Le NCIS questionne une femme qui a volé des informations sur des cartes de crédits. Il s'avère que parmi les numéros de cartes en sa possession, l'un d'eux est répertorié comme appartenant à un homme signalé comme terroriste. Le NCIS découvre alors que cette femme est un agent du Mossad. Gibbs enquête sur la mort de trois passeurs au large de la côte de Floride. Les contrebandiers semblent avoir un rapport avec la présence de cette femme ainsi que d'autres agents du Mossad qui sont aux Etats-Unis pour une conférence. Gibbs découvre que des terrorristes sont en ville pour assassiner le directeur du Mossad, David Eli, le père de Ziva...

Les agents du NCIS ont découvert le corrs de Amit Hadar, qui travaille pour le Mossad. Vance veut à tout prix que le directeur de l'agence d'espionage israéliene, Eli David, soit localisé. Vance et Eli David se connaissent bien. Ils se sont rencontré pour la première fois en 1991, lorsque Vance avait été envoyé en mision à Amsterdam pour saboter une opération russe. A l'époque, Eli David avait fourni à Vance des informations capitales, qui lui avaient permis d'éviter un piège. Aujourd'hui, Tony pense que McCallister, un ancien agent du NCIS, était à l'origine du traquenard organisé pour nuire à Vance. La cible russe de Vance était payée par McCallister...

Pendant sa pause matinale habituelle dans un café, Gibbs échappe de près à la mort lorsqu'un homme lui tire dessus. Toute son existence repasse alors devant ses yeux ainsi que les personnes importantes de sa vie comme sa première épouse, Shannon, ou sa mère qui lui font repenser aux choix déterminants qu'il a faits par le passé. Parallèlement, l'enquête sur un double meurtre commis sur un navire suit son cours.