以春秋戰國時期為舞台，立志成為大將軍的信，為實現與已故友人「漂」的約定，解救因政變被追殺，以統一天下為目標的年輕秦王贏政，就此揭開亂世歷史劇場序幕。動畫第三期描寫「合縱軍篇」，秦國首都將面對有史以來最大威脅，信與年輕武將們在暗潮湧起的戰場上，又會磨出什麼新火花…

秦國遭遇六國合縱軍攻打，而面對實力強大的合縱軍，秦國可能因此滅亡。幸虧秦國的遠交近攻策略生效，靠著蔡澤利誘齊王退兵，減弱合縱軍。然而其他國家的軍隊依然長驅直入，使得眾臣無不苦思對策。而武將們也在四處防堵敵軍推進，卻因為兵力懸殊，連本能型大將軍的麃公都遭到包夾…。

昌平君決定將兵力集中在秦國國門「函谷關」，與合縱軍進行決戰。而合縱軍擔任統帥的居然是名聞天下的他！現在雙方做好準備，在函谷關對峙。信的飛信隊被配置在麃公軍隊，面對十二萬趙軍，眾人難免忐忑不安，然而麃公竟然…

秦國與五國聯軍在秦國國門「函谷關」對決。在飛信隊化解麃公將軍遭到包圍的危機之後，輪到函谷關城牆遭受魏國特地打造的機關井闌車攻占，最強堡壘馬上出現危機…

蒙恬為了解決百步穿楊的楚國白麗，深入敵陣，幸虧王賁及時趕到支援，四個年輕將領的對決一觸即發。與此同時，楚國大將臨武君以過人的實力壓制秦國守軍，並且狂言除了楚國這樣的大國，其他六國的將軍根本不夠格稱為將軍，話才說完就遇上危機。

河了貂為了聚集四散的飛信隊，採取曲折行軍方式，成功集合了部隊前往支援深入敵陣的信。此時正逢信與敵將萬極短兵相接，然而萬極散發的怨念讓信停下腳步，原來就是長平的冤魂在驅使萬極復仇…。

函谷關的攻防戰第一天由秦軍占盡上風，合縱軍似乎因此受到打擊，第二天起只進行索然無味的一般戰鬥。雖然秦軍有些不解，但是也沒有特別在意。沒想到就在第七天，合縱軍的韓軍主帥成恢的部隊開始發動攻擊？！

楚國將軍媧燐的計謀成功，合縱軍充分消耗了秦軍戰力。再加上考慮到背信的齊國可能偷襲五國首都，就是必須在今天發動對函谷關的總攻擊，以求快速打敗秦國。對此，一直按兵不動的秦國大將蒙武總算要出手了。

楚將媧燐派出的戰象軍團成功嚇住騰軍前鋒，也收到一定戰果，然而秦將錄鳴未與干央很快就恢復冷靜，分別擊退戰象。沒想到這些都是障眼法!?而函谷關上也再度受在魏軍大型武器強攻，加上韓軍先前釋放的毒氣生效的雙重威脅下，岌岌可危。

駐守函谷關上的桓騎用計奪下魏軍的井闌車，帶著輕騎數百，神不知鬼不覺的下到地面，他有什麼計謀呢?身中劇毒的張唐也為了秦國存亡而獻出老將最後的氣力，一起參與這項大膽的計謀…。

函谷關上失火的消息讓秦國的文官們大驚失色，再加上聽到駐守山區要衝處的王翦，連同部隊一起失去蹤影?!而媧燐終於出動了，她先派出項翼誘出騰，打算趁群龍無首之際從正面突破。

蒙武再派出一萬五千人進行第二波攻勢，以斜線陣衝撞楚將汗明率領的部隊，蒙武會怎麼突破現狀，直取汗明呢? 雙雄之戰一觸即發。

蒙武與有著中國最強之稱的汗明單挑，雖然屈居下風，不過蒙武的鬥志讓媧燐擔心起來，深怕汗明一個不小心真的敗北了，汗明軍這樣的大戰力將群龍無首，於是派出親弟弟媧偃去趁亂刺殺蒙武…。

蒙武打敗了汗明這件事讓函谷關的守軍們士氣大振，奮勇殺敵。眼看就要將合縱軍逼出函谷關，楚國的媧燐派出的精銳部隊，在此時發動突襲！就在秦軍以為大勢已去之時，一向行事神祕的王翦突然出現。

合縱軍攻打函谷關的行動連番失利，只得開始商討對策，卻不見李牧出席。而咸陽卻收到奇怪的情報，那就是關內小城在神祕部隊偷襲下一一失守…。

麃公破解了李牧的流動陣法，殺到本營要解決李牧時，某位人物突然現身，原來他才是李牧的關鍵一擊。而那位人物強如鬼神般，讓秦國的士兵們不由得害怕了起來，麃公卻毫無懼色的上前迎戰，信因為受困流動無法助陣，著急不已。

麃公陣亡與強敵壓境的消息走漏，讓咸陽城內陷入恐慌，秦王政判斷要在這種情況下守住咸陽城，實在困難重重，加上呂不韋可能趁機叛變，交出秦王換取自身利益，政做了一個大膽的決定。

秦王贏政決定與信等人的部隊死守蕞城，並且要讓蕞城的百姓武裝起來參戰，好拉近與李牧軍的兵力差距。於是政站到眾人面前信心喊話，起先信還有點擔心造成反效果，最後超乎信等人的預料。

李牧帶領的趙軍攻打防守以百姓為主的蕞城，趙軍原以為能輕取蕞城，沒想到卻難以越雷池一步。這件事情讓李牧了解想要用蠻力攻下蕞城，可能會付出慘痛代價，於是便召集趙軍將領…。

李牧將兵力一分為二，一半在夜晚虛張聲勢，讓蕞城秦軍不敢休息，白天再由另一半養精蓄銳的人攻城，幸好在政的激勵下，眾人總是能重新振作精神。在政一次冒險赴前線激勵民兵時，竟然發生了意外。

李牧已經知道蕞城異常高昂的士氣來自於秦王的鼓舞，這下他決定全力搶攻蕞城要處，不再為進攻咸陽保留兵力。即使信持續帶領眾人奮戰，蕞城卻還是…。

援軍的登場讓趙軍瞬間陷入混亂，原來政在離開咸陽之前就派人向外求援，對方卻回應他們率領了大軍外出征戰，即便趕回蕞城，最快也要八天時間。這支援軍讓李牧陷入退兵與否的天人交戰中。

援軍讓李牧深感大勢已去，似乎把最後希望押在負傷出擊的龐煖身上，然而信也明白，為了守住秦軍的勝利，為了在將來成為名震天下的大將軍，都必須挺身挑戰武神龐煖。這場決定蕞城之戰勝敗的武將單挑，即將迎向最後局面。

秦國擊退合縱軍之後，論功行賞，信因為功績卓越，晉升為三千將。而羌瘣為了幫象姐報仇，四處尋找仇人幽連，終於在流亡族人的協助下，找到了幽連。面對幽連，羌瘣有勝算嗎？

羌瘣憑著天生才能，使出非比尋常的深層巫舞，瞬間打倒圍攻她的幽連手下，並且保留了呼吸，準備用來一口氣解決幽連。然而幽連竟然連巫舞都沒使用就能跟上羌瘣的巫舞，讓羌瘣百思不得其解，難道這就是蚩尤的實力，這就是羌瘣不如她的原因嗎？