플로일라인 오일레 섬. 그 외딴 섬에는 한 컬트 교단이 정착한다.

루팡 3세는 교주 훌라훌라님이 숨겨 가지고 있는 보물 「훌라훌라의 재」를 노려, 섬에 침입하고 있었다.

그곳에서 루팡은 아름답고도 위험한 여자와 만난다. 그 여자의 이름은 미네 후지코…훌라훌라님의 신부로서 접근해, 역시 비보를 노리고 있는 수수께끼 많은 여자 괴도다. 비보를 둘러싼 미네 후지코와 루팡 3세의 위험한 싸움이 지금, 막을 연다!

고급 카지노. 후지코는 미망인 치치올리나와의 내기에서 지고 만다. 치치올리나는 내기에서 승리한 대가로 후지코에게 어떤 남자의 총을 훔쳐내 그 최후를 지켜보겠다는 의뢰를 한다. 어떤 남자와는 뒷세계에서도 겁내는 저격 0.3초의 천재 총잡이. 일찍이 치치올리나의 남편도 살해했다고 하는 그 남자의 이름은, 지겐 다이스케. 후지코는 총을 겨누고 지겐에 접근하지만...

귀중한 미술품들이 가득 실려 있는 열차에는 아스토리아 공국의 국왕과 손자들이 타고 있었다. 손자의 가정교사 마리아로서 동승하는 후지코의 모습도 있고, 웬일인지 사무라이 차림의 동양인도 있다. 국왕의 손자들과 친하게 지내고 있는 그 사무라이의 이름은 이시카와 고에몬이라고 하며, 실은 아스토리아 공국의 국왕 암살을 의뢰받고 있었다. 그런 가운데, 고에몬도 후지코도 모르는 어떤 계획이 뒤에서 실행되려 하고 있었다….

제니가타에게 체포되는 후지코. 제니가타는 석방의 교환 조건으로서 루팡 체포의 협력을 후지코에게 요구한다. 미리 도착해 있던 루팡의 예고장에 따르면 그가 노리는 것은 오페라 가수 아이얀의 가면. 후지코와 제니가타는 아이얀이 공연을 펼치는 극장으로 향한다. 그 극장에는 유령이 정착해 가면을 노리는 자에게 죽음을 가져온다는 소문이 있다. 그리고 공연 중 마침내 루팡이 모습을 드러낸다. 그런데 갑자기 천장의 조명이 떨어져 아이얀을 덮친다.

루팡은 피라미드에 숨어 있다는 붉은 깃털의 소공작을 후지코에게 선물하기로 약속을 한다. 한편 지겐은 앞으로의 인생 앞이 보이지 않아 막막하기만 했다. 왠지 이집트에 온 지겐은 가진 돈을 몽땅 털리고 어쩔 수 없이 '붉은 깃털의 소공작'을 찾는 일을 하는데. 피라미드에 침입한 지겐은 루팡과 조우. 그리고 두사람은 자연스럽게 총을 겨누고...

목가적인 분위기의 여학원. 이곳의 교사인 미네 후지코는 여학생 모두의 동경과 존경의 대상이었다. 여학생 중 한 명인 이졸데 역시 후지코에 열중했다. 후지코는 그녀의 아버지의 유품인 펜던트를 노리고 있었다. 그 펜던트는 발표되지 않은 환상의 논문을 읽는 아이템이 된다. 후지코는 어른의 매력으로, 이졸데를 농락해 갔다...인것 같았는데!?

중남미의 소국 칼리브. 필라델 케스트가 이끄는 혁명조직이, 신정권을 수립. 국제연합연설로 향하는 필라델에, 져널리스트로서 후지코도 동행한다. 그러나 필라델이 탈 프로펠러기가 구정권 잔당에 의해 납치된다. 이 사건으로 인해 오랫동안 긴장 상태였던 두 초강대국이 크게 흔들려 마침내 제3차 세계대전 발발의 위기가 된다! 그 와중에 후지코는...

북적거리는 온천 거리. 거기에는 루팡과 지겐의 모습이 있었다. 거리에는 전신에 그림이 그려진 여자가 있다고 한다. 그 그림은 천재 화가가 여자의 몸을 캔버스로 그린 것. 루팡, 지겐은 여자를 훔쳐내려 하는데 후지코가 나타난다. 그리고 루팡들과 후지코의 치열한 쟁탈전이 시작된다! 루팡은 후지코의 모습이 평소와 다르다는 것을 알고 있었다. 후지코에게 도대체 무슨 일이...?

자고 있던 루팡의 앞에 올빼미 얼굴을 한 의문의 인물이 나타난다. 그 인물은 예전에 루팡에게 미네 후지코를 훔쳐 달라고 부탁한 노백작의 심부름꾼이다. 왜 그들은 후지코를 원할까? 그리고 그들이 노리는 미네 후지코라는 여자는 도대체 누구인가? 루팡은 그걸 알아보기 위해 노백작에게로 간다. 하지만, 거기에는 제니가타 경부의 모습도 있었다. 노백작이 루팡과 접촉한 목적을 찾기 위해 찾아온 것이다.

엄중한 경비 체제 속에서, 귀중한 보물이 차례차례로 도둑맞는 사건이 발생. 모두 미네 후지코에 의한 범행으로 보인다. 다시 후지코를 자칭하는 범행 예고가 전해져, 제니가타와 오스카가 경비를 맡는다. 수백 명의 경찰을 배치한 완벽한 경비에도 불구하고 또다시 보물은 도둑맞고 말았으니. 그 무렵 고에몬은 설산의 통나무집에 있었다. 왠지 혼란스러워하는 후지코와 함께… 그리고 루팡도 이 불가사의한 사건의 진상을 캐기 위해 나서고...

항간을 떠들썩하게 하는 소녀 유괴 사건. 몸값 목적의 유괴라고 보고 수사가 진행되는 가운데, 후지코만은 눈치채고 있었다. 세계 각지에서 다발하고 있는 소녀 유괴사건은, 장소도 상황도 다르지만, 일련의 사건을 연결시키는 어떤 법칙성이 있다, 라고. 그리고, 그 사건에 관련되는 인물의 이름이 부각된다… 그 인물이란 미네 후지코의 과거를 아는 사람. 후지코는 자신의 과거를 정리하기 위해 어느 곳으로 향하는데...

미네 후지코라는 여자란 누구인지. 그 진실이 이제야 드러난다. 그리고, 기구한 운명에 이끌리듯이, 루팡 3세, 지겐 다이스케, 이시카와 고에몬, 제니가타 경부가 집결한다. 이윽고, 모든 것을 조종하고 있던 흑막이 드디어 모습을 나타낸다…….모든 이야기는 시작이 있고, 끝은 있다. 그리고 어김없이 미네 후지코라는 여자의 이야기도 종말을 맞을 때가 왔다.