갑자기 우울해하는 카나, 그리고 길드의 들뜬 분위기. 알고 보니 그것은 1년에 한 번 있는 S급 마도사 승급시험 때문이었다! 마스터가 뽑은 8명의 참가자는 각각 한 명의 파트너를 구해 시험에 임하게 되는데, 루시는 카나의 침울한 표정이 자꾸만 신경 쓰인다.

드디어 시작된 1차시험! 배에서부터 치열한 경쟁이 벌어지는 가운데 루시와 카나는 출발부터 보기 좋게 뒤처지고 만다. 이윽고 섬에 도착한 루시 & 카나는 다른 팀과 싸워야 하는 「대결」루트로 들어가는데 상대는 그들보다 훨씬 강한 프리드 & 빅스로 팀이었다!

S급 승급을 위한 1차시험, 나츠는 시험관을 이겨야만 다음 단계로 진출할 수 있다. 하지만 상대는 길드 최강 후보 길다트. 손대는 모든 것을 산산조각 내는 크래시 마법을 쓰는 길다트는 나츠를 상대로 가차 없이 실력을 발휘하는데…

웬디와 파트너가 되어 1차시험에 도전하는 메스트. 그런데 강한 줄 알았던 메스트는 그레이와 로키 콤비에게 어이없이 진다. 메스트에 관해 제대로 아는 멤버가 아무도 없다는 사실에 모두가 수상함을 느끼기 시작할 무렵, 1차시험을 통과한 5팀이 2차에 도전한다.

2차시험 과제인 메이비스의 무덤을 찾기 위해 뿔뿔이 흩어진 멤버들. 그러던 중 나츠는 죽음의 파동을 일으키는 수상한 소년을 만나고, 레비는 가질과 말다툼을 하고 뛰쳐나갔다 어둠의 길드 마도사들의 습격당한다. 게다가 수상한 메스트까지... 위기로 가득 찬 천랑섬!

2차시험 도중 숲에서 악마의 심장 선발대와 맞닥뜨린 레비와 가질. 힘겹게 그들을 상대하던 가질은 곧 악마의 심장 전 멤버가 공격해올 거라는 말에 사태의 심각성을 깨닫는다. 천랑섬 하늘에 전투준비를 뜻하는 붉은 신호탄이 쏘아 올려진 가운데 카나는 시험을 계속하겠다며 반발한다.

본격적인 습격 전에 천랑섬에 들어와 있던 아즈마. 웬디와 샤를, 그리고 릴리는 필사적으로 그에게 맞서지만 도저히 상대가 되지 않는다. 드디어 본격적인 상륙이 시작되고 섬에 긴장이 감도는 가운데, 거대해진 마카로프가 적의 비행선을 막아선다.

비처럼 쏟아지는 적을 상대해야 하는 페어리 테일! 어느 정도 상황이 정리됐나 싶었더니 이번엔 연옥의 일곱 권속이 나선다. 수적으로도 마력으로도 체력적으로도 너무나 불리한 상황. 한편 마카로프는 하데스의 정체를 알고 충격에 빠진다.

멸룡마도사 나츠와 멸신마도사 잔쿠로의 승부. 둘 다 불의 마도사지만 어쩐지 나츠는 잔쿠로의 불을 먹을 수가 없다. 잔쿠로는 용사냥꾼 따위가 감히 신에게 대항한다며 나츠를 깔보지만 나츠는 처참하게 당한 마카로프를 보며 분노를 폭발시킨다.

아즈마와 맞닥뜨리게 된 미라젠과 리사나. 강한 적과의 싸움을 즐기는 아즈마는 리사나를 인질로 잡고 미라젠에게 마인으로 변할 것을 강요하고, 마력이 얼마 남아있지 않았던 미라젠은 힘겨운 전투를 벌인다. 한편 제레프를 찾아낸 울티어는 그를 사로잡으려 하는데…

러스티로즈를 상대로 힘겨운 싸움을 벌이는 엘프먼과 에버그린. 티격태격하면서도 서로 호흡을 맞춰 적을 궁지에 몰아넣지만, 상대는 상상하는 모든 것을 이루는 마법인 ‘구현의 아크’ 능력자였다. 한편 로키는 카프리코가 성령이라며 루시를 그에게서 떨어트리려 하는데…

루시를 피신시키고 카프리코와 일대일로 맞서는 로키. 성령 대 성령의 싸움이지만 놀랍게도 카프리코는 인간을 소환하는 인간예속 마법을 쓰고 있었다. 게다가 자신이 금기를 범했다며 이번엔 로키의 몸을 빼앗으려 한다. 한편 카나는 S급 시험에 대한 미련을 버리지 못하고 루시에게 무덤의 장소를 물어보는데…

숲속에서 카인 히카루와 마주친 루시! 모든 성령을 소환해가며 싸워보지만 어찌된 일인지 히카루에게는 전혀 통하지가 않는다. 하지만 때마침 울티어와 싸우고 있던 나츠와 합류하게 되고, 루시는 히카루의 저주인형에 조종당한다.

일곱 권속 중 하나인 메르디의 목표는 울티어를 슬프게 한 그레이를 없애는 것. 힘없이 당하기만 하던 쥬비아는 그 말을 듣고서는 분노하여 메르디를 몰아붙인다. 그러자 메르디는 감각 연결 마법을 이용하여 쥬비아와 그레이를 묶어놓고, 쥬비아를 공격함으로써 그레이를 해치려 하는데…

쥬비아, 그레이, 그리고 자기 자신의 감각을 연결시킨 메르디. 스스로를 죽임으로써 그레이를 없애려고 한다. 하지만 감각을 넘어서 감정까지 공유되면서 쥬비아의 다정한 마음에 흔들린다. 한편 악마의 심장의 부사령관 블루노트까지 참전하면서 상황은 더욱 악화된다.

아버지 길다트에게 자신이 딸이라는 걸 밝히고 싶었던 카나. 초라한 자신이 싫어 S급 마도사가 되기로 결심했었다. 하지만 4년 연속 불합격한 뒤 이번이 다섯 번째. 마지막이란 절박한 생각에 루시까지 버려두고 혼자 무덤으로 왔지만 결국 후회가 밀려드는데…

블루노트의 힘에 절망하는 카나 앞에 나타난 길다트. 붉은 신호탄을 보고 되돌아온 길다트와 프리드, 빅스로 덕에 상황은 페어리 테일에게 유리하게 돌아가는 듯 보였다. 그런데 나무 마법을 쓰는 아즈마가 천랑수를 쓰러트리자 갑자기 모두가 힘을 잃고 쓰러지는데...

천랑수를 쓰러트리고 천랑도의 마력을 장악한 아즈마. 하지만 강자와의 승부를 즐기는 성향 때문에 엘자의 마력만은 그대로 놔둔다. 길드원들은 마력을 잃고 쓰러지고 엘자가 모두를 지켜야 하는 상황. 하지만 아즈마도 결코 만만한 상대는 아니었다.

엘자는 모두의 마음에 힘을 얻어 아즈마를 쓰러트린다. 드디어 페어리 테일 멤버들에게 마력이 되돌아오고 길다트, 프리드, 빅스로는 그 기세를 몰아 승리한다. 한편 울티어는 자신의 행동은 울의 뜻이라며 그레이에에게 하데스를 없애달라 부탁한다.

어린 시절 어머니에게 버림받았다는 오해 때문에 증오심을 키워온 울티어. 어머니가 사랑한 제자 그레이도 어머니를 증오하는 자신도 미워하며 지금껏 살아왔다. 하지만 그레이와 싸우던 도중 바다에 빠져서 어머니의 품을 느끼게 되는데…

이제 마지막 남은 적은 마스터 하데스뿐. 나츠 일행은 캠프에 방어팀을 남겨둔 채 악마의 심장 비행선으로 쳐들어간다. 하지만 나츠 일행의 총공격에도 불구하고 하데스는 어마어마한 마력으로 그들을 압도한다.

하데스와의 결전 중 갑자기 나타난 렉서스. 하데스를 밀어붙이는 렉서스에게 모두가 기대를 걸어보지만 그 역시 얼마 못가 하데스의 마력에 무릎을 꿇고 만다. 한편 캠프를 지키던 방어팀은 히카루와 요마즈, 카와즈의 습격을 받아 비상사태다.

렉서스가 넘겨준 마력으로 뇌염룡이 되어 하데스를 쓰러트린 나츠. 하지만 기뻐하는 것도 잠시, 하데스는 거짓말처럼 아무런 상처 없이 부활한다. 악마의 눈을 뜬 하데스의 무시무시한 마력에 모두는 그저 얼어붙어 있을 뿐. 한편 해피 일행은 배 안에서 수상한 방을 발견한다.

악마의 눈을 뜬 하데스에게 전력으로 맞서는 나츠 일행. 때마침 엑시드 팀이 악마의 심장을 파괴해준 덕에 기적적인 승리를 이룰 수 있었다. 하지만 기뻐하는 것도 잠시, 제레프가 움직이기 시작한다.

생명을 소중히 여길수록 그 영혼을 빼앗아버리는 제레프. 인간들의 사념이 아크놀로기아를 불러들였다며 한 시대의 종말이 다가왔음을 선언한다. 한편 카나는 드디어 용기를 내어 길다트에게 그동안 못 했던 이야기를 하려고 한다.

승리를 기뻐하는 것도 잠시. 용의 울음소리가 천랑섬에 쩌렁쩌렁 울려퍼진다. 마카로프는 마스터로서 자신을 희생하여 모두를 피신시키려 하지만 모두는 함께 싸우는 길을 택한다. 그러나 검은 용 아크놀로기아는 인간이 결코 맞설 수 없는 존재. 모두는 힘을 하나로 모아 방어에 나선다.

천랑섬이 사라진 뒤 7년이 지났다. 많은 멤버를 잃어버린 페어리 테일은 급격히 쇠퇴하여 빚에 시달리는 초라한 길드가 되어 있었다. 그러던 어느 날 이치야가 갑자기 찾아와 천랑섬이 사라지지 않았다는 말을 하고, 남은 멤버들은 다시 한 번 수색에 나선다.

천랑섬에서 돌아온 뒤 7년의 공백을 실감하는 멤버들. 로메오는 훌쩍 자랐고 알작과 비스카는 결혼을 했으며 다른 멤버들도 모습이 많이 달라졌다. 오랜만에 아버지가 생각나서 아칼리파로 찾아간 루시는 충격적인 소식을 듣는다.

아름다운 딸을 둔 발사미코 백작. 그는 백작가의 반지를 노리는 탈옥수 벨베노를 잡아달라며 거액의 보수를 제시한다. 반지를 얻는 자는 백작의 딸 아체토에게 청혼할 자격을 얻게 되는데 그날이 바로 7년만에 반지가 공개되는 날이었기 때문이다. 예상대로 무도회 도중 나타나 반지를 가로챈 벨베노. 그런데 아체토는 그와 아는 사이인 눈치다.

기차로 금괴를 운반하는 일을 하게 된 나츠 일행. 그런데 그 기차에는 자칭 진짜 악당 볼기탱탱단이 타고 있었다! 싸움이 벌어지지만 루시는 예상치 못한 강력한 가스 공격에 당하고 나츠는 멀미로 맥을 못 추는 상황. 이제 금괴를 지킬 사람은 웬디 뿐인데…

변질된 마법약 때문에 투명인간이 되어버린 루시! 해결책을 찾아 길드로 간 루시는 안 보이는 것을 이용해 멤버들을 골탕 먹인다. 뒤늦게 루시의 장난임을 알아챈 멤버들은 옷을 입히고 투명 얼굴에 그림을 그리는 등 머리를 짜내지만 별 뾰족한 수가 없다. 게다가 사태가 더욱 심각해져서 이제는 몸이 투명해지는 것뿐만 아니라 루시의 존재 자체가 사라지려 하는데…

어느 날 페어리 테일로 한 소녀가 루시를 찾아온다. 소녀의 이름은 미셸 로브스터. 그녀는 루시의 먼 친척으로 루시 아버지의 유품을 전해주러 온 것이었다. 루시는 곧 미셸과 친해지고 갈 곳 없는 그녀와 함께 지내기로 한다. 그런데 아버지의 유품에서 갑자기 고대문자가 나타나기 시작한다.

숲에서 우연히 만난 나츠와 렉서스와 가질! 세 사람이 다음 날 공원에서 승부하기로 했다는 소문을 듣고 제이슨 기자까지 합세해서는 한바탕 축제가 벌어진다. 한편 아버지의 유품에 떠오른 고대문자를 해석하기 위해 끙끙대던 루시는 레비의 도움으로 뜻을 알아내는데…

갑자기 길드로 쳐들어온 코코, 휴즈, 슈가보이. 그런데 그들은 에도라스의 주민이 아닌 이곳 어스랜드의 코코, 휴즈, 슈가보이였다. 루시를 내놓으라는 그들에 맞서 전투가 벌어지지만 페어리 테일이 일방적으로 밀리는 상황. 결국은 루시를 구하기 위해 여자들이 서로 자신이 루시라며 나서기에 이르는데…

인간을 조종하는 휴즈의 마법으로 절벽에서 떨어진 루시와 미셸. 에리스의 양털마법으로 간신히 살아나지만 휴즈와의 싸움이 계속된다. 한편 루시를 찾아나섰던 나츠와 웬디, 그리고 길다트도 각각 레기온대 멤버와 맞닥뜨려 치열한 대결을 벌인다.

레기온대에게 아버지의 유품을 뺏기고 상심한 루시. 하지만 나츠와 동료들은 성전이 뭔지 알아보고 유품을 되찾기 위해 움직이기로 결심한다. 우선 시곗바늘에 대해 알아보기 위해 루시의 생가를 조사하기로 하는데 그곳에 또 다른 두 명의 레기온대가 나타난다!

그림책에 나오는 장소에 나머지 부품들이 숨겨져 있다는 걸 알게 된 루시. 아버지의 유품이라는 점과 세계에 혼돈이 찾아온다는 말이 자꾸만 마음에 걸린다. 결국 루시와 동료들은 그 답을 찾기 위해 나머지 부품들을 찾기로 결심하고 다섯 팀으로 나눠 각각의 장소로 향한다.

사막 지하의 유적 내부로 떨어진 루시 팀은 온갖 함정을 피해가며 고생한 끝에 최하층에 도달한다. 그곳은 오래 전 만들어진 묘지 마을. 그곳에서 시계 부품을 찾는 루시 일행 앞에 레기온대가 나타난다. 한편 그레이 팀은 유적과 연결된 이공간에서 슈가보이와 대결한 끝에 부품을 손에 넣는다.

책에 적힌 단서를 찾아 팀별로 시계 부품을 찾아나선 페어리 테일 멤버들. 사막 밑의 묘지에 도착한 루시 팀은 댄과 코코와 맞닥뜨린다. 댄의 창 때문에 루시는 작아지고 해피는 커지고 그야말로 난리법석. 겨우 원래대로 돌아온 루시는 도망치던 도중 코코와 함정에 빠지고 마는데…

시계 부품을 찾아 마도 도서관에 간 엘자와 웬디 일행. 그런데 그곳에서 보물이 있단 소문을 듣고 찾아온 볼기탱탱단과 맞닥뜨리게 된다. 그들을 설득하려는 웬디와 그들을 훈계하려는 엘자까지 검은색 타이츠를 입고 맞서는 묘한 상황이 벌어진다. 한편 마법을 튕겨내는 댄의 방패에 고전하던 루시 팀은 한 가지 묘안을 생각해내는데…

험난한 바위산에 올라 부품을 찾는 가질 일행. 그곳에 레기온대의 두뇌 사무엘이 나타나고 릴리와 사무엘 두 엑시드의 전투가 벌어진다. 모든 것이 자신의 계산대로라고 말하는 사무엘. 과연 그들은 천재적인 사무엘의 계산을 뛰어넘을 수 있을까?

댄을 쓰러트린 나츠 일행 앞에 레기온대의 리더인 바이로가 나타난다. 바이로는 세계의 종말을 막기 위한 성전이라며 정당성을 주장하지만 그들의 방식에 의문을 품은 나츠 일행은 다시 한 번 싸울 것을 결심한다. 한편 마리휴즈의 조종술로 분리된 미라젠의 사탄 소울이 동생들을 공격하자 이에 분노한 미라젠은 금기의 마법을 쓰는데…

묘지의 나츠 팀은 바이로와 격돌하지만 마법을 무효화시키는 그의 능력 때문에 속수무책으로 당한다. 자신의 정의를 관철하려는 바이로와 동료를 위해 싸우는 나츠. 코코는 그런 바이로를 설득하려 하지만 소용이 없다. 한편 다른 팀들도 부품을 가지고 속속 묘지로 도착하는데…

페어리 테일 앞에 나타난 것은 오래 전 니르바나를 둘러싸고 사투를 벌였던 육마장군! 더욱 강력해진 그들은 신생 육마장군을 자처하며 압도적인 파워로 페어리 테일과 레기온대를 전투불능으로 만든다. 이제 사태는 페어리 테일과 레기온대, 신생 육마장군의 삼파전에 돌입한다.

육마장군이 무한시계를 빼앗아간 뒤로 교회 습격 사건이 더욱 빈번해진다. 페어리 테일 멤버들은 카나의 카드점으로 팀을 짜는데 어쩐지 의외의 조합들뿐이다. 한편 젠토피아의 음모는 더욱 커져만 가고 레기온대는 라푸앙트의 강요로 새로운 멤버를 맞이하게 된다.

카나의 카드점으로 팀을 나눠 각각의 목적지로 향한 페어리 테일. 그 중에서 나츠, 루시, 엘프먼, 미셸 팀은 육마장군의 잭팟과 맞닥뜨리지만 어쩐지 팀워크가 맞지 않아 전투가 엉망진창이 된다. 다른 팀들도 상황이 안 좋기는 마찬가지. 멤버간의 유대를 중요시 여기는 페어리 테일에 위기가 닥친다.

무한시계를 둘러싼 페어리 테일, 레기온대, 신생 육마장군의 삼파전이 더욱 격렬해진다. 라할과 드란발트는 어떤 교회에서 웬디와 꼭 닮은 카챠라는 소녀를 만나 사건의 전말을 알게 되지만 레이서의 공격에 속수무책으로 당한다. 한편 길다트와 라키는 폐허가 된 로브스터 농장에서 어떤 소녀를 발견하는데…

모두가 상황이 이상하게 돌아간다는 걸 느끼기 시작할 즈음 마지막 생체 링크가 해제되고 상공에 거대한 무한시계가 모습을 드러낸다. 레기온대는 이해할 수 없는 임무에 혼란스러워하고, 루시는 미셸의 진짜 정체를 알고 충격을 받는다.

결국 리얼 나이트메어가 발동되었다. 이제 루시를 제물로 바쳐 마법이 완성되기까지 시간이 얼마 남지 않았다. 미라젠은 크리스티나를 파괴하려는 레이서를 지상으로 끌고가 격파하고, 바이로는 대주교가 라푸앙트에게 조종당하고 있었다는 사실을 알고서 충격을 받는다.

무한시계 부활의 제물로 붙잡혀간 루시를 구하기 위해 무한성을 달리는 페어리 테일 멤버들. 하지만 신생 육마장군의 방해에 부딪혀 좀처럼 전진할 수가 없다. 게다가 무한시계를 멈추기 위해 루시를 해치겠다는 바이로와 릴리도 막아야 하는 상황. 그때 해피가 시계를 멈출 다른 방법을 생각해낸다.

드디어 루시가 있는 곳에 도달한 나츠 일행과 그 앞을 막아서는 이미테이시아. 남은 네 명의 육마장군을 쓰러트리지 못하면 루시를 구할 수 없다. 한편 무한성 곳곳에서는 육마장군과 다른 멤버들의 전투가 벌어지고 있는 상황. 엔젤과 싸우던 그레이는 하늘로 사라지고 싶다는 엔젤의 말에 살아가라며 반박한다.

점차 무한시계에 빨려들어가는 루시. 하지만 나츠는 이미테이시아의 강력한 공격에 부딪혀 꼼짝도 하지 못한다. 한편 다른 멤버들과 레기온대는 대주교가 알려준 대로 루시의 융합을 늦추기 위해 쇠사슬을 끊기 시작하지만 이제 남은 시간이 얼마 없다. 그러던 와중에 루시는 자신의 과거에 숨겨져 있던 미셸의 정체를 깨닫는다.

즐거웠던 그 시절로 돌아가고 싶었어. 마지막 힘을 다해 루시에게 마음을 전하는 미셸. 그 말을 듣는 순간 루시의 기억 속에 잠들어 있던 미셸과의 어린 시절이 떠오른다. 한편 어둠에 삼켜졌던 나츠는 그곳에서 뛰쳐나와 브레인2세에게 힘껏 주먹을 날린다. 그런데 루시는 이미 무한시계와 완전히 융합한 뒤였는데…