Interrompant Natsu et Grey dans leur bagarre, Gajil demande au premier de le suivre, avec Wendy. Une marche souterraine mènera les trois Chasseurs de Dragons, accompagnés de quelques curieux, a un étrange cimetière.

Dans le « cimetière des dragons », Natsu et les autres voient apparaître le capitaine Arcadios, qui demande au petit groupe de le suivre. L’officier les fait entrer dans le palais du roi, leur montre la porte de l’Éclipse, et leur révèle la véritable fonction des Grands Jeux magiques. Mais ses explications sont brutalement interrompues par le ministre de la Défense.

Quand commence l’épreuve finale des Grands Jeux magiques, l’équipe Fairy Tail fait preuve d’un immobilisme inattendu. Pendant ce temps, Mirajane a une idée insolite pour s’infiltrer dans le palais avec Natsu et les autres.

Suite de l’épreuve finale des Grands Jeux magiques. Grey est d’emblée mis en difficulté par Rufus, qui réactualise des sorts millénaires et les combine à sa façon. Mavis avait prédit ce scénario mais elle sait que la force des sentiments fait parfois mentir les calculs.

Pour que Sabertooth remporte les Jeux, Minerva mise sur la nouvelle force de Sting, une force née, selon elle, de son attachement à son compagnon disparu. De leur côté, Natsu et ses compagnons ne trouvent pas la sortie du Palais des Enfers dans lequel on les as fait chuter. Jusqu’au moment où ils découvrent une étrange faille, que l’on croirait créée artificiellement.

Dans le Palais des Enfers, la bataille fait rage entre le groupe de Natsu et l’Ordre des Loups affamés. Yukino découvre Mirajane sous sa forme démoniaque, avant que Kamika, la magicienne du papier, n’inflige aux « criminels » de Fairy Tail un rude handicap.

Tombée en ordre dispersé au niveau inférieur du Palais des Enfers, l’équipe de Natsu poursuit séparément le combat face à l’Ordre des Loups affamés. Arcadios se sacrifie pour sauver de la lave Lucy et Yukino, sans qui le projet Éclipse est irréalisable. Une vieille connaissance apporte les clés des deux constellationnistes qui vont pouvoir se battre sérieusement…

Toujours prisonniers du Palais des Enfers, Natsu et ses compagnons affrontent séparément les chevaliers de l’Ordre des Loups affamés. Assaillie par les papiers de Kamika, Mirajane décontenance son adversaire par ses réflexions sur le vrai rôle de la magie. Pour tenter de faire plier Uosuke, Lucy a fait appel à Aquarius qui, toutefois, n’est pas d’humeur à se battre.

Errant dans le Palais des Enfers, Natsu et sa bande trouvent enfin une immense porte, qui ne tarde pas à s’ouvrir sur une mystérieuse silhouette. Datong, qui a deviné le double-jeu de Hisui, rend une visite improvisée à la jeune princesse pour la presser de renoncer au projet Éclipse. Au stade, l’équipe Fairy Tail continue d’appliquer les calculs infaillibles, ou presque ? – de Mavis.

Au Palais des Enfers, Natsu et ses compagnons ont rencontré le sosie de Lucy. Affirmant venir du futur, la jeune fille leur annonce que le pays risque de disparaître le lendemain. Dans l’ultime épreuve des Grands Jeux magiques, Minerva, opposée à Erza et Kagura, retient toujours Miliana prisonnière. Pendant ce temps, la princesse Hisui explique à Datong que la Porte d’Éclipse est prête à être ouverte, maintenant qu’elle l’a déverrouillée.

Le groupe de Natsu erre toujours dans le Palais des Enfers, en quête d’une introuvable sortie. Au cours de l’ultime épreuve des Grands Jeux magiques, Ezra réussit à contrer Archenemy, l’épée de Kagura, avant de révéler à son adversaire qu’elles se sont déjà croisées il y a bien longtemps, dans des circonstances tragiques.

Après avoir annoncé que dix mille dragons allaient attaquer le royaume, la Lucy du futur confesse qu’elle n’a aucun plan pour éviter la catastrophe. Tout comme Jellal, Arcadios relève des contre-vérités dans le récit de la jeune fille, et doute de sa bonne foi. Dans l’ultime épreuve des Grands Jeux magiques, Rogue révèle à son adversaire Jellal qu’ils se connaissent de longue date…

La dernière épreuve des Grands Jeux magiques s’approche de son dénouement. Gajil parvient à se transformer en ombre pour mieux combattre son adversaire Rogue, dont il a absorbé l’élément magique. Au palais, les soldats chargés de stopper le groupe de Natsu reçoivent le renfort de l’Ordre des Loups affamés.

L’ultime épreuve des Grands Jeux magiques touche à sa fin. Suivant l’événement à distance, la princesse Hisui va pouvoir vérifier la fiabilité des prédictions qu'on lui a données. Pour s’évader du palais, Natsu et son groupe tentent de forcer les rangs des soldats royaux. Ils doivent alerter au plus vite leurs camarades sur la menace du projet Éclipse.

La victoire de Fairy Tail aux Grands Jeux magiques est accueillie dans le stade par des acclamations tonitruantes. Au palais, le groupe de Natsu est toujours bloqué par l’Ordre des Loups affamés, renforcé par des gardes royaux toujours plus nombreux. Jusqu’à l’irruption d'un phénomène singulier, généré par un personnage non moins étrange.

La Lucy du futur est morte, mais a passé son message à son alter ego du présent. Pourtant le Rogue venu lui aussi de l'avenir est bien décidé à tuer la jeune fille. Mais Natsu n'est pas du genre à laisser tomber ses camarades. Pendant ce temps, le projet Éclipse est sur le point de démarrer, et toutes les guildes sont sur le pied de guerre.

Lucy supplie la princesse Hisui de refermer la porte d’Éclipse, qu’elle soupçonne de constituer un passage avec l’époque où le monde était peuplé de dragons. Des craintes vite confirmées par l’apparition d’une gigantesque silhouette. D’après l’analyse de son esprit Crux, Lucy doit pouvoir fermer elle-même la porte grâce à ses pouvoirs de constellationniste.

Ayant aperçu Natsu accroché au sommet d’une tour, le Rogue du futur ordonne à son dragon de le tuer. Ailleurs dans la ville, les mages se cassent les dents sur les autres dragons ; même Sting et Rogue, pourtant censés en avoir tué chacun un, étant enfants. Une question taraude Makarof : le nombre de dragons, sept, a-t-il une signification particulière ?

Natsu et le Rogue du futur continuent à s’affronter sur Atlas Flame. Du ciel, celui-ci lâche soudain sur la ville une multitude d’œufs, dont éclosent de petits dragons. Fairy Tail s’adapte à la situation : Luxus et Gajil affronteront chacun l’un des sept grands dragons, et le reste de l’équipe devra détruire ceux sortis des coquilles. De son côté, Zilkonis se demande par quel humain il va commencer son festin.

La bataille fait rage entre les guildes et les dragons. Luxus et les membres de l’unité Raijin lancent chacun une attaque sur Atlas Flame, sans succès. Largué par Happy sur ce même dragon, Natsu adopte une tactique originale : dévorer les flammes de son adversaire pour acquérir plus de force. Atlas Flame devine rapidement que ce jeune humain a des liens étroits avec son vieil ami Ignir…

Dans Crocus en ruines, Erza empêche Miliana d'attaquer Jellal à qui, pour sa part, elle a accordé son pardon. Ultia fait irruption à son tour, elle révèle à Miliana qu'elle à joué un rôle majeur dans la mort de Simon et la construction de la Tour du Paradis. Sting rejoint Rogue pour combattre en duo les deux dragons géants qu’ils affrontaient séparément. Pendant ce temps, Natsu et Atlas Flame poursuivent leur combat contre le Rogue du futur et Motherglare.

Dans Crocus en ruines, la situation vire au rouge pour Fairy Tail et les autres guildes. Grey gît à terre, transpercé par les rayons des dragons. Seule la magie régénératrice de Chelia pourrait peut-être le sauver. Natsu avale des flammes pour récupérer de ses blessures mais le Rogue du futur est déterminé à en finir avec lui. Face à l’urgence, Ultia décide d’utiliser une magie temporelle dont elle a appris l’existence durant son enfance. Elle sait pourtant que le prix à payer sera terrible pour elle.

Invoqués au complet par Lucy et Yukino, les douze esprits se jettent en même temps sur la porte pour la détruire. Celle-ci encaisse une masse phénoménale d’énergie magique, mais qui ne l’ébranle en rien. Pendant ce temps, le Rogue du futur révèle à Natsu, en plein combat, qu’il n’a pas l’intention de retourner à son époque, et que, tôt ou tard, il fusionnera avec son autre « moi ».

Tous les mages sont conviés par le roi à une fête fastueuse en l’honneur de leurs exploits durant les Jeux puis la bataille qui a enflammé Crocus. Les filles de Fairy Tail se préparent au vestiaire, avant de rejoindre la grande salle du palais où la soirée bat déjà son plein. Mais l’absence de Natsu commence à intriguer ses camarades.

Au lendemain de la grande fête donnée au palais royal, les mages de Fairy Tail s’apprêtent à repartir pour leur ville de Magnolia. Pour Natsu, sujet au mal des transports, le voyage en fiacre s’annonce pénible. Jellal et Meldy cherchent Ultia en vain. Jellal redoute une catastrophe si le Conseil de la magie a vraiment appris que la famille royale avait utilisé de la magie noire. Mais heureusement, Lahar a effacé les souvenirs des membres de l’assemblée.

Les Jeux magiques sont terminés et tout le monde se remet de l'événement. C'est l'occasion rêvée pour Frosch et Lecter d'aller faire du shopping en ville. Malheureusement, ce dernier va perdre son compagnon de vue dans la foule. Toute la guilde Sabertooth va donc se mettre à la recherche de leur petit ami, et aller de surprise en surprise…

La guilde Fairy Tail a reçu de son dernier client des tables de billard en plus de la rétribution habituelle. Comme d'accoutumée avec ses membres, les parties ne se déroulent pas tout à fait comme elles le devraient. C'est alors qu'Erza débarque et raconte à tout le monde l'anecdote d'une rencontre étroitement liée au billard…

Pour remercier ses Esprits de leur bravoure durant la bataille contre les dragons, Lucy a l'idée de les appeler ses Esprits un par un sur la Colline des Étoiles, et d'exaucer un souhait à chacun. Elle est accompagnée par Yukino, qui entend également récompenser ses Esprits. Natsu et Happy, quant à eux, ont promis de venir aider. Lorsque Lucy entame sa série d'invocations, elle s'aperçoit vite que ses Esprits ont des envies pour le moins inattendues.

Le pays est frappé par des phénomènes météorologiques étranges et des dérèglements de la nature. Pour réparer les dégâts, les populations font abondamment appel aux mages de Fairy Tail. Natsu et Lucy partent en direction de la mer pour accomplir une mission requérant impérativement la présence d’un mage constellationniste. Toutefois, à leur arrivée, ils ne trouvent aucune trace du village indiqué. Puis, rapidement, Lucy s’aperçoit que ses pouvoirs sont perturbés.

Yukino a mené au siège de Fairy Tail un grimoire susceptible de contenir des explications sur l’apparente révolte des Esprits des Douze Clés d’or. L’ouvrage est écrit dans une langue ancienne que même Reby a un certain mal à comprendre. Pour en savoir plus sur la situation, Lucy invoque une nouvelle fois Crux. Celui-ci révèle aux mages présents l’existence d’un rituel censé apporter la « liberté parfaite » aux Esprits des Douze Clés d’Or. Seul moyen de contrarier les plans de Loki et compagnie : s’emparer d’un mystérieux globe céleste, sans lequel le rituel ne peut pas être accompli. Lucy, Yukino, Natsu et Reby se rendent à la bibliothèque magique de la ville pour tenter de localiser le fameux globe en se plongeant dans les archives…

Lucy, Natsu et les autres ont fait une terrible découverte : la « liberté parfaite ». Une fois acquise, elle ne laisse aux Esprits que douze jours à vivre. Le groupe part donc à la recherche d’Astral Spiritus pour empêcher les Esprits d’y accomplir le rituel qui donne accès à ce « graal » funeste. À la périphérie de Magnolia, ils rencontrent par hasard Arcadios et la princesse Jade. Celle-ci apporte des clés destinées à renvoyer de force les Esprits dans leur monde…

La troupe de Natsu se lance vers l'Astral Spiritus et interrompt la cérémonie censée donner aux 12 Esprits de Lucy la Liberté parfaite. Ces derniers sont parfaitement conscients que cette liberté leur coûtera leur existence, mais n'en démordent pas malgré la tentative de Lucy de les ramener à la raison. Il ne reste plus alors qu'une solution : utiliser les clés apportées par la princesse Jade…

À Astral Spiritus, Hisui et Acradios suivent sur un écran les duels qui opposent les mages de Fairy Tail aux Esprits des Douze Clés d’Or. Tandis que Virgo montre à Lucy comment on se sert d’un fouet, Leo explique à son adversaire Natsu ce que signifie l’assombrissement de ses flammes. Kanna, quant à elle, affronte Scorpion aux cartes magiques, mais ignore toujours les règles de la partie. Dans un parc d’attractions, Aquarius veut forcer Wendy à jouer à des jeux destructeurs qui la mettent aux abois…

Les duels font rage entre les Esprits célestes et les mages. Opposée dans un quiz à Capricorn, Reby chute sur la première question. Pendant ce temps, Mirajane vient à bout de Pisces, non sans avoir conseillé à la mère et au fils de moins se "couver". Kanna, de son côté, commence à saisir les règles du combat de cartes que lui impose Scorpio, et invoque dans l'arène les illusions d'autres membres de Fairy Tail.

Les mages de Fairy Tail poursuivent leurs affrontements contre les Esprits célestes. En suivant l’odeur de Loki, Natsu mène ses coéquipières Wendy et Carla jusqu’à l’entrée d’une pyramide antique. Kanna vient enfin à bout de Scorpio en jouant la carte de son père Gildarts qui, en mode invulnérable, ne fait qu’une bouchée d’Aries. Opposé à Cancer dans une dance battle, Grey, d’abord mal à l’aise, est rapidement désinhibé par son adversaire. La soirée disco peut commencer…

Les Esprits célestes ne sont toujours pas revenus à la raison, les mages de Fairy Tail continuent d'en découdre avec eux. Le quiz opposant Reby à Capricorn prend fin sur une question pour le moins indiscrète, tandis que la troupe de Natsu est attaquée par un ennemi qui s'annonce coriace. De son côté, Jubia retrouve Aries qui la provoque en duel. Comment va s'en sortir la jeune mage dans un environnement qui ne lui est clairement pas favorable ?

À Astral Spiritus, mages et Esprits célestes continuent à se livrer d’âpres confrontations. Gajil et Lily ont été transformés en écureuils et enfermés dans une cage par Gemini. Profitant d’un instant d’inattention de ses nouveaux « maîtres », Gajil parvient à s’enfuir dans la forêt. Pendant ce temps, la princesse Jade fait part à Arcadios d’une intuition selon laquelle un treizième esprit, celui du Serpentaire, doit se trouver quelque part en ces lieux. Dans son sinistre manoir, Virgo continue à chercher Lucy qui, jusqu’à présent, a refusé l’idée de se battre.

Peu après que de terribles secousses eurent ébranlé Astral Spiritus, les mages engagés dans la bataille sont arrivés successivement dans un donjon, sans trop savoir comment. Manquent à l’appel Lucy, Yukino et le groupe de Natsu, qui n’ont toujours pas réussi à fermer la porte de l’Esprit auquel ils sont confrontés. Grâce à Ophiuchus, Leo a trouvé le moyen d’accomplir le Liberum à distance, en projetant l’énergie du globe céleste vers les constellations. Arcadios et Hisui, qui suivent la manœuvre sur leur écran portatif, décident d'aller prêter main-forte à Natsu et ses compagnons.

Ophiuchus lance son rayon en direction des « gêneurs » de Fairy Tail qui tentent d’empêcher la réalisation du Liberum. Natsu n’est guère en état de la combattre : depuis qu’il a aspiré les flammes de Loki, il souffre de fièvre et d’autres symptômes. En suivant l’odeur de « Salamander », Gajil mène le groupe des mages qui s’étaient retrouvés dans le donjon d’Astral Spiritus. Soudain, ils entendent au loin une voix féminine, et comprennent qu’un 13ème Esprit céleste est en train d’accomplir le rituel. Seules Lucy et Yukino n’ont pas encore fermé la Porte de leurs adversaires respectives, Virgo et Libra. L’incompréhension est totale entre les Esprits, prêts à mourir pour douze jours de liberté, et les Constellationnistes.

Porté dans les airs par Happy, Natsu se lance à l’assaut d’Ophiuchus, mais celle-ci réplique sans mal grâce aux pouvoirs de son ocarina. Lucy et les autres compagnons présents sont chargés, quant à eux, de détruire le globe céleste. Alerté par les violents tremblements, le gros de l’équipe Fairy Tail veut aller secourir le groupe de Natsu, sans toutefois pouvoir le localiser. Grâce au grimoire de Yukino, Reby comprend que, pour empêcher le Liberum Verus d’avoir lieu, il faut détruire simultanément Ophiuchus, Astral Spiritus et le globe céleste…

Aidé de Happy, Natsu parvient à vaincre Ophiuchus. Aussitôt, le globe céleste se brise et la lumière rouge s’éteint. Mais Lucy comprend rapidement que les Esprits ne sont toujours pas redevenus comme avant. Alors qu’Astral Spiritus est ébranlé par de nouvelles secousses, Horologium apparaît pour supplier les mages de venir sauver le monde des Esprits. À l’issue d’un voyage-éclair, les visiteurs humains découvrent un univers transfiguré, sur lequel règne un personnage encore plus méconnaissable.

Dans le ventre de la Bête céleste, Natsu et Happy se trouvent plongés dans l’obscurité d’une sorte de cosmos. Résistant aux assauts des météores et des planètes, ils volent en direction d’une mystérieuse lumière, près de laquelle ils espèrent retrouver tous les disparus. Pendant ce temps, à l'extérieur, Grey, Ezra et les autres tentent de terrasser le monstre en brisant un à un ses pics à haute tension. Avec la conviction que leurs camarades sortiront à temps de ses entrailles…

Natsu garde pour la journée la petite Asuka, fille d’Arzak et Biska. Après sa défaite au concours de tir, « Salamander », accompagné de Lucy et Happy, est tenu de satisfaire tous les caprices de l’enfant. Celle-ci accomplit même de vraies missions dont les rétributions doivent lui permettre d’acheter un précieux objet. Pendant ce temps, au siège de Fairy Tail, Wendy et Carla préparent un gâteau pour Asuka, en espérant qu’Erza et Lily trouveront bien la fameuse fraise Maximum Sweet…

Aujourd'hui, Jubia a une bonne raison d’être heureuse : il y a exactement 413 jours qu’elle a rencontré Grey pour la première fois. Une journée tout aussi exceptionnelle que les précédentes et les suivantes pour Jubia ! Convaincue par Erza, elle souhaite faire un cadeau à son bien-aimé mais, ne sachant que lui offrir, elle demande conseil aux filles, puis aux garçons de Fairy Tail.

Natsu, Happy et Lucy partent en mission sur le mont Hakobe à la recherche d’un type de glace aux vertus miraculeuses. Pris dans une tempête de neige, ils se réfugient à l’intérieur d’une grotte, qui ne tarde pas à se montrer hostile. Égaré dans l’immensité des galeries, le trio doit résister à la faim, au froid et au sommeil…

Pour pouvoir mieux se défendre lorsqu’elle ne peut pas invoquer ses Esprits, Lucy demande à Mirajane de lui apprendre à utiliser la magie de transformation. Natsu et Happy, intéressés par un usage plus ludique des métamorphoses, viennent également au parc suivre l’initiation. Macao et Wakaba, quant à eux, observent à distance, mais leur première tentative de redevenir jeunes et beaux se solde par un échec. N’est-ce que partie remise ?

Au cours d’une mission, Natsu reçoit sur la tête un curieux œuf. Au bout d’une dizaine de jours passés à le couver en relais avec Happy, il voit naître une mystérieuse créature, qu’il nomme « Kemokemo ». Dans la foulée, il décide de participer à un programme d’échange entre guildes, dans le but d’interroger ses confrères mages au sujet de son nouveau compagnon…

L'alliance « Fairy Tail - Sabertooth », débarque sur une île apparue il y a seulement quelques jours. D’emblée, les explorateurs sont intrigués par la présence d’une forêt dense, dans laquelle ils découvrent même des éléments du monde marin. Autre sujet d’étonnement : sur cette île, Kemokemo grandit encore plus vite qu’avant…

Venu en mission dans une ville ravagée par la foudre, Luxus devient d'emblée le héros des habitants en chassant l'épaisse couche de nuages noirs qui surplombe la cité. Avec les trois membres de l'unité Raijin, il fait bientôt la connaissance de son étrange client, qui n'est autre que le maire de la localité.

Une mystérieuse contagion se répand à Magnolia : lorsque quelqu’un est reniflé de près par un sujet déjà atteint, son visage est remplacé par celui d’Ichiya. Comme le reste de la population, les mages de Fairy Tail sont touchés les uns après les autres. Mais trois membres semblent curieusement protégés : Natsu, Happy et Lucy.