與47名村人一起住在小村莊的少女艾，從過去是“守墓人”的母親手中，接下了“守墓人”的工作。艾每天都持續挖掘還用不到的墓穴，但是某一天，她發現村人都不見了。艾在村子裡到處找人，這時她面前出現一名自稱是“食人玩具”的男性。漢普尼說要委託艾進行守墓人的工作，在他帶領下，艾看到了難以置信的景象。

艾與漢普尼遇見一位自稱叫做疤面的守墓人。漢普尼說疤面那樣的人才是守墓人，艾並不是。但是疤面卻說艾是守墓人，這讓艾非常高興。在告別疤面之後，艾離開了已空無一人的村子，要去尋找需要自己這個守墓人的人。可是漢普尼卻逼艾忘掉自己是守墓人的事，遭到拒絕後還舉槍相向。

對於艾詢問去向的問題，漢普尼回答說他要尋找哈娜，還說不老不死的他要尋找死去的方法。就在兩人邊談邊走過吊橋的時候，艾突然被漢普尼一腳踢下河。艾差點溺死，不過驚險的被尤力給救上岸。漢普尼的行為讓艾很生氣，可是尤力告訴她，吊橋在那之後立刻就遭人襲擊了。

弄到破舊的廂型車，繼續旅行的艾等人，救起了一名倒在路上、藍發黑眼的美少年。這名叫做齊利科的少年告訴眾人，他是遭到強盜攻擊後趁隙逃出來的。聽到齊利科是在附近的大都市歐塔斯的公所實習，尤力提議要送他到鄰近城鎮。艾質疑為什麼不能直接送他回去，尤力也只是回答說有點不方便，含混帶過。

歐塔斯是個有無數死者居住的城市。隱瞞活人的身分，進入城裡的艾，很享受在歐塔斯的生活。看到這樣的艾，齊利科產生疑問，問艾為什麼不像普通活人一樣厭惡死人。結果艾直接告訴齊利科，自己是由死人養大、以及自己是守墓人的事。而且艾還開口詢問，為什麼在歐塔斯這裡，只有齊利科是活人。而齊利科的回答是，他也是死人。

來到歐塔斯城內的105名活人，在歐塔斯公主‧巫拉雙眼放出的光芒洗禮後成為死者，被這個地方接納。看到這個景象的艾，忍不住叫了出來，但是戴著獅子面具的少年救了她。從少年口中聽說巫拉是具有致死力量的“死神化身”後，艾根據自己過去的經驗，想到了巫拉或許沒有發現自己是會帶來死亡的特別存在。

艾被強行帶入葛拉學園,發現葛拉學園強制監禁有超能力的孩子,並與艾利斯在鐘塔相遇.艾利斯和男生們在夜晚準備挖地道逃出學院,由於幽靈故意的錯誤指揮,挖入了女生們正在洗的浴室裡。

艾組織大家召開出逃大會，可蜜蜜、梅梅和塔尼亞說即使逃出去也無家可歸，拒絕逃跑，然而艾仍舊鍥而不捨的勸說塔尼亞，當天艾利斯打開了鐵格柵，大家決定今晚就出逃，蜜蜜、梅梅也決定和大家一起，可不願留下塔尼亞一人的艾希望大家給她一天時間說服塔尼亞，她將逃跑的時間告訴塔尼亞，被艾勇氣所鼓舞的塔尼亞最終和大家一起逃出學院，恰好這時尤力趕來接艾，而回到車上的艾發現疤面離開了。

安頓好葛拉學園的朋友們，艾利斯、蒂伊和艾等人在巫拉雙胞胎姐姐瑟利卡的指引下，踏上了尋找疤面的旅程。途中，蒂伊想起艾利斯被遺忘的生日，大家開開心心的為艾利斯慶祝生日之後繼續前進，前方霧氣原來越大，蒂伊決定離開，原來這裡是守墓人誕生之地，找到疤面後，在尤力的勸說下，她和大家一起離開。

一行人來到一座廢墟之城，在艾利斯的帶領下大家穿過未名境界線，到達彼岸被禁錮的三年四班所在的世界。這裡安靜平和且沒有死人氣息，艾等人還見到了實體蒂伊，幾日後，艾察覺到了這裡的異樣，艾利斯告訴她這個世界是三年四班強烈祈願而建築的虛構之所，是以一年為週期而進行迴圈假像空間，對於想要打破這個世界的艾利斯來說他還有個敵人，那就是蒂伊。

為了不讓自己消失，蒂伊把艾利斯和艾騙到籃球場，而自己則去三年四班解除所有人的記憶限制想要將世界重置，空間也因三年四班同學們回憶的解除而不斷發生變化，當艾利斯和艾趕到教室時，蒂伊已準備從教室跳下去，然而就在那一瞬間，艾利斯將蒂伊拉住，這時蒂伊才知道，原來死去的不是自己而是艾利斯。