곤은 헌터시험을 치기 위해 미트 이모가 내준 과제, 20년 동안 아무도 잡지 못했던 늪의 수호신을 잡는다. 결국 아버지와 같은 헌터가 되기 위해 자신을 키워준 미트 이모와 이별하고 고래섬을 떠나는 곤. 곤은 시험장으로 향하는 배에서 크리피카와 레오리오를 만난다.

시험장에 있는 도시에 도착한 곤, 레오리오, 크라피카 세 사람은 선장의 조언에 따라 지름길을 찾아나선다. 음산한 마을을 걷던 세 사람은 한 노파를 만나게 되는데 그 노파는 자신이 내는 퀴즈를 풀어야 시험장에 갈 수 있다고 말한다.

1차 시험은 2차 시험장까지 시험관 사토츠를 따라 가는 것. 그러나 도착지점이 어디인지 알 수도 없고, 앞도 잘 보이지 않는 어두운 지하 터널에서의 마라톤은 수험자들에게 심한 체력 소모와 심리적 압박을 주며 그들을 점점 지치게 한다. 80km이상을 뛴 시점에서 이미 여러 명의 탈락자가 나오고, 레오리오 역시 발걸음이 무겁기만 하다.

기나긴 터널을 빠져나온 수험자들을 기다리고 있는 건 자욱한 안개로 한 치 앞도 잘 보이지 않는 누메레 습지였다. 게다가 누메레 습지에는 괴이한 괴물들까지 도사리고 있다. 곤과 키르아는 앞을 향해 잘 달리고 있었지만 어느 새 뒤쳐진 레오리오와 크라피카는 히소카와 맞닥뜨리게 된다.

뒤쳐졌던 곤과 크라피카는 다행히 2차 시험장에 무사히 도착한다. 2차 시험 시험관은 멘치와 브하라. 그들이 낸 2차 시험 과제는 비스카 숲에 사는 돼지를 잡아 요리한 후 시험관 두 사람을 만족시키는 것. 수험생들은 요리라는 뜻밖의 과제에 당황해 한다.

2차 시험을 무사히 마친 곤, 키르아, 크라피카, 레오리오는 비행선을 타고 3차 시험장을 향해 간다. 시험으로 피곤에 지친 크라피카와 레오리오는 쉬기로 하고 곤과 키르아는 비행선 안을 구경하기로 한다. 그런데 두 사람 앞에 네테로 회장이 나타나 게임을 제안한다.

수험생들은 비행선에서 내려 트릭타워 옥상에 도착한다. 트릭타워는 3차 시험장인데 72시간 이내에 탑 아래까지 내려가야 합격을 할 수 있다. 그런데 낭떠러지나 다름없는 높은 트릭타워에서 내려갈 수 있는 방법을 찾기란 쉬운 일이 아니다.

남은 네 번의 대결 중 3승을 해야만 하는 곤 일행. 두 번째 대결은 누가 든 촛불이 먼저 꺼지는가 하는 것. 이번엔 곤과 연속폭파범 세드칸의 대결이다. 세드칸이 숨겨놓은 함정을 무엇인가... 그리고 세 번째는은 마지타니와 크라피카의 대결. 마지타니는 크라피카에게 데스매치를 제안한다.

곤 일행은 크라피카가 이겼다고 기뻐하지만 데스매치의 규칙에 따라 승부는 아직 매듭지어진 게 아니란 사실을 알게 된다. 레오리오는 크라피카에게 마지타니를 처리하고 오라고 재촉하지만 크라피카는 패자한테 폭력을 쓸 수 없다고 딱 잘라 거절한다. 결국 마지타니가 깨어날 때까지 기다리기로 결정한 곤 일행. 그러나 마지타니는 깨어날 생각을 않고 시간은 하염없이 흐르기만 한다.

레오리오에게 남은 시간은 10시간. 궁지에 몰린 레오리오는 가위 바위 보로 내기를 하기로 한다. 그런데 자신만만했던 레오리오는 상대의 심리전에 걸려들어 결국 지고 만다. 이로써 2승2패. 이제 승부는 키르아의 손에 달려있다.

50시간의 대기시간을 보낸 곤, 키르아, 크라피카, 레오리오, 통파는 1시간을 남겨 두고 두 개의 문 앞에 서게 된다. 하나는 다섯 명이 갈 수 있지만 길고 험난한 길로 통하는 문, 그리고 또 하나는 세 사람밖에 갈 수 없지만 짧고 쉬운 길로 통하는 문. 다수결로 결정되는 다섯 사람의 운명은…

미트에게 곤이 보낸 편지가 도착한다. 그 안에는 곤이 헌터 시험을 겪으면서 만난 소중한 친구들과 파란만장했던 경험들이 모두 담겨 있다. 미트는 그 편지를 보며 한층 더 강해진 곤을 느끼며 대견해 한다.

4차 헌터 시험장 제빌섬을 향하는 수험자들. 4차 시험은 수험자들의 넘버 플레이트를 빼앗는 것. 자신의 넘버 플레이트 3점, 타깃의 넘버 플레이트 3점. 그 외 수험자들의 플레이트는 1점으로 제한시간까지 총 6점을 모아야 4차 시험을 통과할 수 있다. 그런데 곤의 타깃은 바로...

곤은 자신의 장기인 낚시를 이용해서 타깃인 히소카의 넘버 플레이트를 빼앗을 타이밍만을 노리고 있다. 한편 레오리오는 통파에게 속아 자신의 넘버 플레이트를 빼앗기고 마는데 크라피카의 도움으로 다시 되찾게 된다. 레오리오와 크라피카는 동맹을 맺고 서로가 타깃의 넘버 플레이트를 빼앗을 수 있도록 협조하기로 한다.

크라피카와 레오리오는 히소카를 만나 위험에 처하지만 협상을 통해 가까스로 위기를 모면한다. 하지만 이미 살인본능으로 흥분한 히소카는 살기를 잠재우지 못하고 다음 사냥감을 찾아다닌다. 히소카가 사냥감을 노리는 순간을 포착한 곤은 드디어 히소카의 넘버 플레이트를 빼앗는데 성공한다. 그런데 그 순간 히소카에 너무 집중한 나머지 곤을 노리던 수험자한테 자신의 넘버 플레이트를 빼앗기고 만다.

키르아는 자신의 뒤를 밟던 이모리를 간단하게 처리하고 자신의 타깃이던 우모리의 넘버 플레이트를 가볍게 빼앗는다. 한편 곤은 레오리오, 크라피카와 합류해 레오리오의 타깃 폰즈의 넘버 플레이트 빼앗는데 동참하기로 한다. 세 사람은 폰즈를 쫓다가 이상한 동굴 앞에 도착한다.

레오리오의 비명을 듣고 동굴 안으로 달려들어간 곤, 크라피카는 동굴 안을 가득 메운 독사들 때문에 동굴 안에 갇힌 신세가 된다.독사의 함정을 만든 장본인인 바본은 폰즈에 의해 이미 죽은 상태. 게다가 독사에게 물린 레오리오는 점점 더 상태가 악화돼 간다. 이때 곤은 폰즈의 최면 가스를 이용해 동굴을 탈출할 묘안을 생각해 낸다.

헌터 시험 중 마지막 시험을 치르게 된 9명의 수험자들. 마지막 시험은 이긴 사람은 빠지고 진 사람이 끝까지 올라가는 특이한 1대1 토너먼트전으로 이 시험에서 떨어지는 사람은 단 한 사람뿐이다. 패배의 조건은 오직 수험자가 항복 의사를 밝히는 것이고 상대를 죽이면 그 즉시 실격처리 된다. 드디어 첫 번째 시합, 곤 대 한조의 싸움이 벌어진다.

한조와의 시합에서 팔이 부러져 정신을 잃었던 곤은 잠에서 깨어나 사토츠한테 헌터시험 결과에 대해 묻는다. 키르아가 형인 이르미와 대결하게 됐고 그 후 키르아가 헌터시험에서 탈락하게 된 전후사정을 들은 곤은 자리를 박차고 이르미에게 달려간다.

곤은 자신과 친구가 되려는 순수한 마음을 짓밟고 살인을 하게 만든 이르미를 용서할 수가 없다. 곤은 집으로 돌아간 키르아를 데려오기로 결심하고 크라피카와 레오리오 역시 동행하기로 한다. 이제 헌터가 된 곤, 크라피카, 레오리오는 키르아를 만나기 위해 파도키아 공화국 쿠쿠르 마운틴으로 향한다.

곤과 크라피카, 레오리오는 파도키아 공화국에 도착해 쿠쿠르 마운틴에 도착한다. 그런데 거대한 성벽처럼 생긴 정문이 그 앞을 가로막고 있다. 세 사람은 그곳의 수위로 여겨지는 제브로에게 키르아의 집으로 들어가기 위해서는 그 정문을 열고 들어가야 하며, 그 옆에 있는 작은 문으로 들어갔다간 파수견인 미케의 먹이가 되고 만다는 사실을 듣게 된다.

키르아를 만나기 위해 시험의 문을 열고 들어가기로 결심한 곤, 크라피카, 레오리오. 그들은 제브로의 집에서 특별 훈련을 하며 문을 열 수 있는 힘을 기르기로 한다. 피나는 노력 끝에 시험의 문을 연 곤, 크라피카, 레오리오. 하지만 그들 앞에는 또 다른 난관이 기다리고 있었다

카나리아의 도움으로 조르딕 집안의 저택 근처까지 가게 된 곤, 크라피카, 레오리오. 하지만 키르아의 엄마 키쿄가 나타나 키르아는 지금은 만날 수 없다는 키르아의 메시지를 전한다. 한편 키르아는 할아버지 제노의 도움으로 독방에서 풀려나고 아버지 실버의 부름으로 그를 만나러 간다.

카나리아를 따라 집사실에 도착한 곤, 크라피카, 레오리오. 그곳에서는 집사 고트가 그들을 기다리고 있다. 고트는 세 사람이 키르아의 친구로서 자격이 있는 시험하기 위해 게임을 제안한다. 동전이 어느 손에 있는지 알아맞히는 간단한 게임이지만 고트의 번개 같은 손놀림 때문에 쉽게 알아낼 수가 없다

곤은 미트에게 제빌섬에서 히소카와 있었던 얘기, 최종시험을 치르고 헌터 라이센스를 받게 된 얘기, 그리고 키르아를 만나러 쿠쿠르 마운틴에 갔다가 일어난 얘기를 편지에 써서 보낸다. 그리고 앞으로 천공 격투장에 가서 더 많은 훈련을 하면서 강한 헌터가 될 거라는 다짐도 함께 적어 보낸다.

위층으로 올라가면 올라갈수록 강한 실력자들과 싸워야 하는 천공격투장. 곤과 키르아는 그곳에서 훈련하면서 돈을 벌기로 한다. 1층에서 시합을 치르고 50층으로 한 번에 올라가게 된 곤과 키르아는 엘리베이터 안에서 심원류 권법을 쓰는 즈시라는 소년을 만난다. 그리고 즈시와 시합에서 맞붙게 된 키르아. 그런데 키르아는 한 순간 형 이르미에게서 느꼈던 위험한 기운을 즈시에게서 느낀다.

즈시의 스승인 윙에게서 ‘넨’이라고 하는 존재를 알게 된 곤과 키르아. 그런데 키르라는 윙의 설명이 거짓일 거라는 의심을 품는다. 넨의 진정한 의미를 알지 못한 채 곤과 키르아는 200층 클래스로 올라가게 된다. 그런데 두 사람은 그곳에서 자신들을 막는 강한 살기를 느끼게 된다.

200층 클래스에서 버티고 있는 히소카의 넨 장벽을 뚫기 위해 곤과 키르아는 윙에게 억지로라도 넨 능력을 일깨워달라고 부탁한다. 그리고 욘타이교 중 하나인 텐을 수련하기 시작한다.

천공 격투장 200층 클래스의 첫 시합에서 넨 능력자 기드와 싸우게 된 곤. 곤은 텐을 사용해서 싸우려고 하지만 넨이 담긴 팽이를 자유자재로 조종하는 기드 앞에선 속수무책이다. 최대한 오래 싸움을 끌고 나가기 위해 곰곰이 생각하던 곤은 목숨을 건 모험에 도전한다.

곤이 부상을 입은 지 한 달 후, 천공 격투장에서 히소카와 카스트로의 시합이 벌어진다. 카스트로는 예전에 히소카한테 지긴 했지만 유일하게 다운을 빼앗은 인물. 카스트로는 과거의 패배를 설욕하기 위해 새로운 호교권을 선보인다.

자신의 분신을 만들어내는 넨 능력으로 히소카의 팔을 빼앗는데 성공한 카스트로. 하지만 시호카는 양팔을 잃고도 여유만만한 표정을 잃지 않는다. 그리고 기묘한 마술을 써가며 카스트로를 향해 반격을 시작한다.

두 달 만에 넨 수련을 다시 하게 된 곤과 키르아. 그런데 신참들만 전문적으로 노리는 기드, 사다소, 리르벨트가 곤과 키르아 앞에 나타나 자신들과 싸우자고 조르기 시작한다. 두 사람이 선뜻 허락하지 않자, 사다소, 기드, 리르벨트는 비열한 방법을 이용한다.

곤은 즈시를 미끼로 자신들을 협박한 데 대해 분노를 마음 속에 품고 기드와의 시합에 임한다. 곤은 낚싯대를 휘두르며 두 달 전과는 달리 시합을 완전히 리드한다. 곤의 시합이 끝나자 키르아는 100만 볼트의 전기 채찍을 휘두르는 리르벨트와 시합을 벌이게 된다.

넨 능력의 집대성인 하츠를 습득하기 위해 더욱 더 수련에 힘을 기울이는 곤과 키르아. 곤은 헌터 시험에서 히소키한테 진 빚을 갚기 위해 히소카한테 도전장을 내민다. 곤은 과연 히소카의 얼굴에 일격을 날릴 수 있을 것인가

히소카에게 일격을 날린 곤은 헌터 시험 때 히소카한테 받은 넘버 플레이트를 되돌려준다. 그런 곤의 성장을 보면서 흥분한 히소카는 자신의 넨 능력인 번지껌을 이용해서 곤을 공격하기 시작한다. 곤은 두려움에 떨지만 최선을 다해 싸움에 임한다.

넨 능력을 익히고 진정한 헌터가 된 곤은 키르아와 함께 고향인 고래섬으로 돌아간다. 미트는 곤에게 그동안 숨겨 왔던 아버지 진에 관한 얘기를 털어놓는다. 그리고 곤이 헌터가 되면 전해주라고 진이 맡겨놨던 상자를 곤에게 건네준다.

진이 남긴 상자를 연 곤은 그 안에 들어있던 카세트테이프를 듣는데 그 안엔 진의 목소리가 담겨 있다. 그런데 테이프를 멈추자 그 안의 내용이 모두 사라져 버린다. 이제 진을 찾을 수 있는 단서는 반지와 롬 카드, 이 두 가지뿐이다.

크라피카는 6개월 만에 넨 능력을 습득하고 다시 알선소를 찾아간다. 그리고 요크신에서 열리는 세계 최대의 경매와 관련된 고용주를 소개해달라고 부탁한다. 드디어 환영여단에 대한 복수를 위해 한걸음 다가서는 크라피카.

인체수집가의 집을 찾아간 크라피카. 고용 조건은 리스트 중에 한 가지 수집품을 가져와야하는 것이다. 그런데 그 집을 나서려고 하자 갑자기 괴한들이 습격해 온다. 그 저택을 무사히 빠져나가는 것이 또 한 가지의 고용조건이기 때문. 한편 곤과 키르아는 그리드 아일랜드를 찾기 위해 요크신으로 향한다.

세계 최대의 경매를 앞두고 곤과 키르아는 그리드 아일랜드를 찾기 위해, 크라피카는 환영여단에게 복수하기 위해 열리는 요크신 시티에 머문다. 그리고 그 경매에 나온 보물을 훔치기 위해 살육의 도적집단 환영여단 전 멤버 13명이 요크신 시티에 모였다.

드디어 경매 첫날이 밝았다. 곤과 키르아는 요크신 시티에 도착한 레오리오와 만나게 된다. 그리고 레오리오의 아이디어로 그리드 아일랜드를 낙찰 받기 위한 자금 모으기에 나선다.

한편 크라피카는 네온의 경호를 하면서 경매에 나타날 환영여단을 기다리고 있다

환영여단이 마피아가 관장하는 지하경매장을 습격한다. 그런데 경매장 안에 있던 경매품은 물론이고 그곳에 있던 사람들까지 말끔히 사라져버린다. 마피아 커뮤니티는 습격자에게 현상금을 걸고 추격을 시작한다. 이 사실을 알게 된 크라피카와 경호단 역시 습격자를 쫓는다

마피아 커뮤니티의 비장의 카드 음수 지렁이, 병든 개, 산미치광이, 거머리가 우보긴의에 의해 쓰러진다. 싸우는 과정에서 우보긴의 거미 문신을 보게 된 크라피카는 걷잡을 수 없는 분노와 증오심에 휩싸이고 우보긴과 맞서 싸우려 한다.

드디어 환영여단의 단원 중 한 명인 우보긴을 붙잡은 크라피카. 환영여단에게만 강력한 힘을 발휘할 수 있는 서약의 사슬이 우보긴의 온몸을 옥죈다. 한편, 크라피카는 히소카에게 약속한 장소에서 만나자는 메시지를 받는다

우보긴은 단원들의 도움으로 탈출하지만 자존심에 큰 상처를 입은 나머지 분노에 떨며 크라피카를 찾기 시작한다. 환영여단에게 자신들이 있는 장소가 노출될지도 모른단 걸 깨달은 크라피카는 네온과 동료들을 피신시키고 자신은 환영여단을 기다린다.

동족 쿠르타 족을 몰살시킨 환영여단의 단원 우보긴과 1대1로 싸우게 된 크라피카.

그런데 우보긴은 쿠르타 족에 대해 기억하지 못하고 그 모습을 본 크라피카는 분노한다. 드디어 크라피카와 우보긴의 격렬한 싸움이 시작되는데…

그리드 아일랜드를 손에 넣기 위해서 자금을 모으기 시작한 곤과 키르아, 레오리오. 곤은 골동품 시장을 둘러보다가 값이 나가는 물건을 고르는 방법을 알아낸다. 그런데 곤과 키르아가 물건을 점찍을 때마다 먼저 선수를 치는 사람이 있는데...

환영여단의 목에 걸린 현상금을 타서 그리드 아일랜드를 살 자금을 모으려는 곤, 키르아, 크라피카.

한편 우보긴이 돌아오지 않자 환영여단은 불안해 하고 마치와 노부나가는 사슬잡이를 찾기 위해 인파가 많은 광장으로 나선다. 곤과 키르아는 두 사람의 위치 정보를 입수하고 그들을 미행한다.

환영여단에게 잡힌 곤과 키르아. 여단은 곤과 키르아가 사슬잡이에 대해 모른다고 생각하고 풀어주려고 하지만, 그때 곤이 맘에 든 노부나가가 그걸 막는다. 노부나가는 둘을 여단에 입단시키기 위해 단장에게 의사를 물어보겠다고 곤과 키르아를 가둬놓는다

크라피카는 여단 말살을 위해 마피아가 결성한 암살단 팀에 들어간다.

이 무렵 네온은 혼자서라도 경매에 참가하기 위해 경호단을 따돌리고 몰래 도망친다. 클로로는 네온을 이용해기 위해 혼자 있는 네온에게 접근한다.

우보긴의 복수를 위해 경매가 열리는 세미터리 빌딩으로 쳐들어가는 환영여단. 십로두가 모은 암살단의 킬러들도 클로로의 손에 잇달아 목숨을 잃는다. 예정된 시각에 경매가 열리지 않자 경매장 분위기는 험악해져 가는데, 이때 전설의 킬러 조르딕 가문의 제노와 실버가 여단 말살에 나선다.

환영여단의 우두머리가 죽었다는 소식을 들은 크라피카. 크라피카는 도저히 믿을 수 없다며 자신의 눈으로 직접 보기 위해 시체를 확인하러 간다. 한편 경매는 예정대로 진행되는데 그곳에는 죽었다는 여단 단원들이 모습을 드러낸다.

오랜만에 한자리에 모인 곤, 키르아, 크라피카, 레오리오. 크라피카는 자신의 넨 능력이 특수한 거라는 걸 세 사람한테 설명한다. 이 말을 들은 키르아는 여단에 기억을 캐내는 여자가 있다는 사실을 떠올리고 크라피카에게 위험이 닥칠까 봐 걱정한다. 한편 클로로는 네온에게서 훔친 예지능력으로 단원들의 운을 점친다.

클로로의 점괘를 본 노부나가는 히소카가 우보긴을 팔아넘긴 배신자라고 생각한다. 하지만 그 점괘는 히소카가 몰래 바꿔치기한 것 한편 여단이 아직 살아있다는 걸 알게 된 크라피카는 곤, 키르아, 레오리오의 도움을 받아 파크노다를 납치하기로 결심한다.

클로로는 네온과 크라피카가 연관이 있다는 걸 깨닫고 여단 단원들과 함께 네온이 묵고 있는 호텔로 향한다.

한편 환영여단의 아지트를 감시하고 있던 키르아는 센리츠와 합류해서 환영여단을 뒤쫓는다.

환영여단은 우보긴을 쓰러뜨린 게 크라피카라는 사실을 알아낸다. 환영여단의 손에 붙잡힌 곤과 키르아가 크라피카와 친구라는 사실이 탄로 날지도 모르는 급박한 상황. 클로로는 곤과 키르아를 데리고 호텔 로비에서 파크노다 일행과 만나기로 하는데 갑자기 정전이 된다. 어둠 속을 뚫고 도주를 꾀하는 곤과 키르아. 그런데 불이 켜지자 클로로가 온데간데없이 사라지고 만다.

클로로를 납치한 크라피카는 클로로를 살려주는 대신 곤과 키르아를 풀어주는 조건으로 파크노다를 불러낸다. 한순간 클로로를 눈앞에 두고 고민하는 크라피카. 한편 클로로와의 대결을 고대한 히소카가 여단을 몰래 빠져나와 크라피카 앞에 나타난다.

드디어 전설의 게임 그리드 아일랜드의 경매가 열린다. 곤과 키르아는 그리드 아일랜드를 낙찰받은 대부호 바테라를 찾아가 플레이어가 되겠다고 나선다. 하지만 현재 그리드 아일랜드의 플레이어이자 새로운 플레이어의 심사자인 체즈게라가 두 사람의 넨 능력으로는 어림도 없다고 딱 잘라 말한다. 결국 곤과 키르아는 플레이어 선발 심사를 보기로 결심하고 그전까지 필살기를 연마하기로 한다.

곤과 키르아는 그리드 아일랜드 플레이어 선발 심사에 도전한다. 심사를 담당하는 건 체즈게라이고 시험은 단 한 가지, 렌을 보여주는 것. 200명 중 합격자는 단 32명이라는 치열한 경쟁률을 뚫고 곤과 키르아는 합격할 것인가

진이 남긴 단서를 찾기 위해 그리드 아일랜드의 세계에 발을 들여놓은 곤과 키르아. 두 사람은 정보 수집을 위해 가까운 마을로 향한다. 그리고 그곳에서 게임 클리어를 위해 동료가 되지 않겠냐는 권유를 받는다.

스펠카드를 구하기 위해 마법도시 마사드라로 향하는 곤과 키르아. 그런데 괴물들과 싸우느라 마사드라까지 가는 길은 쉽지가 않다. 그때 두 사람에게 흥미를 가지고 지켜보던 소녀 비스케가 나타난다. 비스케의 목적은 과연 무엇인가?