C'est la fête de Thanksgiving et aux urgences, le personnel est en effectifs réduits. Abby vient en aide à une patiente qui pense être atteinte du sida et qui saigne abondamment. Mais soudain, un accident d'hélicoptère a lieu au pied de l'hôpital : tout le monde est aussitôt sur le pied de guerre. Susan Lewis ignore que Chuck, son ex-mari, est impliqué dans l'accident. Le docteur Romano a l'intention de rédiger un rapport sur le docteur Pratt : il continue à harceler Abby avec ses questions médicales complètement dépassées. Par ailleurs, Abby pense sans cesse à Carter, qui est toujours au Congo...

Carter est au Congo depuis plusieurs mois. Il a entamé une relation avec Makemba Likasu, une troublante jeune femme qui travaille avec lui à l'hôpital auprès de patients atteints du SIDA. Makemba est enceinte. Obligé de revenir à Chicago pour s'occuper du domaine de sa grand-mère, Carter confie à Kem qu'il aimerait que leur enfant naisse aux États-Unis...

Carter est de retour à Chicago, accompagné de Kem, qui est enceinte. Son retour à l'hôpital se passe plutôt bien, jusqu'au moment où Abby rencontre Kem. Là, les choses s'enveniment assez rapidement, suffisamment pour que Carter se sente très mal à l'aise. Gallant, de son côté, découvre que sa soeur a eu une aventure avec le docteur Pratt : une révélation des plus difficiles à accepter. Quant à Luka, il annonce au docteur Weaver son intention de repartir pour le Congo, avant de se raviser et de décider de rester à Chicago. Weaver espère qu'il s'agit de l'ultime revirement de son collègue. Entre déboires sentimentaux et problèmes professionnels, le personnel hospitalier ne sait plus où donner de la tête...

Carter emmène Kem au service des urgences afin qu'elle puisse observer les méthodes de travail ; elle obtient ainsi des informations concernant les traitements contre le sida mais finit par ennuyer tout le monde avec ses questions. De son côté, Kerry inaugure officiellement « l'unité de soins Robert Romano pour les personnes gay, lesbiennes, bisexuelles et transgenres ». Elle propose par ailleurs à Susan le poste de chef des urgences, vacant depuis la mort accidentelle de Romano, mais celle-ci refuse et lui annonce qu'elle est enceinte. Chen, qui se trouve en Chine, appelle Pratt pour lui annoncer la mort de sa mère. Sam, enfin, découvre la réputation de séducteur de Luka...

Une famille entière est impliquée dans un terrible accident de la route. Le père et le fils sont grièvement blessés, la mère plus légèrement. La petite dernière a, quant à elle, été transportée dans un autre hôpital. Kerry, Neela, Abby, Morris, Sam et Luka s'occupent des blessés. Luka se confie à Sam et lui raconte son expérience en Croatie. Un peu plus tard, alors que Sam vient proposer à Abby d'aller au cinéma, Susan raconte à celle-ci la demande en mariage de Chuck, qu'elle a refusée. Kem, de son côté, décide de repartir au Congo, où la population a vraiment besoin d'elle. Carter tente de l'en dissuader...

Une famille entière, victime d'une asphyxie à l'oxyde de carbone, est admise aux urgences. Neela, qui est claustrophobe, doit rester enfermée deux heures dans un caisson avec un nouveau-né qui présente des problèmes de santé. Carter s'ennuie de Kem, qui est rentrée en Afrique depuis un mois. Jerry lui propose de communiquer avec elle grâce à une webcam. Quant à Chen, elle est de retour de Chine, car son père est très malade. Il a besoin d'une surveillance médicale 24 heures sur 24. Enfin, le jeune Alex finit par découvrir la relation de sa mère et de Luka. La nouvelle n'a pas l'air de lui plaire. Quand Sam suggère à Luka de freiner un peu leurs ardeurs, ce dernier n'est guère plus enchanté. Le docteur Lawson, de son côté, fait des avances à Elizabeth...

Le docteur Weaver doit affronter le moment le plus pénible de sa vie lorsqu'elle reçoit l'ordre de confier son fils à la famille Lopez. Abby, qui travaille en milieu psychiatrique, essaie d'aider une mère à suivre son traitement contre la drogue. Neela impressionne tout le monde lorsqu'elle vient en aide à un étudiant qui a testé ses expériences sur lui-même. Les relations du docteur Kovac avec Sam et son fils se détériorent : le père du gamin est en effet de retour...

Carter et Kem sont effondrés lorsqu'ils apprennent que le cœur de leur bébé ne bat plus et qu'il sera mort-né. Carter fait de son mieux pour contenir sa peine et soutenir Kem le temps de la délivrance. Dix-neuf membres de la famille de Neela ont fait le déplacement pour assister à la cérémonie de remise des diplômes de l'école de médecine. C'est en effet aujourd'hui qu'Abby, Neela et Lester seront officiellement honorés. De son côté, Steve persévère dans ses efforts pour récupérer Sam et décide de rendre visite à Luka sur son lieu de travail. Quant à Pratt, en pleine remise en question, il a du mal à accepter qu'un de ses patients ait fait un arrêt cardiaque...

Le docteur Pratt est en voiture avec le docteur Chen et Elgin lorsqu'il est pris pour cible par un tireur embusqué. En essayant d'éviter les balles, il perd le contrôle du véhicule, qui finit sa course dans la rivière. Les trois occupants sont piégés sous l'eau. Lorsque les secours parviennent enfin à les sortir de là, ils sont tous les trois dans un état critique. Au County Hospital, Elgin est pris en charge par Abby, qui entame son premier jour. Entretemps, Sam a décidé de changer de vie et part avec Alex, son fils. Aux urgences, le personnel apprend avec surprise le retour de Neela. Quant à Carter et Kem, ils ne parviennent pas à faire face à la mort de leur enfant...

Préparant son départ du Cook County, Carter est impatient de rejoindre Kem en France, mais elle lui apprend qu'elle est complètement accaparée par l'hospitalisation soudaine de sa mère. Démoralisé par ce nouveau contretemps, Carter lui propose alors de reprendre leur relation à zéro et de partir d'un nouveau pied, en Afrique. Mais la jeune femme ne répond pas à sa proposition. De leur côté, malmenés par une série d'événements stressants, Abby, Ray et Neela commettent une série d'erreurs médicales critiques qui mettent la vie de leurs patients en danger. Ils doivent en assumer l'entière responsabilité...