Koji Kabuto, ex-pilota del robot Mazinga Z, si dirige al Centro Ricerche Spaziali del Professor Procton, deciso ad indagare sugli avvistamenti di UFO che si ripetono con frequenza nella zona. Atterrato nei pressi della fattoria Shirakaba, Koji fa la conoscenza di Rigel, i suoi due figli (Venusia e Mizar) e Actarus, l'introverso figlio del Professor Procton. Intanto una grave minaccia incombe sui cieli della Terra, il malvagio Re Vega intende conquistare il pianeta, ignorando che Goldrake, sua vecchia conoscenza, è pronto a difendere la Terra.

Le truppe del perfido Re Vega, ritiratesi sul lato oscuro della Luna dopo essere state sconfitte da Goldrake, si preparano ad attaccare nuovamente la Terra. Nel frattempo Koji, accortosi che Actarus non e' un normale essere umano, si reca al Centro Ricerche per capire quale sia la vera identità del figlio del Professor Procton.

E' tempo di festa alla Fattoria Shirakaba, infatti sono in corso i preparativi per il 7° Festival della fattoria alla quale parteciperà oltre ad Actarus e Koji anche il Professor Procton. Una grave minaccia però incombe su tutti gli invitati, infatti Hydargos, su consiglio di Lady Gandal, si prepara a sferrare un attacco il cui scopo è costringere Goldrake a uscire allo scoperto in modo da poterne individuare il nascondiglio.

Hydargos, comandante delle truppe di Vega, ha dato ordine di attaccare la vicina città per costringere Goldrake ad uscire allo scoperto e rivelare così il proprio nascondiglio. Koji però sceglie di affrontare il nemico con lo scopo di farsi seguire e allontanarlo dalla città. Purtroppo durante gli scontri il TFO precipita rovinosamente su un isola deserta. Koji, ferito, viene raggiunto da Actarus ed assieme riescono a sconfiggere il nemico. Tra i due sembra essere nata un amicizia.

Il malvagio Hydargos ha deciso di impadronirsi di un aeroporto situato su un altopiano per trasformarlo in una base per le sue truppe...

Gandal e' deciso a scoprire la base di Goldrake e per ottenere il suo scopo ordina al comandante Hydargos di attaccare Tokyo. Durante l'attacco, l'autobus sul quale si trovano Venusia e Banta viene catturato da un mostro spaziale...

Una nebulosa spaziale di origine non identificata sta mettendo fuori uso gli apparecchi radar della base terrestre; Koji, nonostante i ripetuti consigli di prudenza da parte di Actarus, parte con la sua navicella. I timori del giovane non erano infondati, difatti appena giunge nei pressi della nube misteriosa Koji precipita colpito da una serie di mine spaziali poste a schiera all'interno della nebulosa.

Ferito, viene subito condotto in ospedale e non si trova pertanto nelle condizioni di poter avvertire Actarus: appena ristabilito corre in soccorso dell'amico, già partito alla volta della nube del tutto inconsapevole del pericolo. Prende così il via il piano escogitato da Hyrdargos per fermare Goldrake.

Colpito a ripetizione dalle mine spaziali Actarus rischia di precipitare a sua volta, sennonché, grazie all'intervento provvidenziale di Koji, riesce a riprendere i sensi e il controllo del suo robot appena in tempo per lanciarlo contro il mostro di Hydargos uscito allo scoperto.

L'aliena Mineo viene convinta dai veghiani a compiere una missione suicida con la falsa promessa di risparmiare il suo pianeta natale Ruby. La ragazza però scoprirà la generosità dei terrestri e andrà incontro a una sorte tragica.

Un ragazzino terrestre orfano, convinto che nello spazio possa trovare i suoi genitori, viene arruolato da due veghiani, che lui crede alieni amici, come spia. Deve cercare il TFO e Goldrake. Scoperto dai nostri eroi, il ragazzo viene catturato nuovamente dai due alieni e nascosto all’interno di un mostro spaziale per evitare che Goldrake lo distrugga.

Goldrake viene attaccato durante un'eclissi solare. Si scopre così che i motori del robot funzionano ad energia solare. In difficoltà, Goldrake viene salvato dall'ufo di Koji.

I veghiani decidono di installare una base missilistica su un monte innevato nei pressi della base di Goldrake. Nell'operazione distruggono una stazione meteo dove vive una famiglia. Sopravvive solo la figlia, una bambina che viene recuperata da Actarus e Koji che intuiscono così il piano dei nemici. Actarus, il principe delle stelle, riuscirà a salvare la bambina e a distruggere il mostro nemico che si mimetizza nel ghiaccio.

Un mostro spaziale funzionante a energia solare si posiziona sulla Terra. Koji cerca di farlo saltare in aria con degli esplosivi, senza successo. L'intervento risolutivo sarà quello di Goldrake.

Actarus, Venusia e gli altri stanno festeggiando il capodanno in maniera tradizionale giapponese, quando arriva a trovare Koji/Alcor anche Boss con i suoi compari. Il Boss robot non tarda a incuriosire le forze di Vega che cercano di studiarlo e impossessarsene.

Grazie agli studi del comandante Iara, Vega sviluppa un amplificatore sismico. Per farlo funzionare serve l'aiuto del sismologo. Iara però è uno scienziato che non vuole collaborare e utilizzare le sue invenzioni per scopi bellici. Lady Gandal, minaccia quindi di deportarne la madre su un pianeta-miniera, dove vengono imprigionati i dissidenti del regime veghiano. Iara si convince a collaborare cercando una soluzione pacifica: convince Actarus a consegnarsi per evitare spargimenti di sangue. Quando si accorge di essere stato ingannato dai comandanti militari di Vega, rende inutilizzabile l'amplificatore sismico, mentre Actarus riesce a scappare. A Iara viene fatto il lavaggio del cervello per farlo combattere contro Goldrake, non prima di avergli rivelato che la madre era già morta sul pianeta-miniera.

Stella, la fidanzata di Hayashi, uno dei tecnici dell'Istituto di Scienza Spaziali, viene catturata da un comandante di Vega, il quale sostituisce il fermaglio dei capelli della ragazza con un dispositivo, a distanza, per il controllo del cervello. Lo scopo è di penetrare nel Centro e raccogliere informazioni. Ma Hayashi non è tipo da svelare segreti tecnici, neppure alla sua fidanzata, così il piano cambia; la ragazza viene costretta a catturare Procton con una pistola a raggi. Hayashi, però si avvicina a lei, sicuro che l'amore che questa prova nei suoi confronti sia più forte del condizionamento telepatico a cui è stata sottoposta, e la costringe a gettare l'arma. Il comandante di Vega attacca quindi con il mostro, ma senza successo.

Gandal decide di costruire una base avanzata sulla Terra, in posizione privilegiata, nella zona dove di solito compare Goldrake. Il che significa che la fattoria di Rigel deve essere rasa al suolo. L'attacco del mostro spaziale avviene proprio mentre Actarus, Koji, Venusia e Mizar stanno portando al pascolo i cavalli e vengono sorpresi da una brutta bufera di neve. Nel trambusto che ne segue, Mizar si perde per inseguire un puledrino scappato dalla mandria. Mentre Actarus con Goldrake affronta il mostro, Koji a bordo del TFO si incarica di cercare il ragazzino. Messi in salvo Mizar e il puledro, Goldrake è libero di combattere il mostro senza mettere in pericolo l'incolumità dei suoi amici.

Dr. Umon made a project so that Grendizer is able to launch without revealing his whereabouts to the enemy. Kabuto is control by the Vegans and fights Duke.

I veghiani provocano una pioggia di asteroidi contro la Terra. Dentro un asteroide è nascosto un mostro spaziale. Actarus capisce il piano e passa all'azione.

Nuovo piano di attacco dei veghiani: sotto una montagna installano un apparecchio in dialogo con un analogo sulla Luna. Lo scopo è quello di avvicinare il satellite terrestre, durante un'eclissi di luna, al pianeta per provocare immani catastrofi.

Il piano veghiano prevede di sciogliere i ghiacci del Polo Nord per innalzare i livelli del mare e sommergere così numerose città terrestri. Actarus interviene, anche se questo vuol dire mettere in pericolo la vita di un cavallo della fattoria a cui è molto affezionato. Egli infatti deve portare all'animale della penicillina.

I veghiani rubano un macchinario capace di produrre un intenso campo magnetico e lo montando su un mostro spaziale. Il dottor Procton riesce a però costruirne uno simile in grado di produrre un campo che riesce ad annullare quello nemico, e lo monta su Goldrake. Il pericolo del mostro meccanico viene così annullato, ma Actarus si accorge che non può distruggere il robot a distanza, perché prigioniero nella sua testa c'è uno scienziato terrestre. Ispirato da una primula - fiore coraggioso che resiste nella neve e da lì spunta - Goldrake compirà un'azione in grado di distruggere il robot e liberare lo scienziato.

Venusia litiga con Actarus e fugge dalla fattoria. nelle vicinanze di una diga rischia la vita cadendo da un precipizio. Actarus è costretto a trasformarsi in Goldrake per salvarla, rivelando così la sua vera identità aliena. La diga sarà oggetto anche dei piani di Vega che, distruggendola, cercano di inondare l'area della presunta base di Goldrake.

Un luogotenente della guardia reale di Vega si introduce in un satellite, lo fa precipitare nell'oceano e assume le fattezze di uno scienziato della Nasa. Con queste fattezze si presenta all'Istituto di Procton. Con un inganno fa uscire Goldrake dalla base per campionare delle rocce spaziali e scoprire così l'identità terrestre di Duke Fleed . Venusia si accorge della presenza aliena, ma viene rapita dal veghiano.

Actarus ritrova sulla Terra, braccata dai veghiani, Naida, il suo amore di Fleed. In realtà si tratta di un piano dei nemici: il cervello della ragazza è condizionato dai generali di Vega. Naida inoltre nutre rancore nei confronti di Actarus: suo fratellino, sottoposto ad un esperimento, era stato trasformato in un mostro stellare distrutto da Goldrake nell'episodio 1. Ma contemporaneamente l'amore di Naida per Actarus le impedisce di ucciderlo. Scoperta però Naida rivela la terribile verità su suo fratello e Actarus cade in una profonda depressione. Liberata dal condizionamento veghiano, Naida decide di attaccare i veghiani con un attacco suicida. Actarus, ripresosi con un elettro-shock, perde quindi il suo amore.

Dr. Umon sends Koji and Hayashi on a mission in outer space to build a satellite station. At the same time, the Space Science Centre is surrounded by a huge Minifo saucer squadron.

Grendizer's delicate weapon systems malfunction and he finds himself struggling against the enemy. The Vegans arrive and descend upon the Center. Hikaru and Daisuke must fix Grendizer and save the Center.

General Zuril is a brilliant scientist who will try to find different ways of taking down Grendizer. Daisuke, Hikaru, and Goro are attacked by Vegans and Danbi puts on his gear and begins fighting them too.

Vegans shrink the cells of the living body to make Harook become a young boy for a time so he can spy Space Science Centre. Harrok and Goro become friends but later the effects of the shrinking begin to wear off so Harook captures Goro.

A strange rock full of radiation energy lands on Earth and Dr. Umon can't make much of this new phenomenon. At the same time, the Vegans discover this strong source of energy and put it to use in their next saucer beast.

The Boss, Koji, and Bunta go to the Boss Borot to begin their counterattack of the Vegan attack on them but will face some technical difficulties. Grendizer gets into some trouble while trying to help them but the Boss Borot will help Grendizer in the funniest way but will lose his Boss Spazer.

The Vegans send a woman by the name of Marian who looks identical to Duke Freed's mother who passed away on planet Freed.

The Vegans send a bird named "Zari Zari" to distroy Grendizer, but Duke remember a similar bird from his home planet Fleed and will use this knowledge to go and finish it off.

Il comandante Gaus viene inviato a fronteggiare Goldrake in cambio della salvezza del suo pianeta, nel primo scontro Goldrake sembra avere la peggio, tuttavia Gaus decide di risparmiarlo e attendere la luna piena per un secondo e ultimo round. Gaus va a trovare la fattoria in vesti di umanoide e Venusia lo fa ragionare, facendogli capire che uccidere Goldrake è sbagliato. Al secondo round Gaus difende Goldrake dai minidischi dicendo di voler essere lui a sconfiggere Actarus, tuttavia nel corso del loro combattimento si lascia battere.

Il comandante Beetle viene inviato sulla Terra con un disco d'attacco in grado di attaccare dal sottosuolo causando potenti terremoti. Messa in allarme la base, Goldrake decolla col suo disco; sfortunatamente per lui il disco talpa di Beetle sembra troppo veloce, rischiando di scoprire l'uscita 5, così Procton si prepara a farla distruggere con cariche esplosive, mettendo a rischio la diga. Fortunatamente Goldrake raggiunge Beetle in tempo e lo affronta, finendolo con l'aiuto del nuovo disco di Alcor, il Goldrake 2 col quale da il colpo di grazia al nemico.

Il comandante Zigra della guardia imperiale di Vega arriva alla base di Gandal e Zuril con l'intento di andare sulla terra e sconfiggere Goldrake una volta per tutte sfruttando, i suoi punti deboli; nel frattempo Procton spiega ad Alcor e Actarus il problema dei tempi morti in cui Goldrake è indifeso, i quali verranno annullati dall'aggancio col Goldrake due, fase per la quale Alcor si allena duramente, nel frattempo Zigra scende sulla terra e Goldrake parte per affrontarlo; le sue armi sono inutili, così si prepara a uscire col robot, ma Zigra approfitta dei tempi morti di Goldrake e danneggia gravemente il disco. Alcor assiste allo scontro dalla base e decide di partire col Goldrake 2 per aiutare Actarus, ormai allo stremo dello forze. Alcor arriva appena in tempo, Goldrake si aggancia al Goldrake 2 e sconfigge il nemico.

In piena crisi energetica, gli spaziali decidono di inviare alcuni minidischi per impadronirsi dei depositi di superuranio, Alcor parte per intercettarli, tuttavia per impedire che l'irruenza del giovane causi dei danni, Procton invia anche Goldrake. Sfortunatamente nei pressi del combattimento col disco di attacco alieno ci sono anche Mizar e Venusia, così mentre Goldrake affronta il nemico, Alcor, ferito gravemente, li recupera e cede il posto di pilota del Goldrake 2 a Venusia, la quale vuole andare in soccorso di Goldrake che si trova in difficoltà nello scontro con il mostro, visto che emana raggi protonici, che risvegliano la sua ferita al braccio. Con le istruzioni di Alcor, Venusia riesce a togliere Actarus dai guai.

La stella Vegaton si è disintegrata e d'ora in poi gli spaziali cercheranno a tutti i costi di conquistare le riserve di superuranio; discutendone con Procton, anche Actarus e Alcor ne vengono a capo e si preparano ad un inasprimento degli scontri futuri; Procton spiega inoltre a Actarus e Alcor i vantaggi nell'utilizzo del fotoquantum, così Alcor parte per raccogliere particelle dell'elemento, mentre Goldrake distrae i veghiani, tuttavia questi si accorgono degli intenti dei terrestri e raggiungono Alcor ferendolo gravemente. Tornato sulla Terra, Alcor viene soccorso e sostituito da Venusia che, a sua volta, parte col Goldrake 2 per agganciarsi a Goldrake e aiutarlo a sconfiggere il nemico.

Gli spaziali preparano un nuovo piano per affrontare sia Goldrake che il Goldrake 2 ed inviano sulla terra un disco d'attacco che rilascia una strana capsula rossa in una miniera abbandonata per poi andarsene, Alcor lo segue ma Procton gli ordina di rientrare. Il disco sorvola la base dalla stratosfera, mentre dalla capsula escono delle truppe di terra che si dirigono verso la base a bassa quota per eludere i radar, tuttavia Venusia, Rigel li scoprono e vanno ad avvertire Procton, ma, scoperti a loro volta Rigel resta indietro per distrarli. Il disco intanto rientra nell'atmosfera e inizia distruggere la città, mentre Procton intuisce che potrebbe trattarsi di un diversivo, tuttavia Actarus e Alcor partono in difesa della città; Venusia arriva alla base in ritardo. Goldrake affronta il disco mostro ma è in difficoltà, nel frattempo Venusia cerca di intrattenere i minidischi delle truppe di Vega, che vengono individuati dai radar e Procton avvisa Goldrake. Raggiunto da Alcor, Goldrake sconfigge il disco mostro e rientra alla base appena in tempo per sconfiggere le truppe di Vega.

In seguito ad un'eruzione sottomarina, gli spaziali individuano un deposito di superuranio ed inviano sulla terra un disco d'attacco con l'intento di impossessarsene; Goldrake e Goldrake 2 partono per impedire che il deposito venga coinvolto nell'esplosione. Recuperato il deposito si preparano al trasferimento, raggiunti dal nemico sono però costretti alla fuga. Messo al sicuro il deposito, il disco cerca comunque di impossessarsi del superuranio con un attacco sottomarino e Goldrake si tuffa per affrontare il nemico, rischiando tuttavia di restare senza energie. La base dei veghiani resta senza energie ed utilizzando le energie di riserva per le evacuazioni, comunicano al disco d'attacco di lasciar perdere Goldrake, messo ko, e recuperare il superuranio. Goldrake 2 si lancia all'inseguimento del mostro carico di energia ed impedirgli di tornare alla base col carico. Su ordine di Gandal, il mostro prende in ostaggio Goldrake, ma attaccato da due fronti viene sconfitto.

Gli spaziali catturano un temibile mostro anfibio e lo trasformano in un disco d'attacco per inviarlo sulla terra sfruttando la debolezza nei combattimenti acquatici di Goldrake, nel frattempo i Procton svela ad Actarus e gli altri la sua nuova creazione, il Delfino Spaziale, che servirà a colmare la laguna, la cui guida sarà destinata a Venusia. L'addestramento tuttavia si rivela troppo duro ed in un incidente Actarus viene ferito. Il mostro viene inviato sulla terra con dei minidischi e Goldrake e Goldrake 2 partono per affrontarli, mentre Venusia prosegue l'addestramento, intanto che il Delfino Spaziale viene terminato. Venusia termina l'addestramento e parte col delfino spaziale, mentre Goldrake nel frattempo viene trascinato in acqua, trovandosi in difficoltà. I due, tuttavia, si agganciano e sconfiggono il mostro.

Procton alla base terrestre vuol mettere in funzione un nuovo elaboratore per aiutarli a fronteggiare le forze di Vega, nel frattempo gli spaziali inviano un disco mostro per distrarre Goldrake e i suoi amici, mentre i minidischi cercano di distruggere la base di Procton. Actarus decolla col suo disco, Alcor col Goldrake 2 abbatte i minidischi. Il disco mostro si butta in acqua e parte anche il Delfino Spaziale per Goldrake sott'acqua; il mostro gli tende un agguato e immobilizza Goldrake sul fondale marino, mentre Alcor viene fatto rientrare. Alcor intrattiene i minidischi, mentre l'astronave ammiraglia cerca di distruggere il centro di Procton, nel frattempo Venusia libera Goldrake dal disco che lo immobilizzava e riesce a rientrare, quindi Procton attiva dei nuovi sistemi di difesa impiantati segretamente ed insieme a Goldrake riescono ad allontanare la nave di Gandal.

Per le truppe di vega diventa indispensabile creare una base sulla terra in grado di fungere da ponte per l'invasione. La scelta cade su un'isoletta vulcanica vicina al centro spaziale. Un comandante viene inviato per realizzarla, ma alcune disattenzioni ne svelano a Procton la presenza. Actarus e gli altri la individuano e la distruggono assieme al comandante veghiano ed al suo mostro.

Zuril, studiando alcuni documenti preistorici di Vega, scopre che nei secoli passati sono stati abbandonati sulla terra dei dischi per il teletrasporto. Usandone uno invia tre mostri lupo ed il loro comandante con il compito di penetrare al Centro Ricerche e scoprirne i segreti. Sulla Terra intanto un ragazzo appassionato di archeologia scopre lo stesso segreto e viene ucciso da un inviato di Vega per assumerne le sembianze. L'attacco al Centro viene sviato da Actarus che percepisce, grazie alla sua ferita, le emissioni di energia protonica. Inseguendo i mostri-lupo trova il veghiano e lo uccide. La sorella del giovane archeologo ne trova il corpo e crede che sia Goldrake il colpevole. Per vendicarsi gli invia contro i tre mostri grazie alla frusta di comando che trova in mano al cadavere. Goldrake riesce a sconfiggerli e a spiegare la verità alla ragazza.

Un piccolo meteorite cade sulla terra ma si divide prima di toccare il terreno. Mizar lo vede col suo nuovo telescopio e avvisa il centro. Ma non viene dato peso alle sue parole. Intanto Procton ha costruito la Trivella Spaziale e la fa collaudare ad Alcor, che sorvolando il punto d'impatto di uno dei due frammenti del meteorite, viene investito da un raggio e precipita. Andato in perlustrazione scopre che il meteorite conteneva uova di formiche spaziali che con le esalazioni di zolfo sono diventate gigantesche. Tornato al veicolo avvisa il centro e Actarus interviene. Ma è una trappola infatti Vega invia un mostro e attiva anche il secondo gruppo di formiche che attaccheranno il centro. Grazie all'insistenza di Mizar Procton scopre il piano e Godrake e gli altri distruggeranno tutti i nemici generando, grazie alla trivella spaziale, un'eruzione che incenerirà tutte le formiche.

Alcor invita Venusia a Maryland, un parco acquatico, per un po' di svago, alla quale si uniscono anche Mizar e Rigel. Al parco tuttavia i veghiani catturano Alcor per interrogarlo, inoltre vogliono prendere in ostaggio gli invitati alla piscina. Rigel scopre l'inganno e mette in allarme Venusia, che, a sua volta, informa Procton. Localizzato il posto in cui viene tenuto Alcor, Venusia cerca di liberarlo, riuscendovi con l'aiuto di Actarus, sopraggiunto nel frattempo. I veghiani inviano quindi un disco mostro, ma Goldrake, rientrato, esce col suo disco e lo sconfigge.

Actarus, Alcor, Venusia, Rigel e Mizar vanno in campeggio in riva a un lago, nel frattempo i Veghiani organizzano un nuovo piano, inviando sulla terra le proprie truppe assieme al servizio segreto in veste di moto-teppisti, che cerca di provocare Actarus e gli altri, mentre sott'acqua si compone un temibile disco mostro. Actarus e gli altri si allontanano dal lago, ma Alcor torna verso il lago ad affrontare i teppisti che infastidiscono due ragazze, riuscendo ad allontanarli solo con l'aiuto di Actarus. Nel frattempo il centro viene bombardato da missili, Goldrake e Venusia rientrano ed escono per il contrattacco. Alcor li vede in volo e rientra alla base per recuperare la trivella spaziale ed attaccare la base nel fondo del lago dei veghiani; col suo aiuto Goldrake e Venusia riescono a sconfiggere il mostro.

I veghiani inviano sulla terra un disco mostro che si rintana sotto una montagna e attira Goldrake e gli altri per poi farli cadere in un pozzo senza fine; tuttavia grazie a Venusia rimasta all'esterno della montagna riesce a impedire il peggio; il veghiano quindi col suo disco mostro cerca di far sprofondare la base intera, mentre Goldrake viene distratto da una serie di minidischi ed Alcor e Venusia vanno ad affrontare il mostro. Venusia viene abbattuta, ma Goldrake nel frattempo raggiunge Alcor ed insieme sconfiggono il nemico.

Sulla base Skull Moon si verifica una tremenda esplosione e un mostro spaziale impazzito sfugge al controllo di Vega dirigendosi verso la Terra. Actarus interviene per fermarlo, ma durante lo scontro perde conoscenza. Il mostro spaziale dopo aver seminato il panico lungo la costa del Pacifico, si dirige verso le montagne, abbattendo l'abitazione di un anziano signore che vi abita con la nipote, Maria. L'uomo rivela alla ragazza che lei non e' una terrestre, ma una principessa del lontano pianeta Fleed e le fa promettere che strapperà Goldrake dalle mani di quelli che lui crede essere i malvagi veghiani...

Maria inizia l'addestramento per pilotare la Trivella Spaziale e dimostra subito di avere delle capacità eccezionali, oltre allo straordinario potere di presagire gli eventi, caratteristica di alcuni abitanti di Fleed. Nel frattempo Gandal e Zuril sono giunti alla conclusione che per sconfiggere Goldrake è necessario sbarazzarsi dei veicoli spaziali che lo spalleggiano e decidono perciò di eliminare Koji. Inviano dunque sulla Terra tre spie, che nottetempo si introducono nella fattoria, ma Koji e Actarus, messi in guardia da Maria, sventano il loro piano. Le malvagie aliene però non si danno per vinte, e nascondono un micidiale ordigno sotto la sella del cavallo col quale Koji parteciperà alla competizione che si tiene ogni anno...

Alcuni corpi celesti della nebulosa di Vega, contaminati dalle radiazioni vegatron, hanno cominciato a collassare e Re Vega decide di deviare l'orbita di uno dei pianeti in modo che raggiunga l'atmosfera terrestre. Ben presto sulla Terra iniziano a verificarsi strani fenomeni meteorologici, dovuti all'attrazione gravitazionale esercitata dal pianeta alieno. Il professor Procton si rende conto dell'imminente pericolo: se il pianeta dovesse raggiungere l'atmosfera terrestre, per la razza umana sarebbe la fine! Decide dunque di lanciare un missile per distruggere il micidiale corpo celeste e anche Actarus entra in azione, deciso a impedire ai veghiani di abbattere il missile prima che questo raggiunga il suo obiettivo. Goldrake viene pero' individuato, e Gandal gli invia contro un terribile mostro spaziale...

Re Vega, su consiglio del ministro della difesa Dantos, abbandona il suo pianeta, ormai contaminato dalla radioattivita', e si reca sulla base lunare Skull Moon. La conquista della Terra e' ormai la sola speranza per la sopravvivenza dei veghiani e Dantos assicura al malvagio sovrano che grazie ai suoi cyborg riuscira' a sconfiggere Goldrake. Nel frattempo Zuril e Gandal, per non perdere la faccia di fronte al loro re, decidono di inviare il piu' potente mostro spaziale a loro disposizione per avere ragione dei terrestri prima dell'arrivo di Re Vega, ma il loro tentativo fallisce. Intanto la misteriosa capsula inviata da Dantos giunge sulla Terra, e ne esce King Gori, un enorme mostro simile a un gigantesco gorilla!

Koji trasporta Goldrake, danneggiato da King Gori, alla Base Scientifica, mentre Actarus, aiutato da Maria, riesce a portare in salvo Venusia. Nel frattempo Dantos, dopo i fallimenti di Zuril e Gandal, viene scelto da Re Vega per dirigere le operazioni di attacco e si reca sulla Terra per poter impartire piu' efficacemente gli ordini al cyborg King Gori. Il potente mostro di Vega si dirige deciso verso la Base Scientifica, nonostante gli sforzi di Actarus e degli altri per arrestare il suo cammino. King Gori distrugge le armi della Base, ma Goldrake e' stato finalmente riparato, e Actarus, Koji, Venusia e Maria entrano in azione. Gandal e Zuril pero' non sono disposti a lasciarsi soppiantare da Dantos, e riescono a fare in modo che i terrestri scoprano la sua astronave e la attacchino...

Re Vega ordina a Gandal e Zuril di installare una base sulla Terra, cosi' da poter attaccare con maggiore facilita' i terrestri. Il luogo prescelto e' una fossa oceanica al largo del Giappone, e Gandal invia sulla Terra un Mostro di Vega e dei minidischi in modo da creare un diversivo che gli consenta di effettuare indisturbato il trasporto dei materiali necessari alla costruzione della base. Il Mostro di Vega si rivela un avversario molto potente, in grado di tenere testa a Goldrake e agli altri veicoli spaziali, ma Actarus, grazie anche all'aiuto di Koji e Maria, riesce infine a distruggerlo e a spazzare via le installazioni dei veghiani...

Re Vega affida a Zuril il comando per la costruzione della base sottomarina ma Gandal non è disposto a lasciarsi mettere in disparte e, a sua insaputa, invia contro la Base Scientifica un mostro di Vega. Il mostro viene avvistato da Rigel, che informa del pericolo il professor Procton....

Grazie all'invio di un satellite spia, Procton riesce a scoprire dove si trova alcune tracce degli alieni sulla terra, Goldrake e gli altri vanno subito sul posto per poter rintracciare i veghiani danneggiando gravemente un deposito materiale. Vega minaccia Gandal e Zuril, dandogli un ultimatum per la realizzazione della base, nel frattempo Procton, scortato da Alcor, Maria e Venusia, va in Svizzera per chiedere la collaborazione dei terrestri ed inviare in orbita da ogni città satelliti spia coi quali prevenire gli attacchi nemici, ma il nemico lo precede e Zuril e Gandal preso in ostaggio il rappresentante della Svizzera lo sostituiscono ed in riunione all'ONU il suo sostituto lo accusa di voler conquistare il mondo. Un mostro attacca quindi la sede ONU, così Goldrake raggiunge gli altri e iniziano un combattimento contro gli alieni; nel frattempo l'impostore riesce ad avere la meglio e convince i membri ONU a non sostenere il piano di Procton. Sconfitto il mostro, Procton e gli altri intuiscono il complotto ma ormai è troppo tardi.

Zuril, recatosi a Tokyo per mettere in atto un diabolico piano per distruggere la citta', si imbatte in Kiyoshi, un bambino triste e solo il cui unico compagno di giochi e' un piccolo scarabeo. Il malvagio ministro delle scienze decide di sfruttare la rabbia oscura che si annida nell'animo di Kiyoshi per far sì che questi impartisca degli ordini a un terrificante mostro di Vega...

Zuril e Gandal decidono di attirare Goldrake fuori dall'atmosfera per poi bloccarlo nello spazio grazie a delle micidiali meteoriti magnetiche che ne paralizzano i circuiti. Inviano dunque sulla Terra un Mostro avente le sembianze di Goldrake che inizia a distruggere le città, prendendo così alla sprovvista Koji, Venusia e Maria sorpresi dall'atteggiamento di Actarus...

Il comandante Dageer convince cinque giovani veghiani ad eliminare il malvagio e spietato Duke Fleed. Raggiunta la Terra e impossessatosi dell'aeroporto militare Fuji, i cinque veghiani prendono in ostaggio Procton e Maria. Actarus, cerca di far capire ai cinque ragazzi di essere vittime di un inganno, ma Dageer, a bordo di un Mostro, attacca Duke Fleed, finendo per uccidere uno dei ragazzi!

Mentre Koji e Maria intensificano le ricerche della base sottomarina di Vega, il Ministro Zuril, fa iniettare un esplosivo al vegatron in migliaia di topi e lancia un ultimatum ai terrestri, arrendersi alle forze di Vega ed evitare la distruzione della torre e della stazione di Tokyo. Nessuno sospetta dei congegni a ultrasuoni che attireranno i micidiali topi esplosivi! La torre viene fatta esplodere, ma Actarus, riesce a comprendere la tattica del nemico!

Avvalendosi di 4 soldati speciali, tra cui un mutaforma, Zuril invia i primi 3 a raccogliere informazioni alla base terrestre, quindi fa attirare Rigel fuori dalla base con un cavallo mostro, per poi sostituirlo col quarto soldato speciali, che prende le somiglianze del padre di Mizar. I tre soldati speciali tornano quindi da Zuril ed iniziano uno scavo per portarsi vicini al centro energetico della base terrestre e distruggerlo; nel frattempo il finto Rigel insospettisce Mizar che mette in allarme gli altri ma non gli credono. Poco dopo Alcor e Maria trovano Rigel svenuto ai piedi di una scarpata che gli racconta dell'attacco. I veghiani nel frattempo raggiungono il centro energetico e riescono a distruggerlo, Procton mette in allarme Actarus e gli altri che escono per affrontare il nuovo mostro meccanico ed una serie di minidischi, riuscendovi.

Mizar e Rigel trovano un cigno ferito dentro un cespuglio, l'animale faceva parte di un gruppo di animali equipaggiati di missili vegatron miniaturizzati con cui Zuril e Gandal mettevano a punto un nuovo piano, facendo appostare una serie di cigni esplosivi vicino alle uscite di Goldrake e attirandolo all'esterno con un mostro meccanico. Vedendo l'animale sofferente, Mizar e Rigel chiedono aiuto a Procton, il quale, dopo averlo esaminato, trova il missile miniaturizzato e intuisce il piano nemico, così, una volta che il mostro raggiunge Tokyo, Goldrake attira dietro a se i cigni, mentre Alcor e le altre vanno a combattere col mostro e i minidischi; poco dopo Actarus li raggiunge e sconfiggono i nemici.

Il comandante Shira è riuscito a inventare un nuovo liquido congelante in grado di congelare qualunque cosa all'istante allo scopo di salvare il pianeta Vega in fiamme, tuttavia il Re la invia sulla terra per usare la sua invenzione contro Actarus e gli altri. Giunta sulla terra col suo disco, viene tuttavia abbattuta, così Actarus e gli altri la portano alla base per ricevere le cure dovute. Poco dopo Actarus e Venusia vanno a perlustrare il disco del comandante e Actarus, una volta entrato, resta prigioniero del mezzo. Poco dopo sopraggiungono anche Shira, Maria e Alcor, Shira apre il portellone ma vuole comunque uccidere Goldrake come da ordini di Re Vega, ma l'amore fraterno di Maria la mette in crisi, così Actarus riesce a ferirla ed a schivare l'attacco della donna. Sul posto arriva un mostro meccanico e Goldrake, tornato sul robot lo affronta, nel frattempo Shira riparte col suo disco disobbedendo agli ordini di Vega e provando a mettere a punto l'ultimo esperimento della sua vita.

Zuril mette a punto un nuovo tipo di bomba a raggi Vegatron e Gandal invia un mostro meccanico con la bomba al centro di Tokyo, quindi invita Procton a consegnargli Goldrake, pena la distruzione della capitale del Giappone, mentre Actarus e gli altri, che non son riusciti a bloccare il mostro prima, stanno a guardare. La squadra decide di combattere ugualmente nonostante il pericolo che riescono ad abbattere il mostro che proteggeva la bomba ed allontanare quest'ultima da Tokyo, tuttavia Actarus nell'allontanare la bomba viene ferito nell'esplosione.

Per mezzo di una serie di attacchi missilistici, i veghiani riescono a far avvicinare il comandante Sator nei pressi di un deposito di uranio, facendolo proprio sotto il naso di Alcor, il cui tentativo di intercettare il missile responsabile fallisce miseramente, facendogli invece distruggere la casa di alcuni civili. Procton intuisce il piano nemico e Alcor, indispettito dell'insuccesso, va in cerca dei nemici atterrati col missile, i quali cammuffatisi da campeggiatori cercano di entrare nella base attraverso il fiume. Alcor li scopre e avvisa Actarus e gli altri. Goldrake li intercetta e li abbatte tutti eccetto il comandante Sator, che riesce a ritornare al suo disco ed a far intervenire un mostro meccanico col quale combattere con Goldrake e gli altri. Maria raccoglie Alcor con la Trivella Spaziale, il quale, sostituendola alla cloche, sconfigge il nemico.

A causa di un forte terremoto una base di comunicazione veghiana viene alla luce, così Zuril e Gandal mandano un mostro a distruggerla prima che cada nelle mani terrestri, il mostro affonda un mercantile, il quale mette in allerta la base terrestre; Alcor e Maria partono in avanscoperta e Maria, inabissatasi per controllare viene imprigionata da alcune alghe mostruose. Alcor la va a liberare riuscendovi nonostante l'intervento dei mezzi di difese nemici, incluso il mostro. Rientrati alla base con l'aiuto di Venusia, i tre, Procton e Actarus intuiscono l'uso che facevano della base i veghiani, ma prima di inviare Goldrake decidono di inviare una telecamera ad esplorare meglio il posto, con la quale individuano la base veghaina, cadendo nell'esca gettata da Zuril che vuol tendere un'imboscata a Goldrake. Actarus e Venusia, col Delfino Spaziale, partono in missione, combattendo egregiamente ma finiscono per restare bloccati sotto un gruppo di macigni gettati dal mostro meccanico. Gettando i motori a tutta potenza in un tentativo disperato, Actarus e Venusia riescono a liberarsi dal fondale marino, gettando il mostro nel vulcano dell'isola vicino.

In vista del nuovo piano per attaccare i terrestri, Zuril rifiuta l'appoggio di Re Vega per via del suo orgoglio e invia un gruppo di palloni aerostatici a bombardare la base terrestre, Actarus e gli altri rientrano alla base, Alcor, Maria e Venusia vanno ad abbattere i palloni, quindi Actarus si unisce a loro all'arrivo di un gruppo di minidischi, dopo averli abbattuti, Goldrake e Venusia inseguono la nave da cui sono usciti i minidischi, cadendo in un'imboscata di due mostri meccanici, dalla quale riesce a scappare miracolosamente. Forti del fatto che Goldrake non possa scendere a una profondità superiore ai 400m, Zuril procede ad un attacco missilistico per attirare Goldrake in mare o - in alternativa - distruggere la base, nel frattempo Procton e gli altri scienziati cercano di terminare i lavori al Battiscafo Cosmico col quale Goldrake potrà scendere in profondità e combattere ad armi pari coi nemici. Alcor e Maria escono per difendere il laboratorio dall'attacco missilistico, ma Alcor viene catturato e Zuril ricatta Goldrake. Alcor riesce a liberarsi dalla presa degli uomini di Gandal e afferrata la radio avverte Goldrake della trappola sulla vera base nemica situata a 1000m sotto il livello del mare, profondità che Goldrake potrà raggingere col nuovo mezzo. Scovata la vera base nemica, Goldrake la distrugge e recupera Alcor, uscito dalla base ad attenderlo c'è Zuril che, separatosi da Gandal, lo attacca con i due mostri meccanici ma viene sconfitto.

A young man from Freed named Kane is a loyal soldier of the Vegans. He comes to Earth to fight. Maria tries to face him and they both crash. Soon she will realize that Kane was her childhood friend from Freed.

Gandal e Vega inviano il figlio di Zuril a recuperare suo padre, nella fuga dalla Terra l'astronave viene danneggiata da Goldrake e il figlio di Zuril decide di far distaccare la parte anteriore dell'astronave di Zuril per farli scappare, nel frattempo lui resta con un mostro meccanico ad affrontare Goldrake per permettere a suo padre di scappare. Goldrake, scoperta l'identità del suo avversario, cerca di farlo ragionare, ma il figlio di Zuril decide di sacrificarsi, mentre suo padre piange la sua decisione.

Sfruttando il re Fleed in propria prigonia, i veghiani fanno assumere le sue sembianze ad un proprio soldato e lo mandano contro i terrestri a bordo di un mostro meccanico, tutto per far cadere in trappola Maria, la sorella di Actarus, la quale, attraverso visioni telepatiche, inviategli prima da Lady Gandal poi sorte dalla sua mente stessa, cade nel tranello e, dopo la ritirata del mostro, decide di andare con Alcor in perlustrazione nel punto in cui è scomparso, trovando il falso re Fleed che tuttavia non riesce a ingannare Alcor, così rientra nel mostro di Vega e va ad affrontare Goldrake, sopraggiunto all'ultimo.

Il comandante Marcus torna da Vega ferito dopo una pericolosa missione, il perfido sovrano veghiano, sicuro che il lavaggio al cervello riservatogli tempo prima abbia ancora effetto, lo invia sulla terra col suo robot col compito di distruggere Goldrake. Nello scontro, Goldrake riesce a far svanire l'effetto del lavaggio al cervello dell'amico, il quale, dopo aver guarito Goldrake, decide di andare in missione suicida per tentare di uccidere Vega, perdendo tuttavia la vita.

In fuga da un pianeta in rivolta, la principessa Rubina, figlia di Vega, raggiunge la base veghiana in assedio alla terra. La ragazza, innamorata di Goldrake, comunica al padre che sul pianeta Fleed sta tornando alla vita ed invita il padre a desistere dai suoi piani di conquista, tuttavia questi sembra irremovibile, anzi affida il destino riguardante sua figlia al Ministro Zuril, promettendogliela in sposa. Rubina decide quindi di scendere sulla Terra per raggiungere Goldrake, mentre Zuril è deciso a usarla come esca per far cadere Goldrake in una nuova trappola, ma già il re Vega è contrario. Rubina e Goldrake si incontrano e parlano dei tempi passati, quando all'improvviso Zuril attacca Goldrake mandandolo in confusione e costringendolo alla fuga, avvenuta grazie all'intervento di Alcor, sopraggiunto con il Goldrake 2. Rubina prova nuovamente a chiamare Goldrake fuori dalla base terrestre, questi, di nascosto, nonostante la poca fiducia nei veghiani, decide di andare nuovamente a parlarle, cadendo in una nuova trappola del ministro Zuril. Rubina lo salva e Zuril alzatosi in volo abbatte la sua astronave. Goldrake si lancia col suo disco per evitare che quello della ragazza si schianti ed aiutato da Alcor e Maria la riesce a mettere in salvo, mentre l'astronave di Zuril viene gravemente danneggiata; il ministro veghiano con un ultimo sforzo in un attacco kamikaze cerca di coinvolgere Goldrake e la ragazza in un'esplosione, venendo tuttavia abbattuto. Rubina muore tra le braccia di Actarus, Zuril tenta un'ultima volta di ucciderlo, ma Alcor lo salva sparando al ministro nemico, uccidendolo una volta per tutte.

Ormai la battaglia finale si avvicina e Actarus riflette malinconicamente sull'andare da solo ad affrontare lo scontro con la base veghiana, Alcor tuttavia capisce il suo intento e cerca di fermarlo dal sacrificarsi; dopo aver fatto ragionare Actarus, ai limiti dell'atmosfera, vengono tuttavia raggiunti da un mostro veghiano con ai comandi Lady Gandal, che danneggia gravemente il Goldrake 2 ed abbaglia Actarus, il quale riesce a salvare Alcor dallo schiantarsi e si prepara allo scontro.

Unendo le forze con i suoi amici, Goldrake riesce ad abbattere Lady Gandal ed il suo mostro, quindi rientra alla base insieme ad i suoi amici, nel frattempo Lady Gandal, ripresasi, acquista il controllo di Gandal e cerca di uccidere Re Vega per ottenere salva la vita, non credendo più nel successo d'invasione terrestre, tuttavia Gandal riesce a riacquistare il controllo del proprio corpo e dopo averla uccisa - ferendosi a sua volta a morte - scende sulla terra per un attacco kamikaze ai danni di Goldrake, per redimersi agli occhi di Vega in un ultimo atto di fede, fallendo tuttavia l'attentato. Vega fa distruggere la base lunare e prepara il suo esercito all'attacco finale, nel frattempo Procton ha terminato i lavori al Cosmo Speciale, un nuovo veicolo terrestre per supportare Goldrake nell'ultima battaglia. Lo scontro si fa duro per i veghiani ed alla fine Goldrake riesce ad avere la meglio su Re Vega. Terminato lo scontro, Actarus e Maria decidono di tornare sul pianeta Fleed ormai ritornato verde.