星际战争结束后，人类与外星难民和平共存。诺兰和收养的女儿在暴风区遭到灵魂车手抢劫，两人逃到人类定居地抗争之城。达塔克儿子阿拉克和雷夫的女儿克里斯蒂热恋，克里斯蒂的哥哥卢克与阿拉克发生冲突。卢克被人杀死，诺兰成功洗清了阿拉克的嫌疑并抓住了真凶本。通过审问本众人得知沃奇人将要入侵这个城市，城市的防护系统也被本摧毁。诺兰献上原本用来换钱的大地球体，利用大地球体的力量城市战胜了沃奇人。

班狄克在沃奇之战中丢械逃跑，达塔克对其进行了清洗仪式。维特斯威胁本实施自己的计划，本要炸毁反应堆利用辐射杀死城市所有人。一行人找到了本，本却自杀。克里斯蒂坚持要嫁给阿拉克遭到雷夫的反对，阿拉克母亲斯塔玛教唆她反抗父亲，分享者影视，事实上她是觊觎雷夫家的矿产。伊瑞莎擅自救班狄克，执行官汤米帮他解了围。达塔克率人来要人与伊瑞莎发生冲突，阿曼达以性命保下了班狄克。

塔加特和鲍文先后惨死，诺兰查出有人利用地狱虫信息素操纵地狱虫杀人。伊瑞莎的伊祖之影超能逐渐开启，她用此技能查出是灵魂车手琳恩杀的人。伊瑞莎看到了琳恩的过去，他的父母被被塔加特和鲍文所杀。众人在地底寻找琳恩，却遇到了巨型地狱虫。这时，琳恩出现了，他要毁了这个城市，诺兰急中生智将信息素扔到了虫王身上，众人乘电梯逃脱。

阿曼达和身为妓女的妹妹肯雅关系不和，肯雅无意中撞破了达塔克手下生化人的黑色交易被抓走。阿曼达和诺兰在一个小孩身上发现了肯雅的项链，肯雅被抓去做蓝魔鬼有生命危险。阿曼达请求达塔克寻找妹妹遭到拒绝，分享者影视达塔克妻子斯塔玛决定帮助阿曼达，前提是让丈夫加入议会。肯雅终于被找到，达塔克如愿成为议员，诺兰这才看到斯塔玛的厉害。

诺兰和阿曼达负责押送琳恩，并押送修铁路的钱，地球共和国大使特内蒂和他们同车。伊瑞莎抓住了小时候残忍折磨过自己的人戴戈，但戴戈否认是本人。劫匪半路上包围运输车并劫持了特内蒂，诺兰和阿曼达联手救出人质。特内蒂竟拿枪指着诺兰，原来他就是劫匪的线人，幸琳恩救了诺兰等人。在伊瑞莎的折磨下，戴戈露出了本性，声称折磨伊瑞莎是为了依照圣经将她炼成“毁灭之母”。

赏金猎人艾迪在抓捕通缉犯马蒂斯，诺兰捷足先登，两战友在街头相遇。昆汀发现了哥哥卢克在七号矿井发现的不明物，这被前任市长妮基偶然发现。马蒂斯炸毁监狱逃了出去，并威逼达塔克送自己回巴西。得知马蒂斯将为地球共和国研究武器对抗抗争之城，诺兰杀了马蒂斯。地球共和国大使前来追责，艾迪担下了罪责。妮基派手下抢夺不明物，昆汀杀了其手下。

灵魂车手苏卡被刀锋雨杀死，却在洗浸仪式上突然复活。苏卡制造了一种仪器，使原本要落到抗争之城的方舟偏离，城市躲过一劫。原来刺穿苏卡的碎片是宇宙方舟核心的一部分，碎片探测到有船只偏离了轨道并向抗争之城驶来，便利用苏卡的身体组建了拯救城镇的工具拯救沃坦族。城镇躲过一劫，苏卡却处于休眠状态。斯塔玛向肯雅倾诉心事，两人睡到了一起。

诺兰和汤米到降落下来的方舟里检查，救下了来自2013年的国际空间站指挥官戈登。晚上，戈登不受控制的袭击了阿曼达。通过查问耶维尔，诺兰得知戈登是通过手术改变的印迪金志愿者，印迪金人将志愿者改造成人类的摸样，并复制了人类记忆让他们实施消灭人类的计划。得知自己只是一件杀人工具，戈登彻底绝望。雷夫把他当做儿子一样劝慰，戈登找回了自己。

抗争之城瘟疫肆虐，因为伊拉希恩特人是病毒携带者，议会将伊拉希恩特人隔离。阿曼达派诺兰和前男友康纳去取解药。昆汀前来询问关于母亲的事，妮基让她带交出了7号矿井里的的东西金结。回来的路上，诺兰遭到逃过隔离追捕的伊拉希恩特人劫持。由于阿曼达身染瘟疫，达塔克趁机夺权。达塔克杀了几个伊恩希特人并伪造现场，带出解药立了大功，还要和阿曼达一起竞选市长。

梦想成真老板亨特的尸体被发现，嫌疑人杰瑞不久被杀死。得知雷夫不打算把遗产留给克里斯蒂，达塔克气愤的想取消婚礼，但雷夫执意让两个孩子完婚。耶维尔愤怒的质问妮基为何要杀杰瑞，原来7年前亨特无意中发现妮基是印迪金人，亨特敲诈妮基被杀，而杰瑞目睹了一切。妮基想要利用金结统治世界，耶维尔想阻止杀戮，于是耶维尔杀了妮基并伪造了遗书。

达塔克让阿拉克的好友在竞选那天拿彩弹枪袭击阿曼达，诺兰开枪杀死了阿拉克好友。阿曼达袒护诺兰，达塔克趁机抹黑两人，诺兰为不连累阿曼达要离开城市。耶维尔谎称伊瑞莎身体里有寄生虫，她切开了伊瑞莎的背，她家里的金结和伊瑞莎身体里的另一个金结融合了。受伤的伊瑞莎逃到了森林里，遇到了琳恩。达塔克与地球共和国的马西上校勾结，企图在竞选成功后夺取雷夫家的矿山。

马西上校威逼耶维尔帮自己找到矿山下的卡兹里飞船，这个飞船拥有强大的武器系统，伊瑞莎身体里的两个金结就是飞船的钥匙。达塔克成功竞选市长，马西占领了矿区还企图占领抗争之城，达塔克杀了他。马西手下抓来了伊瑞莎打算取出金结，诺兰为了救女被打死。这时伊祖出现，伊瑞莎请求她救诺兰，伊祖让她成为自己的武器。诺兰死而复生，地球共和国占领了抗争之城。

Nolan's desperate search for Irisa yields vital information which takes him south; back in Defiance, the Earth Republic has installed Mayor Pottinger, a charming, calculating and ambitious man who takes control.

Irisa returns to Defiance and is arrested; Mayor Pottinger offers Nolan her release in exchange for capturing those responsible for nearly killing him; Stahma plots to keep Datak behind bars.

Irisa's terrifying black-outs escalate, driving a wedge of secrecy between her and a worried Nolan. Meanwhile, the Tarr family business thrives under Stahma's self-appointed direction while an increasingly suspicious Datak remains in jail.

After his caravan is viscously attacked in the badlands, a badly shaken Pottinger orders Nolan to hunt down and destroy those responsible. Nolan’s manhunt implicates one of Rafe’s miners causing tensions to explode.

Amanda is terrorised by a stalker but the true reasons behind her frightening experiences have far reaching ramifications not only for her but for Pottinger and Doc Yewll as well.

After an Arkfall crash, Pottinger recruits Nolan to lead their salvage mission but his secret agenda puts them in grave danger against an Alien race they’ve never encountered before.

Datak is framed for a bizarre murder and turns to an unlikely ally for help; Irisa discovers more about her destiny after encountering a mysterious stranger.

Nolan must stop a terrorist from destroying New York, but his biggest obstacle may be….Amanda?

Kenya’s earth-shattering return continues sending shock waves through Defiance as Stahma tries to reconcile Kenya’s reappearance, while Doc Yewll works to keep her own dark secret hidden.

Nolan and Rafe race against the clock to rescue Amanda and Pottinger trapped in a deadly mine collapse.

With Nolan searching for Irisa, Amanda is forced to take on the badge as Deputy when the shocking murder of one of their own rocks Defiance.

Nolan races to save Tommy’s life and stop Irisa before her growing forces can put their devastating plan into motion. Meanwhile back in town, Amanda learns the heart-breaking truth about her sister’s murder leading to a daring showdown between Amanda and Stahma.

The fate of Defiance hangs in the balance; Nolan must fight against the republic and old friends to stop Irisa.