Un Boeing 777 semble avoir disparu des radars peu avant son arrivée à l'aéroport new-yorkais JFK. Pourtant, peu après, l'appareil est bien retrouvé sur le tarmac, mais ne donne aucun signe de vie. Dépêché sur les lieux, épistémologiste Ephraim Gooweather découvre à l'intérieur de l'appareil que tous les occupants sont morts.

Gus parvient à livrer le cercueil dans un parking sous-terrain désert, mais prend la fuite après avoir entendu un bruit effrayant en sortir. De son côté, Ephraim tente de garder les survivants en quarantaine contre l'avis de ses supérieurs. Abraham, toujours en détention, reçoit la visite d'une vieille connaissance...

Eph et Nora tentent de sauver la vie du capitaine Redfern. De son côté, Fet, alerté par de nombreux signalements d'attaques de rat, pense qu'il se trame quelque chose sous la ville. Libéré de prison, Setrakian est prêt à tout pour arrêter l'épidémie. Quant à l'étrange Thomas Eichorst, il propose un marché à Jim Kent...

Eph se précipite pour rejoindre sa famille et la protéger, mais Kelly a disparu. Il confie son fils Zach à Setrakian et tente de rassurer Nora après la mort de Jim. Tandis que Dutch révèle son rôle dans le plan de Palmer, Gus doit prendre une décision difficile au sujet de Felix...

Eph enquête sur la disparition de Kelly, mais les premiers éléments découverts ne le rassurent pas. Son fils Zach parvient toutefois à localiser le téléphone mobile de sa mère. Dutch est toujours décidée à se venger de Palmer et part à sa rencontre avec Vasiliy Fet...

Vasiliy Fet travaille à créer une bombe lumineuse en augmentant la puissance des lampes à ultraviolet dont ils disposent. Equipés de leurs armes de fortune, de lampes et de cette bombe artisanale, le petit groupe de chasseurs de vampires s'engage dans les tunnels du métro, espérant pouvoir affronter et tuer le Maître pour mettre un terme à l'invasion de ses créatures. Pendant ce temps, Zach est resté seul au magasin du prêteur sur gages en compagnie de Mariela, la mère de Nora, qui n'a plus toute sa raison...

Dutch revient avec un plan pour diffuser le message d'avertissement imaginé par Eph, au sujet des vampires. Mais au même moment, Eichhorst lance une attaque contre la boutique de prêteur sur gages. De son côté, Palmer reçoit un visiteur un peu spécial...

Eph et Fet s'allient pour un assaut tous azimuts alors que Setrakian les assurent qu'ils pourront enfin tuer le Maître. Gus s'aligne avec une nouvelle force étrange, ce qui pourrait amener la lutte dans une direction imprévue.

Kelly cherche Nora et Zack. Pendant ce temps, Ephraim peaufine son plan. Son but : fabriquer et distribuer le plus largement possible l'arme biochimique capable de décimer les créatures, avec l'aide de la Garde nationale. De son côté, Gus trouve un allié inattendu en la personne d'Angel...

Ephraim revient à New York avec la ferme intention de venger la mort de son ami. Il cherche à rencontrer la personne responsable de cette disparition. Pendant ce temps, Setrakian et Fet lancent une attaque sur le Maître en utilisant une ruse inspirée par Fitwilliam. Dutch reçoit une étrange visite...

Fet et Quinlan sont sur la piste du convoi transportant la précieuse arme nucléaire. Eph et Alex sont à la recherche d'indices concernant le plan du Maître, censé sceller le sort de l'humanité. Alors qu'elle est entre les griffes d'un ennemi bien connu, Dutch rencontre un vieil ami...

Fet et Quinlan doivent trouver un moyen sûr pour renvoyer la bombe nucléaire à New York. Eichorst, désespéré et en bout de course, se rapproche. Zack, totalement épris, tente d'en apprendre davantage sur l'objet de son désir, pour le pire...