Toute l'équipe est mobilisée pour retrouver Harper Dearing, PDG d'une multinationale devenu terroriste, qui a fomenté les différentes attaques dont la Marine a été la cible. Gibbs va interroger celui qui le remplace à la tête de l'entreprise. Les choses se compliquent lorsqu'un micro miniature est trouvé dans une dent de l'agent Dorneget. Abby découvre que Dearing lui-même a déposé le brevet de ce type de mouchard.

Le directeur Leon Vance a été enlevé alors qu'il rentrait chez lui et toute l'équipe est à sa recherche. Il finit par se réveiller dans un cercueil à côté d'un cadavre calciné sans avoir aucun souvenir des événements. Gibbs continue ses recherches sur la vie et le tempérament de Harper Dearing pour mieux comprendre ses motivations. Parallèlement, le mariage de Jimmy approche et la présence des membres de l'équipe semble compromise.

Après l'explosion du quartier-général du NCIS, chacun tente de retrouver ses esprits. Alors que Ziva et DiNozzo se retrouvent ensemble enfermés dans l'ascenseur, McGee ne réalise même pas qu'il a été blessé à l'abdomen. De son côté, Palmer est au chevet du Dr Mallard, hospitalisé à la suite de son arrêt cardiaque. Pendant ce temps, Gibbs et son commandement cherchent le moyen de neutraliser définitivement Dearing.