Un caso investigado por Gibbs y todo su equipo del NCIS sobre la muerte accidental de un asesino cambia drásticamente cuando una evidencia revela que un teniente de la Marina falleció en extrañas circunstancias: fue forzado a sobre hidratarse. Mientras tanto, Gibbs conoce al nuevo amor de Ducky.

El equipo del NCIS se encargará de investigar el caso del comandante de la Marina James Barnway, al que le encuentran con un disparo en el abdomen. El equipo del NCIS comprobará que el comandante se encontraba con una mujer rubia misteriosa. Para su sorpresa, la sospechosa es una exagente del NCIS: EJ Barret, que terminará por reincorporarse al equipo.

Un caso golpea de cerca al equipo. El principal sospechosos del asesinato de un suboficial de la Marina estadounidense es el cuñado del director Vance, el hermano menor de su mujer Jackie.

El cuerpo del encargado de una instalación del NCIS aparece cuatro meses antes de las explosiones, lo que lleva al equipo de Gibbs a investigar las causas de esta misteriosa muerte. Al mismo tiempo, el equipo recibe la orden de someterse a una evaluación psicológica con un consejero de la Marina.

El equipo investiga el secuestro de una adolescente mientras Ziva y Abby intentan proteger a su amiga, testigo del suceso.

Una investigación golpea de cerca al equipo y se convierte en algo más que personal.

La mujer de un marine asesinado en Afganistán pide al equipo que realice su propia investigación.

Ziva sigue la pista de Bodnar hasta Berlín.

Después de que una misteriosa enfermedad afecte a los niños de familias militares, Gibbs y el equipo investigan la causa. Mientras tanto, Abby y Jimmy colaboran con el Centro de Investigación Médica Naval para determinar la cepa de la enfermedad, todo con la esperanza de ofrecer una cura antes de las vacaciones. Además, el Director Vance lucha con el perdón cuando su suegro distanciado hace una visita sorpresa a su casa.

Después de que un Oficial de la Marina es encontrado muerto en un camino rural, el equipo del NCIS debe determinar si el asesinato fue el resultado de una pelea en un bar, o porque sabía demasiado sobre el ataque a una Oficial compañera. Mientras tanto, DiNozzo y McGee comienzan una limpieza a base de zumo para purgar sus cuerpos de impurezas.

Gibbs y McGee viajan a Rusia para escoltar a un ingeniero informático del NCIS que tiene conexión con una información clasificada. Pero su misión se ve comprometida y se ven obligados a salirse fuera de la red mientras son perseguidos por un grupo de mercenarios rusos. Mientras tanto, el equipo de D.C. utiliza frenéticamente cada contacto activo e inter-agencia que tienen en un intento de localizar a los miembros desaparecidos.

Estando aislados en el aeropuerto Dulles, debido a las inclemencias del tiempo, DiNozzo, Bishop y su marido Jake trabajan un caso del NCIS que implica una amenaza terrorista en los aeropuertos del noreste durante la oleada de viajes de Acción de Gracias.

El Agente Especial Ned Dorneget de operaciones cibernéticas del NCIS ayuda al equipo cuando un alférez de la Marina que trabajó en la Oficina de Inteligencia Naval es asesinado. Además, el equipo descubre que Jake y Gibbs se han convertido en buenos amigos.

Gibbs lucha por su vida luego de que Luke le disparara a quemaropa. Mientras tanto, el agente Dinozzo junto a la madre de Dorneget, Johanna, van en busca del lider de "EL LLAMADO".

Insurgentes en Sudán atacan a un grupo de médicos voluntarios de los Estados Unidos, algunos fueron secuestrados y otros asesinados. En medio del ataque uno de los médicos pide ayuda a un agente de NCIS en Sudán y esta noticia llega hasta Washington donde el equipo de Gibbs toma el caso. NCIS decide salvar a los médicos secuestrados y en medio de todo esto, DiNozzo se reencuentra con su ex novia Jean Benoit, cuyo marido está entre los médicos quienes fueron atacados.

Durante una investigación del NCIS, Palmer va junto a un extraño en el reborde exterior de un edificio, en un intento de salvar su vida.

McGee descubre su piso destrozado por un ladrón que intentaba encontrar un objeto de gran valor, escondido en algún lugar por el criminal convicto que vivía allí antes. Mientras, la congresista Flemming intenta convencer al director Vance para que haga carrera política.

El estrés por la boda inminente entre McGee y Delilah llega al límite cuando Delilah es ingresada en el hospital. Mientras, el quipo de NAVY viaja al mar cuando un joven y sano oficial a bordo de un destructor de la marina, muere mientras duerme.

NCIS es llamado para investigar cuando el cuerpo de un teniente de marina que desapareció hace un año y medio es localizado por los empleados del cementerio mientras están reubicando ataúdes en la propiedad.

Gibbs y Ducky están viendo la televisión cuando ven al anfitrión manejando un bastón de guerra de 200 años que podría ser un estar relacionado con un caso sin resolver de hace una década.

Sloane insiste en que un hombre que la retuvo como rehén y la torturó hace años en Afganistán, y que se creía que murió tras su rescate, está vivo y en DC. Además, Vance y Gibbs temen que Sloane esté dispuesta a arriesgar todo para destruir a este hombre.

Después de que un Teniente de la Marina sea encontrado asesinado en su bañera de hidromasaje, el equipo interroga a varias familias en el peculiar vecindario de la víctima. Además, Torres debe enfrentarse a las consecuencias después de una noche volátil con Palmer.

Los planes de vacaciones del equipo se suspenden. Eso es debido a la investigación del asesinato de un veterano de la Marina.

Jimmy se debate entre su familia y el trabajo cuando su suegro, Ed (Larry Miller), le pide manipular pruebas en la investigación de un asesinato. Además, el compañero de póker de Ed, Anthony DiNozzo, ofrece su ayuda en el caso.

The NCIS team investigates the murder of a Marine Sergeant in the States who was hailed as a war hero for his efforts overseas. Also, Gibbs turns to Doctor Grace Confalone for advice after he uncharacteristically unravels and abandons his team at a crime scene investigation.

Después de que el cuerpo de un Teniente de la Marina es encontrado escondido bajo un vehículo de 18 ruedas, el equipo del NCIS rastrea las ubicaciones previas del vehículo para identificar la escena del crimen y el sospechoso. Además, Sloane anima al equipo a sentarse y hablar sobre la reciente reaparición de Ziva.

Gibbs debe enfrentarse a las consecuencias de ayudar a Ziva.

Cuando Kasie y Jimmy son retenidos como rehenes en un restaurante después de que un robo en una joyería falla, intentan mantener a los otros clientes a salvo de los ladrones.

Gibbs y Fornell intentan localizar al líder de una banda de narcotraficantes que suministró drogas a la hija de Fornell. Además, el equipo se ocupa del caso de un cadáver desaparecido de la sala de autopsias del NCIS.

NCIS se sumerge en el competitivo mundo de los camiones de comida después de encontrar a un hombre congelado en la parte trasera de uno.

El NCIS rastrea un portátil robado hasta el tío de un niño, Phineas, antiguo vecino de Gibbs.

Mientras trata de encontrar al asesino en serie que buscaba Gibbs, el equipo de NCIS descubre que otra persona también ha estado rastreando el caso.

El equipo investiga el caso de un reservista de la Marina cuyo cuerpo es encontrado en un coche destrozado en un campo de tiro. Además, Kasie sopesa los pros y los contras de comprar un arma.

Mientras investigan la muerte de un intruso en Quantico, Jimmy y Kasie se ven expuestos a una biotoxina mortal y deben pedir ayuda a la doctora Carol Wilson para encontrar el antídoto.

El NCIS investiga el aparente suicidio de un oficial retirado de la Marina que estaba en el grupo de duelo de Palmer y Knight. Torres recibe una llamada de la agente especial del NCIS Jane Tennant para que vaya a Hawai.

El crossover continúa en NCIS: Hawai'i S01E18 T'N'T (II).

Tras el impactante final de la temporada 19, con el agente especial Alden Parker todavía huyendo con su ex mujer Vivian, el equipo investiga quién de su pasado podría tener una venganza personal contra él con la esperanza de limpiar el nombre de Parker. Con la ayuda de la agente especial Jane Tennant y el especialista en informática Ernie Malick, que se encuentran en la ciudad para reunirse con el director Leon Vance en la preparación de un ejercicio militar mundial, el grupo sigue la pista de su principal sospechoso, el Cuervo.

El crossover continúa en NCIS: Hawai'i S02E01 El dilema del prisionero (II).

Después de que un tirador desconocido provoca el caos en un 5K anual de Acción de Gracias, el tiempo es esencial para el equipo del NCIS para encontrar al culpable. Además, Kasie se une a Knight para el almuerzo de Acción de Gracias en la casa de la hermana de Knight.

Parker se enfrenta a sus emociones cuando un estafador de su pasado aparece como principal sospechoso del asesinato de un oficial de la marina que transportaba opiáceos por valor de millones de dólares.

Cuando se produce un sospechoso asesinato en la sección clasificada del Archivo Nacional, el NCIS debe investigar una serie de encuentros con espías rusos que pueden estar relacionados con el crimen. Además, Jimmy hace accidentalmente una confesión que podría cambiar el curso de su relación con Knight.

Mientras el equipo llora la pérdida de Ducky, los agentes encuentran consuelo trabajando en uno de sus casos inconclusos que involucra a una mujer cuyo padre fue expulsado deshonrosamente de los Marines.