Gon, un chico de 12 años, cumple una promesa que le hizo a Mito-san, la mujer que lo crió, con el fin de obtener el permiso para emprender un viaje para tomar el examen de Cazador y convertirse en un Cazador como lo fue su padre. Mientras navega para el lugar donde será impartido el examen, Gon conoce a Leorio y a Kurapika, quienes también están intentando convertirse en Cazadores. Pero los tres tienen un comienzo difícil...

Gon, Leorio y Kurapika han llegado al lugar donde se impartirá el examen. Siguen el consejo del capitán y se dirigen por un atajo hacia ese lugar. En el camino, pasan por un barrio donde un grupo de señoras mayores esperan por ellos. Las señoras les dicen que deben pasar una prueba que ellas les pondrán o serán descalificados del examen de Cazadores.

Los navegantes llevaron a Gon y compañía al lugar donde se impartirá el examen, donde ya han llegado muchos aspirantes. Entre ellos se encuentra el veterano Tonpa, el espeluznante Hisoka, el conversador ninja Hanzou y un niño con una patineta, Killua. Finalmente está por dar comienzo la primera fase del examen.

La primera fase del examen consiste en seguir al examinador Satotz hasta el lugar donde se celebrará la segunda fase. Un buen número de aspirantes han abandonado el examen debido a esta ardua tarea que no parece tener fin. Leorio, ya muy cansado, corre junto a Kurapika y en su conversación aprenderemos un poco más sobre los motivos para tomar el exmane de Leorio. menos

Los aspirantes final llegan al final del eterno túnel y llegan hacia unos humedales donde son atacados por diferentes monstruos que intentan engañarlos. El grupo se separa en dos, Killu y Gon al frente, y Leorio y Kurapika quedan retrasados. En ese momento ven a un grupo de aspirantes que rodea a Hisoka.

Después de un pequeño enfrentamiento con Hisoka, todos llegan a la segunda fase del examen, donde los reciben Menchi y Buhara, unos Cazadores Gourmet. Para poder pasar a la siguiente fase los aspirantes deberán preparar un plato con cerdo que sea delicioso, aunque parece que no será tan fácil...

Una vez finalizada la segunda fase del examen, los aspirantes suben a una aeronave que los transportará a la siguiente fase. Durante el viaje, Gon y Killua se encuentran con el Presidente Netero, quien les propone un pequeño juego...

La aeronave finalmente llega a su destino, la cima de una prisión llamada Trick Tower. El objetivo de los aspirantes es encontrar un camino hasta la base en menos de 72 horas. Durante ese proceso, Gon y compañía caen en una habitación secreta, y se les plantea un desafío donde deberán decidir todo por mayoría.

Durante el desafío de la votación por mayoría, los cinco miembros del grupo llegan a una habitación donde se tendrán que enfrentar a cinco prisioneros de distintas maneras. El grupo necesitará ganar 3 duelos para poder pasar, mientras que los prisioneros intentan retrasarlos para así poder disminuir sus propias condenas.

Gon y Kurapika ganan sus enfrentamientos, logrando que el grupo tenga ventaja, pero los prisioneros dicen que Majitani solo está inconsciente, así que no dan el enfrentamiento de Kurapika como cerrado. Kurapika se niega a regresar a terminar con Majitani, lo que genera la ira de Leorio.

Leorio sigue en su duelo de apuestas por tiempo con Leorute, y en una situación de desesperación decide recurrir a un duelo de piedra, papel y tijeras.

Encerrados en una habitación, el grupo pasa las 50 horas de penalización por la derrota de Leorio. Cuando por fin salen, se ven obligados a tomar una dura elección para poder pasar a la siguiente fase del examen.

Terminada la tercera fase del examen, Gon le envía una carta a su tía Mito contándole todas las aventuras que ha pasado hasta ahora en el examen.

Empieza la cuarta y penúltima fase del examen de Cazador. Los aspirantes deberán pasar una semana en la Isla Zevil, donde deben quitarles la placa de identificación a su objetivo y evitar que se las quiten a ellos.

Luego de dominar la técnica con la caña de pescar, Gon sale en busca de Hisoka. Mientra tanto, Leorio se encuentra con Tonpa, quien por lo engaña para quitarle su placa.

Mientras Hisoka se decide a atacar a Kurapika y Leorio, Gon lo persigue esperando la oportunidad perfecta para quitarle su placa de identificación.

Derrotado y humillado por Hisoka, Gon vuelve al punto de inicio de la prueba donde se encuentra con Kurapika y Leorio. Entre los tres salen a buscar a Ponzu, el objetivo de Leorio, quien se encuentra oculto en una cueva.

Termina la cuarta fase del examen, y los aspirantes restantes vuelven a la aeronave para ir a donde se celebrará la última fase del examen. Mientras están ahí, el Presidente Netero decide entrevistarlos a todos.

Empieza la última fase del examen, donde los aspirantes deberán enfrentarse en combate hasta que uno se rinda, y en el cual solo quedará un aspirante descalificado. Gon arranca en el primer combate contra Hanzou, quien domina la pelea, aunque Gon niega rendirse.

Gon despierta junto a Satotz, quien le dice que ya ha terminado el examen de selección y que quien ha reprobado es Killua. A continuación Satotz pasa a contarle lo ocurrido a Gon.

Gon se enfada con Illumi, quien le dice que Killua ha regresado a su hogar en la montaña Kukuroo. Entonces Gon y compañía deciden ir a recuperarlo.

Finalmente Gon, Kurapika y Leorio llegan a la montaña Kukuroo, donde se encuentran frente a una enorme puerta que les impide el acceso a la residencia de los Zoldyck.

Gon, Kurapika y Leorio se ponen a entrenar para abrir La Puerta de la Prueba, hasta que finalmente lo logran. Una vez dentro del territorio de los Zoldyck se encontrarán con otro guardia que no desea dejarlos pasar.

Gon finalmente logra quebrar a Canary, quien recuerda cómo conoció a Killua. En el mismo momento en que estaban a punto de pasar, aparece la madre de Killua y su hermana menor para decirle que Killua no los puede ver. Mientras tanto, los demás miembros de la familia Zoldyck debaten qué hacer con Killua.

Gon y los demás llegan a la mansión de los mayordomos, donde el jefe de los mayordomos, Gotoh, los somete a una prueba mientras esperan a Killua.

Gon le envía una nueva carta a Mito y a su abuela, contándole sobre las fases finales del examen de Cazador y la aventura en la residencia de Killua.