Lors d'une exploration, l'équipe essuie une attaque surprise des guerriers Sodan, des Jaffa qui blessent et capturent le colonel Mitchel. Ce dernier est ensuite conduit au village où il est entraîné pour le combat de la mort, un rituel destiné à réparer sa faute. Pendant que SG-1 le recherche, le colonel constate sur place la présence d'un prêcheur Orii et tente de prévenir le chef Jaffa du danger encourru.

Au retour sur Terre d'une équipe d'exploration, le virus mortel des Orii se répand à travers les Etats-Unis, brandissant la menace d'une quarantaine. Au SGC, Orlin, un Ancien, prend la forme humaine d'un enfant pour aider Sam Carter à fabriquer un antidote. Pendant ce temps, Teal'c constate la soumission de Gerak et sa volonté de convertir tout le peuple Jaffa aux dieux Orii.

Alors que la quarantaine est proclamée sur tout le territoire américain, Orlin s'obstine à terminer sa mission sur Terre au péril de sa vie. L'épidémie Orii grandissante, le colonel Mitchell sollicite l'aide des guerriers Sodan pour capturer un prêcheur, utile à la fabrication d'un remède. Loin de là, la résistance Jaffa contre l'engagement religieux de Gerak s'organise autour de Teal'c, prêt à sacrifier sa vie au nom de la liberté fraîchement acquise.