Začátek pilotního dvoudílu Stargate SG-1 s názvem Děti bohů (Children of the Gods) se odehrává rok po první misi na Abydos. Plukovník Jonathan "Jack" O'Neill, který po návratu z Abydosu odešel do výslužby, je opět povolán do aktivní služby poté, co hvězdnou bránou pronikne do velitelství stargate (SGC) skupina Jaffů vedená příslušníkem parazitické rasy Goa'uldů Apophisem. Ti napadnou ostrahu střežící bránu, unesou jednu ženu a ostatní členy ostrahy pobijí. Poté, co je O'Neill nucen prozradit, že dr. Jackson žije, je vyslán na Abydos, aby ho přivedl zpět. Tam se od Jacksona dovídá, že existují tisíce bran po celé galaxii.

SG-1 se bránou tajně vydává na adresu, jejíž koordináty přinesl Daniel ze Země v alternativní realitě, kam se dostal interdimenzionálním přenosem pomocí kvantového zrcadla na P3R-233. Ukáže se, že koordináty nesměřují na planetu, ale na goa'uldskou loď patřící Klorelovi, Apophisovu synovi a že tato loď spolu s další lodí pod vedením Apophise míří k Zemi, aby ji mohla zničit. Členové SG-1 se pokoušejí útoku na Zemi zabránit. Umístí po celé Klorelově lodi výbušniny. Jack s Teal'cem zajmou Klorela a pokouší se probudit v něm jeho hostitele Skaaru. Nezbývá jim však mnoho času a lodě se nezadržitelně přibližují k Zemi.