Après une série d’ennuyeuses missions de rang D, l’équipe n°7 est finalement chargée d’escorter Tazuna, un constructeur de pont. Une attaque inattendue va rendre la mission plus difficile que prévue.

Le ninja ennemi apparaît et engage le combat avec Sasuke. Après la fuite de cet imposteur, l’équipe 7 subit une nouvelle attaque. Mais cette fois-ci, l’adversaire est plus coriace.

À la suite de la défaite de Lee, Sakura décide de protéger ses amis.

Le combat entre Sakura et Ino continue. Au début, Sakura a l’avantage jusqu’à ce qu’Ino utilise sa technique de transposition. Mais celle-ci réussit à se débarrasser de l’esprit d’Ino grâce aux encouragements de Naruto ; le combat se termine en match nul. Combat de Tenten contre Temari ; Tenten qui utilise exclusivement des armes de jet ne parvient pas à trouver de faille dans la défense de Temari basée sur des bourrasques de vent créées avec son éventail.

L'équipe no 7 (Kakashi Hatake, Naruto Uzumaki, Sasuke Uchiwa et Sakura Haruno) est investie d'une mission de rang C : escorter Shibuki, le chef du village caché de Taki du Pays de la Cascade, lors de son voyage de retour vers son pays. La mission se déroule sans problèmes, mais une fois arrivés au village, ils rencontrent des renégats dont le but est de s'emparer de « l'eau des héros », eau magique délivrant une puissance extraordinaire à celui qui la boit (non sans effets secondaires). Le jeune chef de Taki va devoir trouver en lui la force et la confiance nécessaire pour repousser l'envahisseur. Sasuke et Naruto seront là pour l'aider...

Jiraya fait soudainement son apparition et prend part au combat contre Kisame et Itachi. Mais Sasuke refuse de laisser Jiraya se mêler de son combat contre Itachi. Il continue de se battre mais hélas, le pauvre Sasuke ne fait pas le poids face à son grand frère. Il se demande alors pourquoi il a passé ses années à Konoha à s'entraîner sans relâche puisqu'il ne fait aucun progrès. Sasuke subit ensuite la technique d'Itachi : « Les arcanes lunaires » remontrant l'extermination du clan par son frère. Sasuke se retrouve alors sans connaissance et les côtes cassés. Jiraya décide donc de partir à la recherche de Tsunade en compagnie de Naruto afin de lui demander de devenir le 5ème Hokage du village de Konoha.

Tsunade avoue à Jiraya que Naruto lui fait beaucoup penser à son petit frère Nawaki, mort il y a quelques années. Elle piège ce dernier en ajoutant de la drogue dans son sake. Le lendemain, elle rejoint Orochimaru afin de donner réponse à sa proposition.

Mais que se cache-t-il sous le masque de Kakashi Hatake ?

Tsunade convoque Shikamaru et lui explique la situation. Elle lui dit de former une escouade composée de genin. Shikamaru forme une équipe de 5 avec Naruto, Kiba, Chôji et Neji. Avant le départ de l'équipe, Sakura vient voir le groupe et demande à Naruto en pleurant de ramener Sasuke au village. Naruto accepte la proposition de Sakura et lui fait la promesse de tout faire pour ramener Sasuke.

Le combat entre Kiba et Sakon fait rage. Ukon, le frère de Sakon se réveille et les 2 frères passent directement au stade n°2 de leur sceau maléfique. Kiba et Akamaru décident d'utiliser la redoutable technique du loup bicéphale.

Sasuke affronte Naruto, qui de son côté ne se bat pas sérieusement. Pendant l'affrontement, le jeune Uchiwa se remémore son enfance passée aux côtés de son frère Itachi envers qui il était plein d'admiration. Cependant, Sasuke était quand même jaloux que son père s'intéresse plus à Itachi qu'à lui-même. Il voit Itachi devenir de plus en plus distant avec le reste de son clan.

Les intentions de Sasame n’étaient pas mauvaises, elle souhaitait seulement sauver son cousin des griffes d’Orochimaru. L’Ermite et ses deux acolytes l’ont bien compris. Elle les mène à l’entrée de l’antre d’Orochimaru et Naruto lui promet de ramener son cousin. Pourra-t-il tenir promesse ? Le palais d’Orochimaru est parsemé de pièges.

Mizuki a pris la fuite et cambriole un laboratoire afin de se procurer les composants nécessaires à une potion. Sa relation avec Orochimaru ne fait plus aucun doute. Tsubaki, la fiancée de Mizuki a rejoint Naruto, Iruka et Pakkun et va les aider à retrouver le fugitif, mais lorsqu’ils vont le retrouver il est trop tard, Mizuki a ingurgité la potion prescrite par Orochimaru.

Lee affronte Raïga pendant que Mémé Sancho, Tenten et Ranmaru apportent le curry providentiel à Naruto et Neji. Lee y a aussi droit puisqu'il a subi un assaut de Raïga qui le met hors-combat. Mais il devient ivre en mangeant ce curry et affronte à nouveau Raïga. Ranmaru tente de convaincre son ami de goûter le curry mais ce dernier ne lui pardonne pas de l'avoir trahi. Cette fois-ci, c'est Naruto qui affronte Raïga et le bat avec son Multiclonage.