大蛇丸伪装成风影，劫持了火影，与此同时，音忍也开始在考场上作祟。佐助开始追击我爱罗，而考场内部的混乱就由木叶的暗部和上忍们来处理。与此同时，大蛇丸和火影的战斗也即将展开。在忍者学校里，孩子们还没有意识到危险的来临，在操场上奔跑着，而伊鲁卡老师还在满心惦记着鸣人。而这一切的平静，即将在下一刻被打破，大蛇丸的入侵，究竟会给木叶带来怎样的灾难呢？

小樱解除了鸣人和鹿丸的幻术，并按照卡卡西的指示，去追踪佐助，并阻止佐助的行动，之后在安全地点待命。鸣人刚刚醒来，就被眼前发生的事情惊呆了，毕竟谁也没想到，好好一场中忍考试，竟然变成了一场战争。与此同时，在大蛇丸的结界中，火影和大蛇丸展开了战斗，可惜结界外的人只能看到战况，却无法帮忙。实际上，在结界内，大蛇丸将初代火影和二代火影召唤了出来，三代火影该如何同前两代火影战斗呢？

鸣人等人在追踪佐助的过程中，被九名音忍跟踪了。虽说在帕克的指导下，大家制造了误导敌人的陷阱，但是敌人似乎并没有中计。在鹿丸的分析下，追踪佐助的小组终于明白了现在他们所处的不利战况，为了让任务能够顺利执行，鹿丸提出必须留下一个人作为诱饵去吸引追击的音忍，而这个人有可能会死。就在全员纠结谁去谁留的时候，鹿丸果断提出自己留下来诱敌。

为了阻挠佐助等人追上我爱罗，手鞠沿途设置了许多陷阱，与此同时，三代火影和大蛇丸的战争进入了关键时刻。大蛇丸利用秽土转生召唤出了一代和二代火影同三代战斗，一二代火影本来就是历代火影中的精英，与他们两位战斗让三代陷入了困难的境地，被逼到绝路的三代火影召唤了猿魔，可是三代火影毕竟上了年纪，即使结合了猿魔的能力，一次性对抗两位火影，还是很吃力的。

佐助终于追上了我爱罗一行人，而手鞠为了掩护我爱罗逃走，决定留下来断后，因此一场关于手鞠和佐助之间的战斗开始了。战斗一开始，局面就被手鞠掌控了，而佐助也不是吃软饭的，他利用火遁凤仙花之术，将手鞠困在火圈里，又立即使用豪火球之术企图命中手鞠的要害，可是手鞠却使用镰鼬击散了火焰，并使佐助走位不慎踩住了陷阱，就在手鞠以为胜券在握的时候，佐助居然使用了替身术，打了很漂亮的一场反击。

为了阻止大蛇丸对村子的攻击，三代火影决定使用尸鬼封印，将大蛇丸、一代火影和二代火影统统封印起来。与此同时，大蛇丸的大蛇正在破坏着村子，就在忍者们手足无措的时候，自来也出现了。可是自来也似乎来得晚了一些，在大蛇丸的结界中，大蛇丸和三代火影的战斗还在僵持，而三代火影已经将大蛇丸的灵魂抽去了一半，大蛇丸会这样轻易的死掉吗？