prožil John své dětství a chtějí v jeho vzpomínkách pátrat po záhadném artefaktu. Kwan Ha se mezitím pod ochranou Sorena vydává zpět na Madrigal, aby hledala zbytky oddaných bojovníků jejímu otci. Na Madrigalu nejde vše podle plánu a Kwan a Soren se dostávají do nejedné nebezpečné potyčky. Na Eridanu II. mezitím John - Master Chief najde dům svých rodičů a ve vzpomínkách si uvědomuje nové skutečnosti i o Dr. Halseyové. Na domovské základně se mezitím další členka Sparťanské gardy pouští do svého vlastního experimentu a vyjímá si také ze zad peletu omezující její citlivost. John si vzpomene a nakonec zavede Dr. Halseyovou ke druhému, mnohem většímu artefaktu.