Au cours d'une réunion de travail, le NCIS découvre que la secrétaire à la Navy a un stylo dans lequel a été dissimulé un mouchard. Ellie Bishop, analyste à la NSA, avait imaginé une menace similaire dans un rapport écrit deux ans plus tôt. Gibbs pense que les pirates suivent la méthode de la jeune femme et lui demande donc de collaborer à l'enquête. Son style très personnel sème le trouble au sein de l'équipe.