Al recibir tantas solicitudes de trabajo en el gremio, mientras algunos magos de Fairy Tail trabajan, otros toman un pequeño descanso, entre los magos que trabajan se encuentran Natsu y Gray, quiénes como acostumbran, causan problemas y discusiones entre ellos mismos, por lo que deciden no volver a trabajar juntos, sin embargo, una de las peticiones para Fairy Tail era de nuevo para ellos dos y es realizada por uno de los 10 Magos Santos, Lucy, Erza, Wendy, Happy y Charle toman la petición junto a ellos para evitarlos de problemas, en su viaje platican con el dueño de la petición Warrod Sequen, quien comparte un lazo importante con el grupo que va a visitarlo para cumplir su petición.

Mientras los magos intentan conseguir el goteo de luna de las manos de los cazadores, por alguna extraña razón, Erza se ha convertido en una niña, luego de algunos sucesos, la batalla de magos y cazadores se detiene debido a una voz que Natsu logra escuchar y aparentemente conoce, al buscar de quién es la voz se encuentra con Doriate, un miembro del gremio oscuro Succubus Eye, mismo al cual se ha unido Minerva, quién aparece para confrontar a Erza, además de revelar el motivo por el cual se encuentra convertida en una niña.

Las batallas en el Pueblo del Sol dan inicio, Lucy, Flare y Wendy deberán demostrar el poder de los magos frente a los cazadores de Sylph Labyrinth, mientras Natsu continúa buscando la voz que había escuchado, Happy y Charle se encuentran en problemas, pues tienen cerca de ellos a un monstruo del gremio Succubus Eye, Erza enfrenta a Minerva y Gray se encuentra con Doriate, el causante de la apariencia de niños y la falta de poder de los magos de Fairy Tail.

Luego de haber sido convertido en niño, Gray toma la determinación para luchar contra Doriate, Erza aún convertida por la magia de Doriate, se encuentra en problemas frente a Minerva, quien la tiene bajo amenaza de muerte, mientras Gray lucha contra Doriate, el mago de Fairy Tail hace un descubrimiento sobre el hielo que congela al Pueblo del Sol además de conocer la verdadera forma de su oponente.

La batalla contra Doriate ha culminado, sin embargo aún queda en pie el Monstruo de Succubus Eye contra quien se enfrentará Natsu mientras Gray intenta salvar a la Llama Eterna, que es realmente alguien a quien los magos de Fairy Tail conocen de un poco de tiempo atrás, la batalla entre Erza y Minerva llega también a su fin, y el rostro del culpable del congelamiento en el Pueblo del Sol es revelado.

Los magos han completado la misión de Warrod con éxito, para festejarlo, ellos comen, beben y se divierten con los gigantes del pueblo llegando incluso a olvidar los incidentes sobre los que se enteraron ese día, Minerva regresa a su gremio, el cual encuentra en un estado en el que no se esperaba y donde conocerá a Kyouka, una miembro de Tártaros gremio sobre el cual Warrod habla un poco a Natsu, Lucy, Erza, Gray, Wendy y los Exceed que han regresado junto al mago santo, además de escuchar sobre el demonio más ruin de los libros de Zeref, E.N.D.

Los miembros del Consejo Mágico se reúnen dentro de Era para tomar acuerdos y discutir sobre temas relacionados al mundo de la magia, incluido el último gremio de la Alianza Balam, Tártaros, quiénes mostrarán ante éstos los alcances de su fuerza. Los magos d Fairy Tail hablan sobre lo que escucharon y vivieron durante su misión en el Pueblo del Sol, E.N.D., Zeref y Minerva son algunos temas dentro del gremio hasta que se enteran del peor incidente que jamás imaginaron sucedería, los miembros de las Nueve Puertas del Demonio de Tártaros inician su movimiento dentro del mundo mágico ¿cuál será el objetivo de éstos personajes?

Laxus enfrenta a uno de los demonios de Zeref, su nombre es Tempester, nombre que él olvida por algunas circunstancias, la batalla parece fácil, pero llevara resultados fatales, los magos de Fairy Tail deciden defender su orgullo y enfrentar a Tártaros, además de proteger a los antiguos miembros del Consejo Mágico, a quienes los miembros del último gremio de la Alianza Balam buscan para asesinar a toda costa.

Ante el objetivo de proteger a Michello y recuperar el orgullo de su gremio, Natsu, Lucy y Wendy luchan contra Jackal, el bombardero de Tártaros, quién resulta ser un oponente más fuerte de lo que esperaban, ante la desesperación de ser asesinado, Michello intenta escapar a recordar que cree saber el por qué Tártaros busca asesinar a todo aquel que haya sido miembro del consejo.

Natsu logra controlar la ventaja que tiene Jackal sobre su maldición, por lo que ahora es él quien toma la ventaja en la batalla hasta que Jackal muestra su verdadera forma, los magos de Fairy Tail que irían a proteger a los ex concejales encuentran algunas desgracias, especialmente Elfman y Lisanna quienes enfrentan a la demonio de Tártaros, Seilah, Michello revela la existencia de Face y los alcances de ésta si cae en manos del último gremio oscuro de la Alianza Balam.

Las dos magas más confiables de Fairy Tail, Erza y Mirajane se disponen a proteger a toda costa a Crawford Theme, el ex presidente del consejo, sin imaginar que están a punto de caer en una trampa, Natsu ata cabos y nota que hay alguien dando información del consejo dentro de Tártaros, Seilah continúa bajo su control a Elfman y Lisanna, luego de caer en la trampa, Erza y Mira se convierten en prisioneras de Tártaros, la primera es interrogada y torturada para dar información sobre el tercer sello mágico de Face, Jellal quien deberá encargarse de los criminales que han sido puestos en libertad, los miembros de Oración Seis.

Ante el escándalo que ha provocado Natsu dentro de Tártaros, Kyouka instruye a Yakdoriga para vigilar a Erza y poder salir a ver qué ocurre, Natsu enfrenta a Franmalth, pero Silver aparece y es capturado junto a Lisanna que ha sido derrotada por Seilah, Jellal continúa su lucha contra Oración Seis, mientras Elfman al servicio de Seilah se encuentra por causar un gran desastre.

Silver se dirige hacia la celda donde Natsu y Lisanna se encontraban para ofrecer agua a ésta última, la tortura de Erza por parte de Kyouka y Yakdoriga continúa, al igual que la batalla de Jellal vs. Oración Seis, la cual por fin tiene alguien victorioso, Tártaros logra retirar el sello de Face, la estancia de Minerva, Jackal y Tempester dentro del laboratorio de Tártaros es culminada mientras Elfman es aún controlado por Seilah, quien tiene preparada una gran sorpresa para las hadas de Fairy Tail.

Kana logra salvar a sus compañeros de la explosión ocasionada por Seilah, al mismo tiempo logra llevarlos hasta el Cubo, en donde enfrentan a los soldados de Tártaros, el contraataque no sólo es externo pues dentro de la sede de Tártaros, Mirajane despierta mientras Lamy desea convertirla en algo horrible, Erza se libera de las cadenas y Yakdoriga para ser ahora ella quien pone a Kyouka en desventaja, Lisanna y Natsu logran también liberarse, sin embargo éste último se encontrará con quien menos se lo espera.

Zeref ha aparecido ante Natsu, éste le advierte sobre la existencia de su demonio más fuerte y la decisión que deberá tomar cuando descubra su identidad, por otro lado, los magos de Fairy Tail entran al castillo de Tártaros gracias a la ruptura creada en el Cubo por Erza, quien aún lucha contra Kyouka, allí dentro los magos enfrentan a los demonios de Tártaros, Lucy y Wendy descubren que Face está a sólo minutos de activarse y deciden ir a detenerlo aún cuando Keyes y Franmalth se convierten en un obstaculo para salir a cumplir con su misión.

Natsu, Lucy y Happy enfrentan aún a Franmalth, quien muestra el rostro del alma más poderosa que ha absorbido, rostro ya conocido por sus tres oponentes, mientras Mirajane inicia su enfrentamiento contra Seilah, Erza continúa su batalla contra Kyouka así como Gray lo hace contra Keyes, faltando sólo unos minutos para la activación de Face, Wendy llega al sitio en dónde se encuentra dicha arma, sin embargo antes de poder desactivarla tendrá que enfrentar a una de la Nueve Puertas del Demonio; Ezel.

Wendy ha obtenido su Dragon Force y a pesar de que aún así no le resulta nada fácil ella logra derrotar a Ezel, los magos de Fairy Tail no cesan sus batallas contra los demonios de Tártaros, Gray vs. Keyes, Mirajane vs. Seilah, Lisanna vs. Lamy, Erza vs. Kyouka entre otros que necesitan de su magia para poder sobrellevar una batalla, a pesar de destruir gran parte de Face, el arma no se detiene, y la última alternativa para Wendy es confiar en las premoniciones de Charle para detenerla.

Wendy ha detenido Face, los magos luchan aún con la ayuda de sus poderes, mientras Natsu, Lucy y Happy viven los últimos momentos de lucha contra Franmalth y la advertencia de un alma presente en la batalla, Erza lucha contra Kyouka, quien decide dejar la batalla a Minerva, en el laboratorio de Tártaros, Mirajane y Lisanna prosiguen su batalla contra Seilah y Lamy, y al mismo tiempo Oración Seis dialoga sobre la propuesta que tenían de Jellal.

Jellal, Meredy y los miembros de Oración Seis se detienen unos momentos, mientras Hoteye revisa los ojos de Jellal junto a Meredy, Midnight, Ángel, Cobra y Racer meditan la propuesta del líder de Crime Sorcière, allí se encuentran con un antiguo miembro de Grimoire Heart, Rustyrose, quien les cuenta por lo que ha pasado desde hace un tiempo atrás, entre sus revelaciones él les dice que las Nueve Puertas del Demonio no son todo el terror de Tártaros, pues hay alguien más detrás de todos ellos.

Mirajane se encuentra en desventaja ante Seilah, quien muestra su abrumador poder, ante ésto Mira recuerda un poco acerca de su doloroso y triste pasado para que posteriormente la batalla tenga al fin una ganadora, mientras Kyouka hace una visita al Rey del Inframundo, Mard Geer, el verdadero terror de Tártaros se muestra para castigar a su subordinada y dar una lección a Fairy Tail con Alegria.

Ante la activación de Alegria, Lucy queda sola en el interior de Plutogrim, el Rey del Inframundo ha notado ésto y da la orden de matarla, Lucy lucha contra el ejército inicialmente para posteriormente enfrentarse a Lamy y dos de las Nueve Puertas del Demonio, ante la desesperación y el anhelo de rescatar a todos sus amigos de los efectos de Alegria, Lucy se determina y arriesga hasta su última carta para enfrentar al mal absoluto.

Lucy ha logrado invocar al Rey de los Espíritus Celestiales tras el sacrificio de la llave de Aquario, al ser invocado, el Rey Espíritu decide luchar contra Mard Geer para hacer pagar a Tártaros las lágrimas que han derramado sus "viejos amigos". Haciendo frente a su dolor, Lucy encara a Jackal quien aún se encuentra en pie luchando contra ella mientras al mismo tiempo la batalla del Rey Espíritu y el Rey del Inframundo se lleva a cabo.

La batalla de hadas vs. demonios no se detiene, Natsu, Juvia, Gajeel y Gray se encuentran cara a cara con Tempester, Keyes, Torafuzar y Silver, dando inicio a una nueva batalla, Wendy y Chale, quienes fueron salvadas por Doranbolt de la explosión de Face descubren una verdad terrorífica y llena de desesperación sobre ésta arma. Por otra parte Erza y Minerva deciden arreglar sus antiguos problemas en una revancha final para posteriormente conocer en persona al Rey del Inframundo y que a Minerva llegue una sorpresa que jamás había esperado.

Los Dragones gemelos de Sabertooth se integran al campo de batalla, Mard Geer revela a éstos dos así como a Erza y Minerva la existencia de 3.000 bombas de Face, al notar que éstas pueden ser todas activadas de cierto modo Erza y Minerva junto a Frosch y Lector deciden ir a detener su activación, mientras en otra parte la intensidad de la batalla entre Gajeel, Juvia y Natsu contra Torafuzar, Keyes y Tempester aumenta, en dicha batalla Juvia tiene un presentimiento que la deja intranquila, pues en otra parte de las ruinas del Cubo, Gray se enfrenta a Silver, quien tiene para el mago de Fairy Tail algunas sorpresas que lo harán entrar en la desesperación total.

Ante la revelación de Silver diciendo ser Deliora, Gray entabla una batalla llena de ira y desesperación contra su oponente, mientras Natsu, Gajeel y Juvia continúan intentando vencer a Tempester, Torafuzar y Keyes, éste último se encarga de torturar a Juvia hablando de Gray y el rival al que se estaba enfrentando ¿cómo logrará Gray salir del miedo y la desesperación que puede provocarle estar frente al demonio que le arrebató todo?

Gray logra darse cuenta de la mentira de Silver, quien no era realmente Deliora sino su padre mismo, o más bien su cadáver siendo manipulado por la maldición de Keyes, demonio que enfrenta aún a Juvia quien escucha la voz de Silver pidiéndole que se deshaga de Keyes para poder permitir a su cuerpo descansar en paz, además de detener al cadáver del ex presidente, pues es controlado por la necromancia de Keyes y está activando los 3.000 Face, ante la petición de Silver, Juvia entra en preocupación al preguntarse si realmente debe contribuir en el descanso y desaparición del padre del hombre al que ella ama.

Bajo el oscuro cielo de noche, los demonios de Tártaros van siendo derrotados poco a poco, sin embargo aún quedan algunos en pie, tal es el caso de Mard Geer quien lucha aún contra Sting y Rogue mientras Erza, Minerva y los Exceed buscan sin parar la sala de control obligando a Franmalth a dirigirlos, Natsu y Gajeel enfrentan a Tempester y Torafuzar, al mismo tiempo Lucy cuida de la agotada y envenenada Juvia, sin imaginar que les falta conocer las oscuras profundidades del Hades que Torafuzar tiene para ellos.

Gajeel consigue proteger a Levy de ser atacada por Torafuzar, la batalla bajo las oscuras aguas de Tenchi Kaimei continúa, para recobrar un poco de su fuerza, Gajeel recuerda a Belno, la fallecida ex miembro del consejo y su promesa de vengar dicha muerte causada por Tártaros, luego de finalizar la batalla contra Torafuzar, Tempester queda aún en pie, ante el agotamiento de Gajeel para seguir luchando, otro miembro del gremio aparece para hacer pagar a el inmortal el daño que ha causado a sus amigos.

Con la poca fuerza que le queda y la gran voluntad que tiene, Laxus enfrenta a Tempester en un reñido duelo para hacer pagar al demonio el daño que ha causado a sus amigos, así como para conseguir su sangre para crear un antídoto que cure su envenenamiento y el de sus compañeros dañados por las Partículas de Barrera Mágica. En otro lugar de las ruinas, Erza, Minerva y los Exceed llegan al sitio donde estaba la sala de control, lugar donde el cadáver del Ex Presidente activa los 3000 Face siendo controlado por Seilah, quien aparece junto a Kyouka frente al grupo de Erza para dar paso al duelo final entre las hadas y las Nueve Puertas del Demonio.

Erza se encuentra ante Kyouka una vez más, ante ella y la desesperación por la cercana activación de Face comienza el combate entre el hada y el demonio, el cual se ve interrumpido de manera muy rápida debido a un rugido que estremece a todo aquel que lo escucha, las alas de la desesperación así como las alas de la esperanza se acercan al campo de batalla para dar un giro inesperado a la situación.

Igneel finalmente aparece ante la llegada de Acnologia al campo de batalla, Natsu busca aclarar todas sus dudas acerca de los motivos de Igneel para desaparecer en su interior, antes de poder explicar nada y mientras lucha contra Acnologia, el dragón da instrucciones a Natsu para quitar a Mard Geer el libro de E.N.D. por lo que Natsu entabla una batalla contra el demonio, quien posteriormente busca a Kyouka mediante la telepatía para darle instrucciones sobre la cercana activación de Face.

Kyouka ha entrado en su forma Etherias al convertirse en un controlador de tiempo para la activación de Face, Erza se enfrenta a ella y su maldición del Reforzamiento, que le permite incrementar su fuerza a cada segundo, mientras Kyouka acelera la cuenta regresiva de Face los otros magos observan la feroz batalla entre Igneel y Acnologia, el dolor extremo se hace presente en la batalla de Erza, quien deberá confiar en la luz que la guía para resistir hasta que llegue el momento de la desesperación que podría significar el final de los magos y todo el mundo mágico.

La historia se translada a 20 minutos antes de la activación de Face, Natsu continúa su lucha contra Mard Geer mientras al mismo tiempo Igneel combate contra Acnologia por los cielos, Lisanna, Elfman, Jet y Droy enfrentan a la gran cantidad de clones de Lamy aparecidos con anterioridad logrando finalmente acabar con ellas, en el mismo escenario aparece Lucy quien les informa la situación de Gajeel, Juvia, Levy y Laxus. En el escenario de batalla entre Natsu y Mard Geer aparecen Sting y Rogue para ayudar en la lucha contra el Rey del Inframundo. Mientras tanto Wendy se reúne con Lucy y sus compañeros que la acompañaban contando sobre la existencia de los 3.000 Face, ante la desesperante situación Makarov revela lo que puede ser la última esperanza para su victoria.

Makarov llama a los magos que están reunidos en las ruinas del Núcleo del Infierno mediante Telepatía para que vayan al sótano del gremio y se tomen medidas con Lumen Histoire, mientras la batalla de Igneel y Acnologia continúa por los cielos, Natsu, Sting y Rogue hacen frente a Mard Geer, quien revela la causa de existencia de los Etherias no mucho antes de que Gray llegue a la batalla y junto a Gray otro demonio que los magos ahí presentes habían conocido como humano, todo ésto para dar paso a las últimas y feroces batallas.

El tiempo para la activación de Face se reduce cada vez más sin detenerse, Sting y Rogue luchan dispuesto a derrotar a Jiemma para dejar atrás definitivamente el mundo de oscuridad y terror que hubo en Sabertooth, mientras Erza continúa tratando de detener a Kyouka y a su vez la activación de Face. Por otro lado, Natsu y Gray prosiguen en su batalla contra Mard Geer Tártaros, quien en su forma Etherias muestra a los magos el poder demoníaco de Tártaros, así como su maldición definitiva.

Gray consigue proteger a Natsu de desaparecer ante Memento Mori, sorprendido, Mard Geer pierde el control y la cordura lo que le hace perder también la batalla, sin embargo el contador de Face ha llegado a 00:00, Erza no ha conseguido detener a Kyouka y las 3.000 bombas comienzan a activarse, los gremios que participaron en los Grandes Juegos Mágicos así como Twilight Ogre intentan destruir los Face que se encuentran cerca de ellos, pero todo resulta inútil. En medio de la desesperación por el fin de la magia nace una nueva esperanza de entre el nocturno cielo de Ishgar y la historia comienza a dar un giro inesperado.

La esperanza de la humanidad regresa, los dragones que adoptaron a los Dragon Slayer han sido liberados y comienzan a destruir todos los Face que han aparecido, los humanos son testigos del giro inesperado que ha dado la situación. Mientras por otro lado Gray y Natsu se disputan aún el futuro del libro de E.N.D. sin considerar que el futuro de dicho libro no sería ninguno de los que ellos tenían planeado, la batalla entre Igneel y Acnologia no se detiene, pero no por mucho tiempo pues ha llegado el momento de poner fin a la batalla entre el Rey Dragón de Fuego y el Dragón Negro del Apocalipsis.

La batalla ha terminado y junto a ello la hora de los dragones para despedirse de los humanos, mientras algunos de los dragon slayer consiguen hablar con sus respectivos padres adoptivos Natsu envuelto en lágrimas lamenta la dolorosa partida de Igneel quien antes de marchar del mundo físico alienta a Natsu a continuar adelante. Ante las cicatrices físicas y emocionales luego de la guerra contra Tártaros, los magos siguen su camino, aunque Makarov toma una decisión que cambiará el rumbo de los miembros de Fairy Tail, especialmente Lucy, quien no sólo debe afrontar la decisión de Makarov sino también la de Natsu y Happy.