Lorsque son nouvel époux Victor disparaît, Diane contacte ses ex-maris Gibbs et Fornell. Tout semble indiquer qu'il a été enlevé. La collaboration se révèle délicate entre les deux anciens rivaux et leur ex-compagne, qui semble ne pas avoir enterré la hache de guerre. Les recherches d'Abby prouvent que Victor a utilisé son badge en pleine nuit pour se rendre dans les locaux de la Sécurité intérieure.

Le NCIS met en scène le faux assassinat du secrétaire d'Etat de la marine pour trouver l'identité d'un maître chanteur qui s'en prend à la Navy depuis longtemps. Les choses se corsent lorsqu'un témoin-clé est assassiné. Les soupçons se portent sur Philip Wickes, un des amis du secrétaire d'Etat. Gibbs collabore avec Samantha Ryan dans cette affaire. L'équipe s'interroge sur la nature de leur relation…

Un incident macabre survenu lors de la soirée de révélation du sexe d'un quartier-maître de la marine conduit le NCIS à l'affaire de la disparition d'un professeur, popularisée par un podcast sur les crimes réels.

L'équipe du NCIS vient en aide à Torres lorsque celui-ci confronte l'homme qui a maltraité sa famille quand il était enfant.

Le corps d'un marine est retrouvé avec des blessures sortant de l'ordinaire. Pour résoudre son meurtre, les agents du NCIS décident de se plonger dans le monde des théories du complot, en commençant par celles sur les OVNI.