12岁的小杰为了像父亲一样成为猎人，在达成与扶养他长大的米特阿姨的约定后，踏上猎人试验的旅途。在前往试验会场的船上，小杰遇见了同样是要成为猎人的雷欧力跟酷拉皮卡。他们两人互看彼此不顺眼，进而争执不休。

抵达试验会场所在地的小杰、雷欧力与酷拉皮卡等三人，照着船长的指示走向通往试验会场的捷径。当走到贫民窟时，有位老婆婆率领了一群人在路上等着他们。老婆婆向他们提问，若是答不出来就立刻淘汰。

三人在凶狸狐的带领之下，终于进入试验会场，而会场内也早已经聚集了许多的考生。像是自称试验老手的东巴、散发诡谲氛围的西索、话讲个不停的忍者半藏，以及手持滑板的少年奇犽等。第一次试验即将展开。

第一次试验的内容就是跟着考官萨特次走到第二次试验会场。在单调又见不到终点的路线上，开始陆续出现脱退者。而跟着酷拉皮卡一起跑的雷欧力虽然也跑得越来越吃力，但基于他对猎人的执着，还是一直紧跟在后。在过了80公里后，眼前出现了阶梯，但萨特次的步伐却又加快了。

在通过漫长的地下隧道后，出现在考生面前的是浓雾弥漫的湿地地带。由于视线不佳，考生们一直遭到各式各样的怪物袭击。小杰与奇犽跑在前头，但在后方的酷拉皮卡跟雷欧力眼前，却看到西索被其他考生团团包围。

在与西索对峙之后，小杰等人顺利抵达第二次试验的会场。担任第二次试验考官的门淇与卜哈剌所开出的考题是要考生们做料理。于是考生们为了做出让美食猎人门淇感到满意的料理而努力。究竟，会不会出现令门淇满意的料理呢？

小杰等人在顺利结束第二次试验后，搭上了前往第三次试验会场的飞行船。小杰与奇犽在飞行船内探险时巧遇尼特罗会长，并与其展开对决。而且明明只是从尼特罗手中抢到球的单纯小游戏，却演变成只要赢过尼特罗便能成为猎人。

飞行船抵达的目的地是第三次试验会场陷阱塔的顶楼，只要能在72小时之内，活着抵达地面上就算合格。小杰、奇犽、酷拉皮卡与雷欧力等四人好不容易进入塔内，却陷入了必须凑满五个人才能继续前进的窘境。究竟第五个人会是谁？

小杰等人必须在四场比赛中赢得三场才行。而在第二场时，小杰面临到的比赛是只要让蜡烛的火先熄灭的人就输。却没想到，小杰拿的蜡烛上暗藏玄机。而下一场酷拉皮卡要和连续杀人犯──喳唬进行死斗。酷拉皮卡虽接受死斗，却意外发现喳唬背上有象征幻影旅团的蜘蛛刺青。

本以为在小杰与酷拉皮卡取胜，比分变成二胜一败时，敌人却主张喳唬只是昏过去而已，跟酷拉皮卡之间并没有分出胜负。相对于不愿意给予喳唬最后一击的酷拉皮卡，雷欧力却因为焦虑而显得越来越烦躁。五人之间开始弥漫着不平静的气氛，时间也逐渐一分一秒的过去。

雷欧力跟对方进行的是比剩余时间为筹码的赌局。一回神，雷欧力的筹码竟然只剩下10小时。被逼到无路可退的雷欧力所选的方式是猜拳。雷欧力虽然信心十足，在心理战上却完全败给了对手。二胜二败，在已经没有退路的状态下，胜负的关键就寄托在奇犽身上。

五个人各自度过50小时的等待时间。就在再度前进，以表决克服了重重难关后，就在时间大概只剩1个小时的时候，众人的眼前出现了两扇门。一条是可以五人通行的艰苦远路，另一条则是只能三人通行的简单捷径。五个人又必须再以表决决定要走的路，他们的选择究竟是……

扶养小杰长大的米特一直很担心去参加猎人试验的小杰。就在这时候，米特收到小杰寄来的信，内容提到自在猎人试验一路上所经历的事情、认识的同伴等，还有目前突破的难关。

前往第四次试验考场──赛比掳岛的考生们，在那里所面临到的试验内容，是自己所抽中的号码牌有3分、自己的号码牌也是3分，除此之外的全都是1分，考生必须在一个星期内凑满6分，这样就能过关。而小杰所抽到号码居然是44号！

小杰由嗜血蝶找出他的猎物──西索，并且在一旁企图以拿手的钓竿伺机抢夺西索的号码牌。而另一方面，雷欧力虽被东巴所骗，连号码牌都被抢走了，但在酷拉皮卡相助之下成功夺回。在得知彼此并不是对方的猎物之后，酷拉皮卡与雷欧力组成了共同战线。

酷拉皮卡与雷欧力虽然被西索锁定，但在交涉之后，得以免于一战。不过，无法抑制杀气的西索还是继续寻找下个目标。就在西索攻击目标的一瞬间，小杰成功用钓竿抢到了西索的号码牌，没想到在他准备逃走的时候，号码牌却被其他考生抢走了。

奇犽与尾随他的伊目礼三兄弟战斗，轻而易举地就胜利了。另一方面，小杰与雷欧力跟酷拉皮卡会合，为了抢夺雷欧力的目标－－彭丝的号码牌而拟定计画。三人循着彭丝的气息来到可疑的洞窟，可是雷欧力执意单独进入洞窟之中，没想到……

小杰等人在洞窟当中被毒蛇团团围住，但布下毒蛇陷阱的巴鹏却早已经死亡，无法解除毒蛇的包围，而被毒蛇咬伤的雷欧力情况不断在恶化。后来，小杰总算是顺利通过试验了，但在进行下个试验之前，留到最终试验的考生都必须接受尼特罗的面试。

小杰一行人终于来到最终试验，最终试验是赢的人就能先合格的淘汰赛！在杀了对手即失去资格的规则下，进行的第一场比赛始小杰vs半藏。虽然小杰对半藏毫无招架之力，却也没有认输的打算。最后失去耐性的半藏甚至威胁说要折断小杰的手。

如果奇犽是被迫成为杀手就绝不原谅――对伊耳谜怒气大发的小杰，为了带回奇犽而决定前往枯枯戮山。而萨特次在目送小杰一行人离开的同时，口中还喃喃说着：「猎人试验还没有结束」

小杰、雷欧力跟酷拉皮卡在抵达巴托奇亚共和国后，搭乘观光巴士前往枯枯戮山，却被城墙般的正门给阻挡在外。若是从旁边守卫走的小门进入也会被看门狗给咬死。即使如此，无论如何都要见到奇犽的小杰一行人向守卫自称自己是奇犽的朋友，希望能请他帮忙安排会面，但……

小杰一行人为了见到奇犽而选鹅从「试炼之门」进入，并为了打开门而在佣人的房间锻炼身体。另一方面，奇犽得知小杰等人前来见他。小杰、雷欧力和酷拉皮卡虽发挥特训的成果开门进到里面，却受到实习管家卡娜莉亚阻挠。

小杰等人受到心系奇犽的卡娜莉亚协助而来到宅邸了。可是却从奇曲的口中听到奇犽由于在独居房当中，所以不能见面的讯息。而此时，席巴找奇犽过去，问他「想跟朋友见面吗？」老实回答想见面的奇犽，终于可以到小杰他们身边了。

小杰等人在卡娜莉亚的带路下抵达管家室。在那里遇见的管家梧桐提意用掷硬币来评断小杰究竟适不适合当奇犽的朋友。获得胜利，顺利与奇犽重逢的小杰，又将迈向下个新目标……

在顺利将奇犽带出揍敌客家后，酷拉皮卡、雷欧力与小杰跟奇犽在约定好9月1日友克鑫市再会后而暂时道别了。正愁着不知该往何处去时，奇犽提意到天空斗技场修行，同时赚取旅费。而在前往的途中，小杰寄了封信给米特阿姨，告诉她目前的状况……

小杰与奇犽开始在越往上爬就越能跟强者战斗的天空斗技场修行兼赚钱，并且遇见了一个从1楼立刻升上20楼的同年纪的少年──智喜。在和全身充满破绽的智喜对战当中，奇犽对于智喜企图使出的神秘招式跟面对伊耳谜时有着相似的感觉……

智喜的师父云古，让小杰与奇犽得知名为『燃』的存在。但奇犽对于云古所阐述的说明却持疑。就这么还没掌握到其中隐藏的秘密时，不断比赛的两人终于抵达200楼级……

为了突破在200楼等着的西索布下的『念』壁，小杰与奇犽拜托云古无论如何都要让他们能发动念。眼看着选手登记的时限步步逼近，小杰与奇犽开始进行『念』的基础要素「四大行」之一『缠』的修行。

小杰在天空斗技场200楼级的初战对上了念能力者疾斗。小杰虽然发动着『缠』一边战斗，但在能够随意操纵念力陀螺的疾斗面前，还是只能拼命防守。被逼到穷途末路的小杰不断思考该怎麼做才能持续战斗下去，这时他所采取的行动是……

在小杰身负重伤后又过了1个月，西索与华石斗郎即将要在天空斗技场进行比赛。由于华石斗郎曾让西索倒地，这次也发出了「不会赢就不会比赛」的自信宣言。但西索始终是面带着微笑参加比赛。

华石斗郎以能做出自己分身的念能力顺利进行比赛，并成功废掉西索的手臂。但即使如此，西索的神情依旧泰若自得，丝毫不受影响。接着，西索开始展开反击……

小杰与奇犽在2个月后，再度开始修练念。此时，疾斗、杀大索跟狸狈多三人又出现在他们眼前，并要求小杰、奇犽跟他们比赛。知道他们三人的企图，小杰跟奇犽都拒绝了他们的要求，但从杀大索的态度看来，奇犽不禁在心中抱持着某种疑虑。

面临与疾斗、狸狈多比赛的小杰，将他们利用智喜的怒气收在心里，迎接比赛。小杰不但将疾斗所有招式给接下来，甚至还压倒性地赢得胜利。看着小杰的成长，西索脸上露出一抹诡异的笑容。

为了学会念能力的集大成发，小杰与奇犽更加努力修练。而小杰为了要还当初在猎人试验中欠下的人情，于是决定跟西索交手。为了揍西索脸部一击重拳，再把号码牌还给他，小杰与西索的战斗即将揭开序幕……

击中西索一击的小杰，把西索在猎人试验中拿给他的号码牌还给了西索。看到小杰显着的成长而感到兴奋不已的西索，甚至还使出了自己的念能力攻击小杰。体会到难以言喻的恐怖，小杰决定使出舍身一击！究竟这场比赛，最后会是谁输谁赢？

小杰在学会念能力后，终于成为真正的猎人一员，并带着奇犽回到鲸鱼岛。这时候，米特交给小杰一个盒子，据说是金当年请她转交而托付给她的。但是，不管用再大的力气都打不开那个盒子……

小杰打开金所留下的盒子，听了里面的录音带，里头传出的是金的声音。没想到，只要一停止播放，录音带就自己复写，把原本录进的内容给消除了！于是，金所留下的线索，就只剩戒指跟游戏的记忆卡……

幻影旅团是酷拉皮卡憎恨的对象，在5年前的那一天，亲人、朋友，还有『火红眼』一切全被旅团给夺走了。酷拉皮卡立誓要拿回族人们的『眼球』，将旅团打入地狱深处。酷拉皮卡的战斗，即将展开!

造访人体收藏家宅邸的酷拉皮卡等5人受到神秘的武装集团袭击。酷拉皮卡陆续击退袭击者，冷静查探四周的状况时，发现到一个行迹可疑的人。另一方面，小杰等人也为了金所留下的线索『Greed Island』而前往友克鑫。

世界最大的拍卖会即将在巨大都市友克鑫举行。幻影旅团团员在团长库洛洛的召集之下在这都市集合。在库洛洛告知这次行动的目的后，拍卖会即将开始，杀戮的强盗集团即将开始行动!

拍卖会第一天终于到来。小杰、奇犽与雷欧力为了筹措标下『Greed Island』的资金而四处奔走，酷拉皮卡则是负责监视拍卖会会场的动静。此时，幻影旅团正悄悄潜入拍卖会场。所有人的命运在友克鑫交错了!!

幻影旅团袭击了黑帮所举办的地下拍卖会会场。整个会场被完全压制住，别说是拍卖品，就连参加拍卖的人都全部消失了。于是黑帮给予奖金，通缉袭击会场的人。就连负责守备的酷拉皮卡也跟着前往捕捉袭击者。酷拉皮卡与幻影旅团的相遇就近在眼前了……

黑帮的最终王牌阴兽企图歼灭窝金等人。但窝金一个人便陆续打倒了阴兽成员。在这场战斗中，窝金无意露出背后的蜘蛛刺青！面对寻找已久的幻影旅团成员，酷拉皮卡决定放手一搏……

酷拉皮卡终于抓到幻影旅团中的其中一人－－窝金。然而，窝金即使在被拘束的状态下，仍不改其蛮横的态度，住使得酷拉皮卡对窝近的憎恨更加高涨。此时，酷拉皮卡收到西索传来的简讯……

窝金在同伴的帮助下逃了出来。但是，自尊心受伤的愤怒下，窝金为了打倒酷拉皮卡而开始寻找起他的下落。得知藏身处已经被幻影旅团发现，酷拉皮卡让老板到安全的地方避难后，独自一人等待着幻影旅团的到来……

酷拉皮卡终于和杀害窟卢塔族同胞的幻影旅团成员窝金面对面。然而，窝金却​​对窟卢塔族一点印象都没有，使得酷拉皮卡感到十分愤怒。于是，酷拉皮卡看窝金一对一的决斗终于揭开了序幕……

为了得到贪婪之岛，小杰、奇犽和雷欧力为了筹钱而四处奔走。就在这时，小杰想到了在古董市集寻找值钱物品这个方法。他们想要用低价买进、高价卖出，谁知道他们看上的东西都被人捷足先登了……

小杰等人想用旅团的悬赏金一口气筹到钱。同一时间，玛奇和信长对窝金迟迟未归一事心生疑惑，于是为了寻找锁链小子而现身在人群中。为了打听旅团的情报，小杰和奇犽小心翼翼跟在他们身后，没想到……

小杰和奇犽双双被幻影旅团抓走了。旅团向他们追问有关锁链小子的事，而不知道锁链小子就是酷拉皮卡的两人自然无从回答，眼看就要获得释放，没想到信长却为了要向团长推荐他们入团而将两人关了起来。他们能够从出口被封住的房间逃脱吗？

为了歼灭旅团，黑帮召集了酷拉皮卡等人组织杀手部队。另一方面，独缺酷拉皮卡一人的诺斯拉护卫团则是在照顾妮翁，却没想到才一没注意，妮翁就为了参加拍卖会而趁机逃走了。而此时跟妮翁接触的人，竟然是旅团团长库洛洛…

为了替同伴报仇，幻影旅团潜入了设有拍卖会会场的大楼。十老头所召集的杀手们逐一被团长库洛洛给撂倒。就在会场内不平静的气氛之下，传说中的暗杀者一族揍敌客家的桀诺跟席巴开始进行歼灭旅团的行动。

揍敌客的桀诺（奇牙爷爷）与席巴（奇牙父亲）联手与幻影旅团团长展开决斗,最后幻影旅团团长以及成员皆离奇死亡,酷拉皮卡的复仇似乎也结束了…

小杰、奇犽、酷拉皮卡跟雷欧力等四人久违地齐聚一堂。酷拉皮卡将之前发生的事，以及自己念能力的特殊性告诉其他人。在听了酷拉皮卡的话后，奇犽回想起旅团的幸存者中有个能读取他人记忆的人，担心酷拉皮卡会因此招致危机。而另一方面，库洛洛利用从妮翁身上偷来的能力为团员占卜未来。

西索因库洛洛的占卜而蒙上出卖团员的嫌疑。对于西索为了跟库洛洛一战而不惜窜改占卜内容的赌注，库洛洛将会…？而得知旅团还活着的酷拉皮卡跟小杰等人合作，进行捕捉派克诺妲的计划。

库洛洛试图从妮翁的本性去找出链子杀手酷拉皮卡的所在地。另一方面，监视着幻影旅团基地的奇犽跟旋律会合，察觉到旅团正朝着酷拉皮卡所在的饭店前进。彼此追查对方的旅团跟酷拉皮卡等人，他们的命运之线即将交错…

幻影旅团终于知道酷拉皮卡就是打倒窝金的人。迟早旅团也会知道被他们抓到的小杰跟奇犽其实是酷拉皮卡同伴!?库洛洛带着小杰等人在旅馆大厅与派克诺妲等人碰面。突如其来的停电，小杰、奇犽企图趁着一片漆黑逃走。没想到在察觉到时，库洛洛已经失去踪影了…

酷拉皮卡抓到了库洛洛，并以释放小杰与奇犽为条件跟派克诺妲交涉。眼看着旅团团长就在眼前，酷拉皮卡难掩心中的动摇。究竟酷拉皮卡所采取的报复是…与旅团间的战斗终于迎向终幕了。

寻找金的线索游戏软体贪婪之岛的拍卖终于开始了。小杰与奇犽虽然希望能以玩家的身分让标下贪婪的岛的买家雇用，但对方认为他们两人的实力不足而拒于门外。为了通过玩家审查，两人开始各自进行必杀技的特训…

小杰和奇犽终于要挑战玩家审查了。负责审查的绝兹绝拉所提示的合格条件就只有「发动练」。200名参加者中，只有32名能被录取的合格门槛，小杰与奇犽是否能顺利跨过!?

小杰与奇犽虽然进入到金所留下的线索贪婪之岛的世界当中，但在那里就只有金的留言。决定要好好享受游戏的小杰等人，为了收集情报而前往附近的城镇。在那里，他们受到为了破关而组队的集团邀约…

了寻求咒语卡，小杰与奇犽决定前往魔法都市?玛沙多拉。途中，有各式各样的怪物出现在小杰等人的眼前，他们面对棘手的怪物陷入苦战，一直无法顺利前进。有名少女比司吉似乎很感兴趣地盯着他们两人战斗的模样。究竟比司吉的目的是…